More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1401 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1401  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 204 aa  399  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.582865  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  47.24 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3980  lysine exporter protein LysE/YggA  49.75 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1476  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.73 
 
 		 205 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.779186  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4137  lysine exporter protein LysE/YggA  47.72 
 
 		 205 aa  168  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0964  lysine exporter protein LysE/YggA  50 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0177449 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4318  lysine exporter protein LysE/YggA  37.31 
 
 		 203 aa  125  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0592644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6543  lysine exporter protein LysE/YggA  42.62 
 
 		 207 aa  124  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.259984 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2082  lysine exporter protein LysE/YggA  39.02 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.295879  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1886  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.44 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259351  normal  0.142425 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7453  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.39 
 
 		 207 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353642  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0367  lysine exporter protein LysE/YggA  38.24 
 
 		 211 aa  118  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  36.71 
 
 		 208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.23 
 
 		 211 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0582  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.68 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0426675 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5581  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.89 
 
 		 212 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.72 
 
 		 211 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8095  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.21 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2300  lysine exporter protein LysE/YggA  35.53 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.735083  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2313  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.53 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00564099  hitchhiker  0.00590082 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2073  lysine exporter protein LysE/YggA  35.53 
 
 		 208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106619  normal  0.299626 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  35.53 
 
 		 208 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1344  putative threonine efflux protein  34.04 
 
 		 205 aa  107  9.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.115554  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1265  lysine exporter protein LysE/YggA  37.25 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0612  RhtB family transporter  35.12 
 
 		 209 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.27 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.67 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.3 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  37.11 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.78 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1421  lysine exporter protein LysE/YggA  36.06 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.05 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0131  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.41 
 
 		 216 aa  102  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0905  hypothetical protein  32.69 
 
 		 208 aa  102  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.772442  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  36.08 
 
 		 205 aa  101  7e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1394  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.97 
 
 		 207 aa  101  8e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2352  lysine exporter protein LysE/YggA  40.12 
 
 		 215 aa  101  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  35.57 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1277  lysine exporter protein LysE/YggA  36.36 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.12 
 
 		 216 aa  99.8  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003307  putative threonine efflux protein  33.65 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  36 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  30.69 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1504  RhtB family transporter  41.52 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.672768 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4795  lysine exporter protein LysE/YggA  31.07 
 
 		 206 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  35.57 
 
 		 204 aa  99.8  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  36.24 
 
 		 203 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1558  hypothetical protein  33.66 
 
 		 206 aa  98.6  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  33.51 
 
 		 208 aa  99  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  31.28 
 
 		 206 aa  98.6  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  35.05 
 
 		 204 aa  98.6  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0593  lysine exporter protein LysE/YggA  31.47 
 
 		 210 aa  98.6  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  33.67 
 
 		 211 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  35.05 
 
 		 227 aa  98.6  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1927  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.08 
 
 		 199 aa  97.8  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  35.57 
 
 		 203 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1618  lysine exporter protein LysE/YggA  34.54 
 
 		 209 aa  97.4  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4030  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.74 
 
 		 230 aa  97.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.852765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  33.54 
 
 		 203 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3909  lysine exporter protein LysE/YggA  36.5 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.806528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.81 
 
 		 204 aa  97.1  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0303  lysine exporter protein LysE/YggA  35.82 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.85144e-16  normal  0.0852573 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  34.12 
 
 		 212 aa  96.7  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0286  lysine exporter protein LysE/YggA  33.18 
 
 		 211 aa  96.7  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  35.57 
 
 		 204 aa  95.9  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1754  lysine exporter protein LysE/YggA  32.83 
 
 		 211 aa  96.3  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.335434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4402  lysine exporter protein LysE/YggA  32.98 
 
 		 212 aa  95.5  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.649358  normal  0.816137 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.95 
 
 		 208 aa  95.1  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  33.18 
 
 		 213 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6172  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.42 
 
 		 211 aa  94.7  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3105  lysine exporter protein LysE/YggA  35.29 
 
 		 207 aa  94.7  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  32.24 
 
 		 208 aa  94.4  9e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.272931  normal  0.707068 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  35.05 
 
 		 204 aa  94.7  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4719  amino acid transporter LysE  31.88 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1221  transporter, LysE family  33.33 
 
 		 209 aa  94  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360927  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.63 
 
 		 207 aa  94  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0867  lysine exporter protein LysE/YggA  33.66 
 
 		 207 aa  94  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.627781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1345  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.5 
 
 		 208 aa  94  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123136  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6435  lysine exporter protein LysE/YggA  30.94 
 
 		 212 aa  94  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  29.9 
 
 		 210 aa  94  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0836  lysine exporter protein LysE/YggA  34.32 
 
 		 207 aa  94  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  32.84 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  35.05 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3462  lysine exporter protein LysE/YggA  32.85 
 
 		 209 aa  93.2  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2480  lysine exporter protein LysE/YggA  34.16 
 
 		 203 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0891  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.92 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.55 
 
 		 208 aa  93.2  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4576  lysine exporter protein LysE/YggA  34.23 
 
 		 203 aa  94  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4577  lysine exporter protein LysE/YggA  36.97 
 
 		 215 aa  92.8  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.499948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  35.05 
 
 		 204 aa  92.8  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  35.05 
 
 		 204 aa  92.8  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  33.65 
 
 		 213 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  34.15 
 
 		 203 aa  92.4  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.21 
 
 		 208 aa  92.4  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1238  lysine exporter protein LysE/YggA  34.98 
 
 		 212 aa  92.4  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0801686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4701  lysine exporter protein LysE/YggA  35.29 
 
 		 207 aa  92  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0229835 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  29.35 
 
 		 210 aa  91.7  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.82 
 
 		 208 aa  92  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2456  lysine exporter protein LysE/YggA  30.15 
 
 		 205 aa  91.7  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010294  normal  0.35895 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>