More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3980 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3980  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 205 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4137  lysine exporter protein LysE/YggA  92.68 
 
 		 205 aa  361  4e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1476  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  87.32 
 
 		 205 aa  346  1e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.779186  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  78.64 
 
 		 206 aa  320  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0964  lysine exporter protein LysE/YggA  80.49 
 
 		 205 aa  281  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0177449 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1401  lysine exporter protein LysE/YggA  49.75 
 
 		 204 aa  176  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.582865  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4318  lysine exporter protein LysE/YggA  41.45 
 
 		 203 aa  144  9e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0592644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6543  lysine exporter protein LysE/YggA  47.98 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.259984 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7453  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.36 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353642  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1265  lysine exporter protein LysE/YggA  41.15 
 
 		 208 aa  132  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  40.1 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2082  lysine exporter protein LysE/YggA  40 
 
 		 205 aa  122  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.295879  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2480  lysine exporter protein LysE/YggA  39.71 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  37.44 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  41.48 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.54 
 
 		 207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  41.48 
 
 		 203 aa  118  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.32 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  38.24 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  35.2 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.61 
 
 		 205 aa  115  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  36.71 
 
 		 206 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0367  lysine exporter protein LysE/YggA  42.44 
 
 		 211 aa  112  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1345  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.61 
 
 		 208 aa  111  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123136  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0303  lysine exporter protein LysE/YggA  39.71 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.85144e-16  normal  0.0852573 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  36.92 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.09 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3290  lysine exporter protein LysE/YggA  35.64 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76234  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  34.15 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4576  lysine exporter protein LysE/YggA  39.22 
 
 		 203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  29.56 
 
 		 209 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000194499  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.31 
 
 		 204 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1344  putative threonine efflux protein  30.93 
 
 		 205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.115554  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0582  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.71 
 
 		 211 aa  107  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0426675 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.99 
 
 		 213 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.8 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  33.81 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  36.55 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.5 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.66 
 
 		 213 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  33 
 
 		 207 aa  105  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.32 
 
 		 208 aa  105  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  35.15 
 
 		 211 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35 
 
 		 211 aa  104  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4165  amino acid transporter LysE  34.62 
 
 		 203 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2456  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010294  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  32.08 
 
 		 213 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  35.32 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0815  lysine exporter protein LysE/YggA  34.03 
 
 		 204 aa  102  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.44 
 
 		 208 aa  101  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  30.88 
 
 		 218 aa  101  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  31.28 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4795  lysine exporter protein LysE/YggA  32.2 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  32.71 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.17 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.513568 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2876  lysine exporter protein LysE/YggA  32.72 
 
 		 218 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000054165  unclonable  0.00000000000000325534 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1166  lysine exporter protein LysE/YggA  30.62 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1078  lysine exporter protein LysE/YggA  28.79 
 
 		 204 aa  99.8  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  31.78 
 
 		 211 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.23 
 
 		 209 aa  99.4  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  32.38 
 
 		 211 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0220  homoserine/homoserine lactone efflux protein  37.25 
 
 		 206 aa  98.6  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0593  lysine exporter protein LysE/YggA  31.53 
 
 		 210 aa  98.6  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.47 
 
 		 208 aa  98.6  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3996  homoserine/homoserine lactone efflux protein  37.25 
 
 		 206 aa  98.2  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0557  homoserine/homoserine lactone efflux protein  37.25 
 
 		 206 aa  98.2  8e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5994  hypothetical protein  31.71 
 
 		 209 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.33 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.3 
 
 		 206 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.34 
 
 		 208 aa  95.9  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1927  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.5 
 
 		 199 aa  96.3  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  33.33 
 
 		 206 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  33.33 
 
 		 206 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.33 
 
 		 206 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.33 
 
 		 206 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.33 
 
 		 206 aa  95.5  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0131  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.06 
 
 		 216 aa  95.9  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03652  hypothetical protein  33.33 
 
 		 206 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.33 
 
 		 206 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3972  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.35 
 
 		 206 aa  95.9  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.422052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0088  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.78 
 
 		 215 aa  95.1  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  30.63 
 
 		 222 aa  94.7  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  30.63 
 
 		 222 aa  94.7  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69310  LysE family efflux protein  31.22 
 
 		 209 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1394  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.06 
 
 		 207 aa  94.7  8e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0287  lysine exporter protein LysE/YggA  32.86 
 
 		 214 aa  94.7  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167258  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  30.63 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  31.43 
 
 		 211 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1558  hypothetical protein  36.23 
 
 		 206 aa  94  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0080  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.3 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  31.43 
 
 		 211 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  27.4 
 
 		 208 aa  93.2  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126843  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5514  lysine exporter protein LysE/YggA  34.3 
 
 		 209 aa  93.2  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0945  lysine exporter protein LysE/YggA  33.83 
 
 		 203 aa  94  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2770  lysine exporter protein LysE/YggA  34.41 
 
 		 233 aa  93.6  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1305  lysine exporter protein LysE/YggA  29.95 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  33.98 
 
 		 208 aa  92.4  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  33.96 
 
 		 213 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.86 
 
 		 216 aa  92  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.990518 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>