More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5446 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5446  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
214 aa  408  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0885  lysine exporter protein LysE/YggA  74.77 
 
 
218 aa  287  8e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347055  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0784  amino acid efflux/transport protein  53.27 
 
 
208 aa  207  9e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  53.81 
 
 
208 aa  206  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3911  putative amino acid (threonine) efflux protein  59.81 
 
 
208 aa  204  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.856049  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  52.8 
 
 
207 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0929  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  51.9 
 
 
209 aa  191  7e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0914  amino acid efflux protein, putative  51.22 
 
 
209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1795  lysine exporter protein LysE/YggA  50.69 
 
 
212 aa  184  8e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1421  lysine exporter protein LysE/YggA  48.1 
 
 
207 aa  174  9e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0823  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.54 
 
 
208 aa  169  2e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000549104  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1609  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  51.26 
 
 
210 aa  169  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.127652  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  44.98 
 
 
211 aa  154  8e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  44.19 
 
 
206 aa  151  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0023  lysine exporter protein LysE/YggA  44.5 
 
 
209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.48 
 
 
208 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.52 
 
 
208 aa  142  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  34.11 
 
 
207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  40.93 
 
 
206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  37.98 
 
 
208 aa  137  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  39.15 
 
 
204 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  40.95 
 
 
203 aa  135  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  36.02 
 
 
217 aa  134  9e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1108  lysine exporter protein LysE/YggA  41.24 
 
 
207 aa  132  5e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  39.44 
 
 
204 aa  132  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  39.91 
 
 
227 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  39.91 
 
 
204 aa  131  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  39.91 
 
 
204 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  35.98 
 
 
217 aa  131  6.999999999999999e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1808  lysine exporter protein LysE/YggA  39.34 
 
 
207 aa  131  6.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.702237  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  40.19 
 
 
204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  39.44 
 
 
204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  39.44 
 
 
204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  38.68 
 
 
204 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  41.18 
 
 
211 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4114  amino acid efflux pump, RhtB family protein  40.09 
 
 
204 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  38.21 
 
 
204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  38.21 
 
 
204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.68 
 
 
211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  38.21 
 
 
204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5581  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.23 
 
 
212 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0604  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.62 
 
 
204 aa  125  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0141585 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.61 
 
 
211 aa  124  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.05 
 
 
223 aa  124  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2465  lysine exporter protein LysE/YggA  39.44 
 
 
214 aa  123  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.19798  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0300  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.22 
 
 
206 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4996  lysine exporter protein LysE/YggA  38.25 
 
 
243 aa  123  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.53634 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.78 
 
 
218 aa  123  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0273  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.22 
 
 
205 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  39.17 
 
 
216 aa  122  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0286  lysine exporter protein LysE/YggA  36.24 
 
 
211 aa  121  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  40.2 
 
 
215 aa  121  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6435  lysine exporter protein LysE/YggA  38.01 
 
 
212 aa  121  9e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1194  amino acid transporter LysE  38.97 
 
 
206 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00235397  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0582  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.06 
 
 
211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0426675 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08451  hypothetical protein  40.39 
 
 
203 aa  119  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3040  lysine exporter protein LysE/YggA  39.61 
 
 
208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.408857  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5326  lysine exporter protein LysE/YggA  39.61 
 
 
208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.692371  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2405  lysine exporter protein LysE/YggA  37.93 
 
 
208 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4385  lysine exporter protein LysE/YggA  37.79 
 
 
234 aa  118  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  0.231735 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3539  lysine exporter protein LysE/YggA  41.12 
 
 
216 aa  118  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.439098 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.46 
 
 
218 aa  118  6e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4942  lysine exporter protein LysE/YggA  39.13 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.20679 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1350  amino acid efflux pump, RhtB family protein  38.25 
 
 
210 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641415  normal  0.0201928 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4074  RhtB family transporter  37.09 
 
 
215 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.472652  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4164  RhtB family transporter  37.56 
 
 
213 aa  117  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4659  lysine exporter protein LysE/YggA  37.93 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.80151  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3704  lysine exporter protein LysE/YggA  37.93 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326067  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2950  LysE family protein  36.79 
 
 
194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1522  LysE family protein  36.79 
 
 
194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.46 
 
 
218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  36.79 
 
 
194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  33.65 
 
 
217 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.25 
 
 
210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.912842 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3921  lysine exporter protein LysE/YggA  37.79 
 
 
210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  36.79 
 
 
194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0093  lysine exporter protein LysE/YggA  39.69 
 
 
207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.60262  decreased coverage  0.0000734751 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.41 
 
 
219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  35.51 
 
 
210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3591  lysine exporter protein LysE/YggA  37.93 
 
 
209 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5436  lysine exporter protein LysE/YggA  37.93 
 
 
209 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.67 
 
 
209 aa  115  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3385  lysine exporter protein LysE/YggA  35.29 
 
 
214 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201071 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  35.51 
 
 
210 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  36.23 
 
 
211 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  36.11 
 
 
208 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.45 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0992  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.56 
 
 
232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0322  lysine exporter protein LysE/YggA  38.16 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279488  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  35.51 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5030  lysine exporter protein LysE/YggA  37.93 
 
 
242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778866  normal  0.678911 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  37.44 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0893485  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2805  lysine exporter protein LysE/YggA  38.16 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164797  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1238  lysine exporter protein LysE/YggA  41.09 
 
 
212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0801686  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3884  lysine exporter protein LysE/YggA  37.33 
 
 
215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5273  lysine exporter protein LysE/YggA  35.94 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  37.33 
 
 
215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3172  lysine exporter protein LysE/YggA  44.29 
 
 
211 aa  112  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  34.54 
 
 
208 aa  112  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.272931  normal  0.707068 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  33.64 
 
 
210 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>