More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2511 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_2511  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
213 aa  417  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3125  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
213 aa  417  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.298747  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3141  lysine exporter protein LysE/YggA  98.59 
 
 
213 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.514565  normal  0.554318 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  93.9 
 
 
211 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3063  lysine exporter protein LysE/YggA  96.71 
 
 
213 aa  363  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3180  lysine exporter protein LysE/YggA  96.24 
 
 
213 aa  363  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.920743  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  85.92 
 
 
213 aa  346  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  80.75 
 
 
211 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  80.75 
 
 
211 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  80.28 
 
 
211 aa  336  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  80.28 
 
 
211 aa  336  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  80.28 
 
 
211 aa  336  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  80.28 
 
 
211 aa  336  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  80.28 
 
 
211 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  80.28 
 
 
211 aa  321  6e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  79.44 
 
 
214 aa  315  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4414  amino acid efflux pump, RhtB family protein  79.81 
 
 
213 aa  309  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.897061 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0311  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  80.84 
 
 
214 aa  300  9e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  68.84 
 
 
218 aa  296  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  69.81 
 
 
215 aa  296  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  68.37 
 
 
218 aa  295  4e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1238  lysine exporter protein LysE/YggA  53.99 
 
 
212 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0801686  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  45.12 
 
 
210 aa  192  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  44.81 
 
 
213 aa  191  5e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  49.53 
 
 
211 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3385  lysine exporter protein LysE/YggA  46.76 
 
 
214 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201071 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  41.67 
 
 
217 aa  177  1e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.01 
 
 
219 aa  175  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.2 
 
 
218 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2589  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.95 
 
 
243 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  40.74 
 
 
217 aa  170  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4362  lysine exporter protein LysE/YggA  50 
 
 
211 aa  168  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2925  amino acid transporter LysE  39.44 
 
 
209 aa  165  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0920317  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  44.5 
 
 
216 aa  165  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  40.45 
 
 
217 aa  162  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1385  LysE family amino acid efflux protein  52.08 
 
 
213 aa  160  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.159501  normal  0.0685235 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3077  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.03 
 
 
206 aa  153  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.85 
 
 
208 aa  152  5e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0776  lysine exporter protein LysE/YggA  50.92 
 
 
214 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  41.29 
 
 
203 aa  149  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0584  lysine exporter protein LysE/YggA  42.79 
 
 
227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0969  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.64 
 
 
218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  40.5 
 
 
208 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0893485  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3704  lysine exporter protein LysE/YggA  40.5 
 
 
208 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326067  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4659  lysine exporter protein LysE/YggA  40.5 
 
 
208 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.80151  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  40.48 
 
 
204 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  40.48 
 
 
204 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3591  lysine exporter protein LysE/YggA  41 
 
 
209 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5436  lysine exporter protein LysE/YggA  41 
 
 
209 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.97 
 
 
211 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.5 
 
 
208 aa  142  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  40 
 
 
204 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  38.89 
 
 
208 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  40 
 
 
211 aa  141  7e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2405  lysine exporter protein LysE/YggA  40 
 
 
208 aa  141  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  39.05 
 
 
204 aa  139  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1558  hypothetical protein  40.38 
 
 
206 aa  139  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5030  lysine exporter protein LysE/YggA  39.81 
 
 
242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778866  normal  0.678911 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  38.1 
 
 
204 aa  137  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0300  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.19 
 
 
206 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0273  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.19 
 
 
205 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.92 
 
 
211 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.34 
 
 
216 aa  135  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  38.97 
 
 
211 aa  135  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  40 
 
 
194 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  40 
 
 
194 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1522  LysE family protein  40 
 
 
194 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2950  LysE family protein  40 
 
 
194 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  36.67 
 
 
204 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  36.67 
 
 
204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4465  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.29 
 
 
207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.2 
 
 
212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  38.07 
 
 
206 aa  131  9e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  36.19 
 
 
204 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4114  amino acid efflux pump, RhtB family protein  39.13 
 
 
204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4180  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.32 
 
 
207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8095  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.98 
 
 
225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4244  lysine exporter protein LysE/YggA  43.89 
 
 
212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  35.53 
 
 
206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  35.71 
 
 
204 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  35.71 
 
 
227 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  36.19 
 
 
204 aa  128  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.32 
 
 
208 aa  128  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  38.5 
 
 
210 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  35.71 
 
 
204 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4206  lysine exporter protein LysE/YggA  40.31 
 
 
237 aa  128  7.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158668 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1886  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.03 
 
 
214 aa  128  8.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259351  normal  0.142425 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3063  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.95 
 
 
210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  30.99 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0604  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.57 
 
 
204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0141585 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  34.29 
 
 
208 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  38.03 
 
 
210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2862  lysine exporter protein LysE/YggA  35.47 
 
 
213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  38.03 
 
 
210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1194  amino acid transporter LysE  38.1 
 
 
206 aa  125  6e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00235397  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.27 
 
 
209 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  30 
 
 
210 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  29.86 
 
 
210 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3227  lysine exporter protein LysE/YggA  38.34 
 
 
206 aa  122  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5273  lysine exporter protein LysE/YggA  36.45 
 
 
210 aa  122  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  0.071325 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>