More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2902 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2902  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
206 aa  407  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000642  transporter LysE family  56.52 
 
 
204 aa  234  9e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4795  lysine exporter protein LysE/YggA  56.59 
 
 
206 aa  221  9e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2160  lysine exporter protein LysE/YggA  60.49 
 
 
206 aa  216  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17805  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3025  amino acid transporter LysE  56.59 
 
 
206 aa  215  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0495687 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2656  lysine exporter protein LysE/YggA  60.87 
 
 
207 aa  210  9e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4701  lysine exporter protein LysE/YggA  54.63 
 
 
207 aa  209  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0229835 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  53.66 
 
 
206 aa  209  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.513568 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  59.38 
 
 
207 aa  206  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.071463  normal  0.0626704 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2722  lysine exporter protein LysE/YggA  60.73 
 
 
207 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.299821  normal  0.0652266 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1221  transporter, LysE family  52.88 
 
 
209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360927  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2246  amino acid efflux pump, RhtB family protein  50.5 
 
 
222 aa  191  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.747875  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16960  amino acid transporter LysE  60.66 
 
 
207 aa  182  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0385936  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1474  hypothetical protein  60.66 
 
 
207 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3023  amino acid efflux protein, putative  62.1 
 
 
144 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0879148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0891  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.38 
 
 
209 aa  131  6.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  36.89 
 
 
209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5067  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.15 
 
 
210 aa  122  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  36.1 
 
 
211 aa  121  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.06 
 
 
212 aa  119  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4576  lysine exporter protein LysE/YggA  36.84 
 
 
203 aa  118  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2480  lysine exporter protein LysE/YggA  36.67 
 
 
203 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1323  lysine exporter protein LysE/YggA  36.98 
 
 
211 aa  114  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.848324 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.97 
 
 
207 aa  112  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  34.15 
 
 
203 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  33.66 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4165  amino acid transporter LysE  34.78 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0328  lysine exporter protein LysE/YggA  37.93 
 
 
210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.872355  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  33.66 
 
 
203 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0815  lysine exporter protein LysE/YggA  35.96 
 
 
204 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1618  lysine exporter protein LysE/YggA  36.67 
 
 
209 aa  105  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360682  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  35.41 
 
 
212 aa  104  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1739  lysine exporter protein LysE/YggA  32.69 
 
 
208 aa  103  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0365796  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  34.78 
 
 
206 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.68 
 
 
208 aa  99.8  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4402  lysine exporter protein LysE/YggA  33.18 
 
 
212 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.649358  normal  0.816137 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.21 
 
 
208 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  33.33 
 
 
222 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.77 
 
 
208 aa  99  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  32.54 
 
 
211 aa  99  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  33.33 
 
 
222 aa  98.6  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  33.33 
 
 
222 aa  98.6  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  33.82 
 
 
206 aa  96.7  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  34.93 
 
 
208 aa  96.7  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  32.57 
 
 
218 aa  96.3  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  33.96 
 
 
212 aa  95.9  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.71 
 
 
204 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.28 
 
 
211 aa  95.5  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.63 
 
 
213 aa  95.9  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  33.65 
 
 
208 aa  94.7  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  32.23 
 
 
211 aa  94  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  32.23 
 
 
211 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  32.39 
 
 
211 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  33.66 
 
 
206 aa  92  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.33 
 
 
213 aa  91.7  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3909  lysine exporter protein LysE/YggA  31.9 
 
 
210 aa  90.9  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.806528  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.4 
 
 
208 aa  90.5  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  30.99 
 
 
213 aa  90.1  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  31.13 
 
 
212 aa  90.5  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2183  lysine exporter protein LysE/YggA  32.06 
 
 
206 aa  89.4  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.358199 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  32.39 
 
 
211 aa  88.6  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  32.39 
 
 
211 aa  88.6  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  30.57 
 
 
213 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1609  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.02 
 
 
210 aa  88.2  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.127652  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  34.27 
 
 
204 aa  87.8  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3615  lysine exporter protein LysE/YggA  29.85 
 
 
208 aa  88.2  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0587499  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0303  lysine exporter protein LysE/YggA  34.17 
 
 
205 aa  87.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.85144e-16  normal  0.0852573 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4452  lysine exporter protein LysE/YggA  27.94 
 
 
205 aa  87.8  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000383536 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.7 
 
 
208 aa  87.8  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  29.53 
 
 
213 aa  87  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1401  lysine exporter protein LysE/YggA  28.22 
 
 
204 aa  86.7  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.582865  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.88 
 
 
207 aa  86.3  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0236  lysine exporter protein LysE/YggA  28.64 
 
 
214 aa  85.9  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7453  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.44 
 
 
207 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353642  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3290  lysine exporter protein LysE/YggA  27.75 
 
 
206 aa  85.9  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76234  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3276  lysine exporter protein LysE/YggA  31.25 
 
 
206 aa  85.5  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.667965  normal  0.54958 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2876  lysine exporter protein LysE/YggA  29.82 
 
 
218 aa  85.5  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000054165  unclonable  0.00000000000000325534 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2802  lysine exporter protein LysE/YggA  30.05 
 
 
212 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  32.58 
 
 
204 aa  85.1  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  32.58 
 
 
204 aa  85.1  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.25 
 
 
208 aa  85.1  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1470  lysine exporter protein LysE/YggA  31.09 
 
 
207 aa  85.1  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0172  lysine exporter protein LysE/YggA  32.98 
 
 
203 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253668  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3589  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.91 
 
 
211 aa  84.7  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0368885 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0287  lysine exporter protein LysE/YggA  30.19 
 
 
214 aa  84.7  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167258  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3915  lysine exporter protein LysE/YggA  31.22 
 
 
212 aa  84.7  9e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.652927 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1528  hypothetical protein  29.85 
 
 
206 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5476  lysine exporter protein LysE/YggA  30.85 
 
 
210 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0403  lysine exporter protein LysE/YggA  32.57 
 
 
211 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  32.58 
 
 
204 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1365  lysine exporter protein LysE/YggA  32.58 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2688  lysine exporter protein (LysE/YggA)  29.67 
 
 
205 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.666763 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5994  hypothetical protein  32.02 
 
 
209 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  32.37 
 
 
227 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2108  lysine exporter protein LysE/YggA  31.61 
 
 
213 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.451447 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1522  LysE family protein  32.58 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  32.58 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  36.09 
 
 
204 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  36.09 
 
 
204 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69310  LysE family efflux protein  31.53 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>