More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0612 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0612  RhtB family transporter  100 
 
 		 209 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3539  lysine exporter protein LysE/YggA  44.23 
 
 		 216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.439098 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  40.69 
 
 		 211 aa  131  6.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.15 
 
 		 208 aa  128  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.5 
 
 		 211 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.44 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  36.63 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  36.63 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  36.63 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  36.14 
 
 		 204 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  36.14 
 
 		 204 aa  122  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  36.14 
 
 		 204 aa  121  9e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  36.18 
 
 		 227 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  34.6 
 
 		 210 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.15 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  36.18 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  34.6 
 
 		 210 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  35.82 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.38 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  33.65 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  35.15 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.43 
 
 		 218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  35.15 
 
 		 204 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  34.12 
 
 		 210 aa  117  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  35.15 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1031  hypothetical protein  35.44 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.332162  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  35.15 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  34.55 
 
 		 210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.49 
 
 		 218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5581  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.18 
 
 		 212 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  32.52 
 
 		 206 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  36.18 
 
 		 194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2950  LysE family protein  36.18 
 
 		 194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  36.18 
 
 		 194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1522  LysE family protein  36.18 
 
 		 194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  32.21 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0604  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.15 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0141585 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  34.45 
 
 		 215 aa  112  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.38 
 
 		 219 aa  112  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2416  RhtB family transporter  35.16 
 
 		 210 aa  112  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  33.65 
 
 		 210 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1421  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 		 207 aa  112  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02476  hypothetical protein  34.27 
 
 		 211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3385  lysine exporter protein LysE/YggA  32.86 
 
 		 214 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201071 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4114  amino acid efflux pump, RhtB family protein  34.67 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2862  lysine exporter protein LysE/YggA  34.47 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0929  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.64 
 
 		 209 aa  109  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.54 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  34.8 
 
 		 213 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  30.54 
 
 		 210 aa  108  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  32.51 
 
 		 211 aa  108  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  32.51 
 
 		 211 aa  108  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  32.51 
 
 		 211 aa  108  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  32.51 
 
 		 211 aa  108  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1194  amino acid transporter LysE  35.45 
 
 		 206 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00235397  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3720  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.32 
 
 		 213 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.51 
 
 		 211 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  32.51 
 
 		 211 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  33.01 
 
 		 206 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3344  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.75 
 
 		 210 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240621 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003627  putative threonine efflux protein  32.72 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5636  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.14 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0625165 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  36.45 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  32.06 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  32.68 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0273  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.78 
 
 		 205 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 216 aa  105  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  28.99 
 
 		 208 aa  105  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5673  lysine exporter protein LysE/YggA  35.19 
 
 		 211 aa  105  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  33.33 
 
 		 211 aa  104  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  26.7 
 
 		 207 aa  104  8e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  32.02 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4164  RhtB family transporter  33.33 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  30.29 
 
 		 217 aa  103  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  32.67 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1238  lysine exporter protein LysE/YggA  32.84 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0801686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3141  lysine exporter protein LysE/YggA  37.07 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.514565  normal  0.554318 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0367  lysine exporter protein LysE/YggA  35.15 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.73 
 
 		 207 aa  103  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0300  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.55 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2925  amino acid transporter LysE  31.63 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0920317  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2511  lysine exporter protein LysE/YggA  37.07 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3063  lysine exporter protein LysE/YggA  37.07 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3125  lysine exporter protein LysE/YggA  37.07 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.298747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1558  hypothetical protein  38.2 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1808  lysine exporter protein LysE/YggA  31.07 
 
 		 207 aa  101  7e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.702237  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3180  lysine exporter protein LysE/YggA  36.59 
 
 		 213 aa  101  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.920743  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.4 
 
 		 208 aa  101  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4042  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.16 
 
 		 213 aa  101  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1333  lysine exporter protein LysE/YggA  29.9 
 
 		 212 aa  101  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  29.9 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.51 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  30.66 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.272931  normal  0.707068 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8095  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.24 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5446  lysine exporter protein LysE/YggA  33.49 
 
 		 214 aa  99.8  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  31.4 
 
 		 208 aa  99.4  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  31.86 
 
 		 217 aa  99.8  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3064  lysine exporter protein LysE/YggA  35.26 
 
 		 213 aa  99.4  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4254  lysine exporter protein LysE/YggA  32.12 
 
 		 214 aa  99  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  30.77 
 
 		 217 aa  99  4e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>