More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1221 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1221  transporter, LysE family  100 
 
 		 209 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360927  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4795  lysine exporter protein LysE/YggA  57.97 
 
 		 206 aa  230  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3025  amino acid transporter LysE  58.45 
 
 		 206 aa  224  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0495687 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  53.4 
 
 		 206 aa  223  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.513568 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4701  lysine exporter protein LysE/YggA  53.88 
 
 		 207 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0229835 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2902  lysine exporter protein LysE/YggA  52.66 
 
 		 206 aa  209  3e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2160  lysine exporter protein LysE/YggA  57.49 
 
 		 206 aa  206  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17805  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16960  amino acid transporter LysE  60.44 
 
 		 207 aa  204  6e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0385936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1474  hypothetical protein  59.89 
 
 		 207 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000642  transporter LysE family  48.54 
 
 		 204 aa  202  4e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2246  amino acid efflux pump, RhtB family protein  52.26 
 
 		 222 aa  199  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.747875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2656  lysine exporter protein LysE/YggA  53.54 
 
 		 207 aa  191  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  53.54 
 
 		 207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.071463  normal  0.0626704 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2722  lysine exporter protein LysE/YggA  54.36 
 
 		 207 aa  187  7e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.299821  normal  0.0652266 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5067  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.08 
 
 		 210 aa  148  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0891  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.38 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  37.38 
 
 		 209 aa  138  7e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3023  amino acid efflux protein, putative  51.94 
 
 		 144 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0879148 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  36.59 
 
 		 203 aa  128  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  36.59 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1323  lysine exporter protein LysE/YggA  38.07 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.848324 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  36.59 
 
 		 203 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5994  hypothetical protein  34.93 
 
 		 209 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2480  lysine exporter protein LysE/YggA  33.66 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69310  LysE family efflux protein  34.45 
 
 		 209 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  35.61 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0815  lysine exporter protein LysE/YggA  35.82 
 
 		 204 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  37.91 
 
 		 211 aa  118  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  37.91 
 
 		 211 aa  118  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  36.74 
 
 		 213 aa  118  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  37.91 
 
 		 211 aa  117  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5476  lysine exporter protein LysE/YggA  34.62 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4165  amino acid transporter LysE  34.33 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  35.47 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0266  lysine exporter protein LysE/YggA  32.69 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.1 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.85 
 
 		 207 aa  112  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0328  lysine exporter protein LysE/YggA  34.98 
 
 		 210 aa  112  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.872355  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  35.21 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  35.98 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  35.21 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  37.68 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  34.43 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  34.78 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1739  lysine exporter protein LysE/YggA  33.49 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0365796  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4576  lysine exporter protein LysE/YggA  34.63 
 
 		 203 aa  106  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  33.78 
 
 		 222 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  33.78 
 
 		 222 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0222  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 210 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.6 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0219  lysine exporter protein LysE/YggA  34.13 
 
 		 210 aa  104  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0291  lysine exporter protein LysE/YggA  34.92 
 
 		 224 aa  104  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3909  lysine exporter protein LysE/YggA  35.41 
 
 		 210 aa  105  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.806528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.67 
 
 		 206 aa  104  8e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.5 
 
 		 207 aa  104  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0198  amino acid transporter LysE  34.13 
 
 		 210 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0140  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.93 
 
 		 210 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  33.78 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  34.5 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  33.94 
 
 		 218 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  33.96 
 
 		 212 aa  103  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  36.17 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  32.47 
 
 		 213 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  31.07 
 
 		 205 aa  101  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  32.37 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.73 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.88 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  31.88 
 
 		 206 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  31.88 
 
 		 206 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.88 
 
 		 206 aa  99.8  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4452  lysine exporter protein LysE/YggA  32 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000383536 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5514  lysine exporter protein LysE/YggA  36.1 
 
 		 209 aa  99.8  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03652  hypothetical protein  31.88 
 
 		 206 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.88 
 
 		 206 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.88 
 
 		 206 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.88 
 
 		 206 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2876  lysine exporter protein LysE/YggA  32.57 
 
 		 218 aa  99.4  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000054165  unclonable  0.00000000000000325534 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0403  lysine exporter protein LysE/YggA  33.51 
 
 		 211 aa  99.8  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.4 
 
 		 206 aa  99  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4402  lysine exporter protein LysE/YggA  32.23 
 
 		 212 aa  98.6  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.649358  normal  0.816137 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.76 
 
 		 205 aa  98.2  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3625  amino acid transporter LysE  32.99 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5023  lysine exporter protein LysE/YggA  34.54 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.904579 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2108  lysine exporter protein LysE/YggA  32.99 
 
 		 213 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.451447 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3972  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.33 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.422052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0050  lysine exporter protein LysE/YggA  34.45 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4152  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.51 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3117  lysine exporter protein LysE/YggA  34.54 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5250  lysine exporter protein LysE/YggA  34.54 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0593  lysine exporter protein LysE/YggA  33.82 
 
 		 210 aa  95.9  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3276  lysine exporter protein LysE/YggA  32.04 
 
 		 206 aa  95.1  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.667965  normal  0.54958 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.08 
 
 		 204 aa  94.7  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1401  lysine exporter protein LysE/YggA  31.07 
 
 		 204 aa  94.7  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.582865  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3462  lysine exporter protein LysE/YggA  30.5 
 
 		 209 aa  94.7  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.58 
 
 		 208 aa  94  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2802  lysine exporter protein LysE/YggA  29.35 
 
 		 212 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  33.66 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1528  hypothetical protein  30.54 
 
 		 206 aa  94  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0122  amino acid transporter LysE  32.12 
 
 		 207 aa  93.2  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0123  lysine exporter protein LysE/YggA  32.12 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>