More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2082 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2082  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 205 aa  387  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.295879  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7453  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  52.68 
 
 		 207 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353642  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6543  lysine exporter protein LysE/YggA  53.76 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.259984 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1476  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.5 
 
 		 205 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.779186  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  40.1 
 
 		 206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3980  lysine exporter protein LysE/YggA  40 
 
 		 205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1265  lysine exporter protein LysE/YggA  42.44 
 
 		 208 aa  129  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4137  lysine exporter protein LysE/YggA  39 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1401  lysine exporter protein LysE/YggA  39.51 
 
 		 204 aa  124  8.000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.582865  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  40.85 
 
 		 208 aa  121  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.96 
 
 		 207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0964  lysine exporter protein LysE/YggA  39.13 
 
 		 205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0177449 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4318  lysine exporter protein LysE/YggA  37.84 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0592644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  36.95 
 
 		 211 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.41 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1470  lysine exporter protein LysE/YggA  37 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  37.56 
 
 		 210 aa  112  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.71 
 
 		 211 aa  112  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.9 
 
 		 211 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0303  lysine exporter protein LysE/YggA  38.05 
 
 		 205 aa  108  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.85144e-16  normal  0.0852573 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  34.78 
 
 		 211 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  33.49 
 
 		 213 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.66 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  33.65 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.87 
 
 		 208 aa  105  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  34.47 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.82 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.01 
 
 		 208 aa  102  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.17 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0891  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.1 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1394  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.08 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.29 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2480  lysine exporter protein LysE/YggA  35.71 
 
 		 203 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1345  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.44 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123136  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 211 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 211 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 211 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 211 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2876  lysine exporter protein LysE/YggA  31.43 
 
 		 218 aa  101  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000054165  unclonable  0.00000000000000325534 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1078  lysine exporter protein LysE/YggA  28.08 
 
 		 204 aa  101  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  35 
 
 		 203 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1558  hypothetical protein  37.64 
 
 		 206 aa  101  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  35.12 
 
 		 215 aa  101  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.13 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  34.15 
 
 		 208 aa  99.8  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3909  lysine exporter protein LysE/YggA  38.15 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.806528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  34.5 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  36.22 
 
 		 209 aa  99.8  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  31.65 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  31.31 
 
 		 218 aa  99.8  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  31.65 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.13 
 
 		 218 aa  99  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  35.2 
 
 		 203 aa  99  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2416  RhtB family transporter  33.01 
 
 		 210 aa  99  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  31.65 
 
 		 222 aa  98.6  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  33.01 
 
 		 203 aa  98.6  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.58 
 
 		 208 aa  98.6  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.37 
 
 		 206 aa  98.6  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 		 208 aa  98.2  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0131  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.83 
 
 		 216 aa  97.4  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  29.06 
 
 		 205 aa  97.4  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0612  RhtB family transporter  36.19 
 
 		 209 aa  97.1  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0367  lysine exporter protein LysE/YggA  33.99 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4795  lysine exporter protein LysE/YggA  34.34 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4074  RhtB family transporter  39.29 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.472652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0929  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.62 
 
 		 209 aa  96.7  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4152  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.94 
 
 		 206 aa  97.1  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  30.56 
 
 		 217 aa  95.5  4e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0220  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.03 
 
 		 206 aa  95.9  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1886  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.36 
 
 		 214 aa  95.9  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259351  normal  0.142425 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2444  lysine exporter protein LysE/YggA  30.88 
 
 		 205 aa  95.5  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3130  lysine exporter protein LysE/YggA  37.43 
 
 		 215 aa  95.5  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.376796 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.57 
 
 		 206 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6435  lysine exporter protein LysE/YggA  35.84 
 
 		 212 aa  95.1  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0815  lysine exporter protein LysE/YggA  34.01 
 
 		 204 aa  95.1  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3290  lysine exporter protein LysE/YggA  30.2 
 
 		 206 aa  94.7  8e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76234  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  36.55 
 
 		 206 aa  94.7  8e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  32.57 
 
 		 206 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  32.57 
 
 		 206 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0582  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 211 aa  94.7  9e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0426675 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  33.01 
 
 		 211 aa  94.4  9e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  33.01 
 
 		 211 aa  94.4  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.57 
 
 		 206 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.57 
 
 		 206 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03652  hypothetical protein  32.57 
 
 		 206 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.57 
 
 		 206 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.57 
 
 		 206 aa  94.7  9e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  33.01 
 
 		 211 aa  94.4  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  33.01 
 
 		 211 aa  94.4  9e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.22 
 
 		 211 aa  94  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.9 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476612  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1618  lysine exporter protein LysE/YggA  33.84 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.25 
 
 		 212 aa  94.4  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  34.69 
 
 		 210 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  34.69 
 
 		 210 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.57 
 
 		 204 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0043  lysine exporter protein LysE/YggA  35.16 
 
 		 210 aa  93.2  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.822659  normal  0.173523 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.01 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4576  lysine exporter protein LysE/YggA  34.87 
 
 		 203 aa  94  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1739  lysine exporter protein LysE/YggA  34.83 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0365796  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>