More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4719 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4719  amino acid transporter LysE  100 
 
 		 205 aa  406  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2328  lysine exporter protein LysE/YggA  78.43 
 
 		 205 aa  330  1e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.49697  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2164  lysine exporter protein LysE/YggA  72.77 
 
 		 225 aa  329  2e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1931  lysine exporter protein LysE/YggA  75.98 
 
 		 205 aa  327  5.0000000000000004e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0747907 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2688  lysine exporter protein (LysE/YggA)  75.49 
 
 		 205 aa  327  8e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.666763 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2295  lysine exporter protein LysE/YggA  75.85 
 
 		 207 aa  327  9e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.536806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2367  lysine exporter protein LysE/YggA  75.36 
 
 		 207 aa  325  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.01403  normal  0.272564 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1954  amino acid transporter LysE  75.36 
 
 		 207 aa  325  3e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1669  lysine exporter protein LysE/YggA  74.88 
 
 		 207 aa  323  7e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2485  lysine exporter protein LysE/YggA  75.36 
 
 		 207 aa  323  8.000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.74737 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2731  lysine exporter protein LysE/YggA  73.91 
 
 		 229 aa  321  4e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.979652  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1729  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  73.43 
 
 		 207 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.339884  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2656  lysine exporter protein LysE/YggA  73.43 
 
 		 207 aa  319  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0662609  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2618  lysine exporter protein LysE/YggA  73.43 
 
 		 229 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1869  lysine exporter protein LysE/YggA  76.1 
 
 		 206 aa  296  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.051717  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2156  lysine exporter protein LysE/YggA  75 
 
 		 205 aa  294  8e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.823885 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2289  lysine exporter protein LysE/YggA  68.97 
 
 		 204 aa  293  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1567  amino acid transporter LysE  66.5 
 
 		 206 aa  261  4.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3276  lysine exporter protein LysE/YggA  60.19 
 
 		 206 aa  257  7e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.667965  normal  0.54958 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05364  putative threonine efflux protein  61.95 
 
 		 206 aa  254  8e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2183  lysine exporter protein LysE/YggA  59.02 
 
 		 206 aa  252  3e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.358199 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1537  lysine exporter protein LysE/YggA  60.68 
 
 		 207 aa  246  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.798481  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1528  hypothetical protein  60 
 
 		 206 aa  242  1.9999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000521  putative threonine efflux protein  62.84 
 
 		 183 aa  224  5.0000000000000005e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0883  amino acid transport protein, LysE type  61.08 
 
 		 206 aa  223  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.325897  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1266  homogentisate export protein  32.79 
 
 		 198 aa  129  3e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.733193  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1022  homogentisate export protein  36.53 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000262161  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1363  LysE family translocator protein  30.46 
 
 		 195 aa  115  5e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00372502  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0032  LysE family translocator protein  30.16 
 
 		 199 aa  112  5e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.787498  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 213 aa  105  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1023  LysE family translocator protein  30.96 
 
 		 204 aa  104  7e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000160759  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  33.15 
 
 		 203 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0287  lysine exporter protein LysE/YggA  32.98 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167258  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  32.67 
 
 		 212 aa  99.4  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2770  lysine exporter protein LysE/YggA  34.02 
 
 		 233 aa  99.4  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  32.61 
 
 		 203 aa  99  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  31.84 
 
 		 211 aa  99.4  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  32.2 
 
 		 211 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4165  amino acid transporter LysE  34.38 
 
 		 203 aa  98.6  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  31.84 
 
 		 211 aa  98.6  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0236  lysine exporter protein LysE/YggA  30.85 
 
 		 214 aa  97.4  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  27.72 
 
 		 209 aa  96.7  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000194499  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2480  lysine exporter protein LysE/YggA  32.61 
 
 		 203 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  30.3 
 
 		 208 aa  96.3  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  30.85 
 
 		 211 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  30.85 
 
 		 211 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2660  lysine exporter protein LysE/YggA  34.5 
 
 		 217 aa  95.9  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0329872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  32.07 
 
 		 203 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  31.05 
 
 		 222 aa  95.9  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2512  LysE family efflux protein  30.1 
 
 		 209 aa  95.9  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.77155  normal  0.629376 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  31.05 
 
 		 222 aa  95.9  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1667  lysine exporter protein LysE/YggA  32.07 
 
 		 209 aa  95.5  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0918  lysine exporter protein LysE/YggA  27.23 
 
 		 209 aa  95.1  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1876  lysine exporter protein LysE/YggA  31.63 
 
 		 224 aa  95.1  6e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4577  lysine exporter protein LysE/YggA  35.58 
 
 		 215 aa  95.1  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.499948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4610  lysine exporter protein LysE/YggA  32.6 
 
 		 210 aa  95.1  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0403  lysine exporter protein LysE/YggA  32.42 
 
 		 211 aa  94.7  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3915  lysine exporter protein LysE/YggA  33.7 
 
 		 212 aa  94  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652927 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.69 
 
 		 211 aa  94  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  30.59 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5023  lysine exporter protein LysE/YggA  32.6 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.904579 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  32.06 
 
 		 218 aa  93.2  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1489  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.08 
 
 		 230 aa  92.8  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5514  lysine exporter protein LysE/YggA  32.09 
 
 		 209 aa  92.4  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2393  lysine exporter protein LysE/YggA  33.52 
 
 		 210 aa  92.4  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  31.19 
 
 		 211 aa  92.4  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1739  lysine exporter protein LysE/YggA  30.15 
 
 		 208 aa  92  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0365796  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3117  lysine exporter protein LysE/YggA  31.49 
 
 		 210 aa  91.3  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5250  lysine exporter protein LysE/YggA  31.49 
 
 		 210 aa  91.3  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  29.89 
 
 		 208 aa  89.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0679  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.37 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000948495 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  27.09 
 
 		 205 aa  89.4  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.59 
 
 		 206 aa  89.4  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3909  lysine exporter protein LysE/YggA  28.71 
 
 		 210 aa  88.6  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.806528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  28.26 
 
 		 213 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4452  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 		 205 aa  88.2  8e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000383536 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0815  lysine exporter protein LysE/YggA  31.69 
 
 		 204 aa  88.2  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4576  lysine exporter protein LysE/YggA  32.29 
 
 		 203 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.8 
 
 		 213 aa  87.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1401  lysine exporter protein LysE/YggA  30.73 
 
 		 204 aa  87.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.582865  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.8 
 
 		 213 aa  87.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  30.32 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2876  lysine exporter protein LysE/YggA  28.37 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000054165  unclonable  0.00000000000000325534 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.85 
 
 		 208 aa  86.7  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3462  lysine exporter protein LysE/YggA  25.12 
 
 		 209 aa  85.5  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.47 
 
 		 206 aa  85.1  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  30.6 
 
 		 211 aa  85.1  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  30.84 
 
 		 211 aa  85.1  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  30.84 
 
 		 211 aa  85.1  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  30.84 
 
 		 211 aa  85.1  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  30.84 
 
 		 211 aa  85.1  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  26.11 
 
 		 205 aa  84.7  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1767  homoserine/homoserine lactone efflux pump  28.82 
 
 		 249 aa  84.7  9e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  31.47 
 
 		 206 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0891  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.92 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  28.26 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.84 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.9 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  32.29 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.47 
 
 		 206 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.624144 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>