More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1023 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1023  LysE family translocator protein  100 
 
 		 204 aa  392  1e-108  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000160759  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1022  homogentisate export protein  38.83 
 
 		 199 aa  144  1e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000262161  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1266  homogentisate export protein  40.3 
 
 		 198 aa  142  4e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.733193  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3276  lysine exporter protein LysE/YggA  33.67 
 
 		 206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.667965  normal  0.54958 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05364  putative threonine efflux protein  30.69 
 
 		 206 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2688  lysine exporter protein (LysE/YggA)  32.47 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.666763 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1528  hypothetical protein  31 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2328  lysine exporter protein LysE/YggA  31.28 
 
 		 205 aa  112  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.49697  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1931  lysine exporter protein LysE/YggA  29.9 
 
 		 205 aa  112  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0747907 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000521  putative threonine efflux protein  31.18 
 
 		 183 aa  111  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1954  amino acid transporter LysE  29.44 
 
 		 207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2731  lysine exporter protein LysE/YggA  30.1 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.979652  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2656  lysine exporter protein LysE/YggA  29.59 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0662609  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2618  lysine exporter protein LysE/YggA  29.59 
 
 		 229 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0883  amino acid transport protein, LysE type  31.5 
 
 		 206 aa  108  8.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.325897  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1729  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.08 
 
 		 207 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.339884  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2367  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 		 207 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.01403  normal  0.272564 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2295  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.536806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2485  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.74737 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1669  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2156  lysine exporter protein LysE/YggA  29.9 
 
 		 205 aa  106  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.823885 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2183  lysine exporter protein LysE/YggA  28.36 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.358199 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4719  amino acid transporter LysE  30.96 
 
 		 205 aa  104  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2164  lysine exporter protein LysE/YggA  27.57 
 
 		 225 aa  104  7e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1537  lysine exporter protein LysE/YggA  29.15 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.798481  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2289  lysine exporter protein LysE/YggA  28.79 
 
 		 204 aa  101  7e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0032  LysE family translocator protein  31.19 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.787498  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1869  lysine exporter protein LysE/YggA  28.72 
 
 		 206 aa  93.2  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.051717  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1567  amino acid transporter LysE  27.36 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1363  LysE family translocator protein  28.06 
 
 		 195 aa  92.8  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00372502  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  29.95 
 
 		 211 aa  88.2  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  28.16 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  28.5 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  28.99 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  27.8 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  28.02 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1166  lysine exporter protein LysE/YggA  29.15 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  28.02 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  28.02 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0266  lysine exporter protein LysE/YggA  24.08 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.05 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  26.89 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  26.89 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  26.29 
 
 		 222 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5476  lysine exporter protein LysE/YggA  24.08 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  26.44 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0222  lysine exporter protein LysE/YggA  24.08 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2876  lysine exporter protein LysE/YggA  26.29 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000054165  unclonable  0.00000000000000325534 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  25.5 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0593  lysine exporter protein LysE/YggA  25.25 
 
 		 210 aa  71.2  0.000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  22.92 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1323  lysine exporter protein LysE/YggA  22.96 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.848324 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3544  lysine exporter protein LysE/YggA  23.12 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0116705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3909  lysine exporter protein LysE/YggA  25.25 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.806528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2867  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  23.12 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1739  lysine exporter protein LysE/YggA  25.5 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0365796  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4165  amino acid transporter LysE  22.92 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5514  lysine exporter protein LysE/YggA  25.14 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  22.4 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0918  lysine exporter protein LysE/YggA  24.84 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  23.03 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  22.92 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4575  lysine exporter protein LysE/YggA  26.63 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0540942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2480  lysine exporter protein LysE/YggA  23.44 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000642  transporter LysE family  26.59 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7111  RhtB family transporter  27.59 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0198  amino acid transporter LysE  24.08 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0219  lysine exporter protein LysE/YggA  24.08 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0891  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  23.38 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  24.74 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00096233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  23.53 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1667  lysine exporter protein LysE/YggA  23.65 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5994  hypothetical protein  26.56 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69310  LysE family efflux protein  26.04 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2660  lysine exporter protein LysE/YggA  24.75 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0329872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  22.47 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  24.5 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  24.32 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2656  lysine exporter protein LysE/YggA  23.4 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0291  lysine exporter protein LysE/YggA  22.28 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2722  lysine exporter protein LysE/YggA  23.66 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.299821  normal  0.0652266 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  24.62 
 
 		 207 aa  62  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  22.89 
 
 		 209 aa  62  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  23.37 
 
 		 207 aa  62  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934187 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  23.37 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161757 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3539  lysine exporter protein LysE/YggA  30.65 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.439098 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  21.89 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0123  lysine exporter protein LysE/YggA  26.34 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  23.4 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.071463  normal  0.0626704 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2802  lysine exporter protein LysE/YggA  22.22 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  23 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4152  homoserine/homoserine lactone efflux protein  24.59 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4576  lysine exporter protein LysE/YggA  24.48 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0122  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.34 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0119  lysine exporter protein LysE/YggA  25.76 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3848  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  24.26 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1354  lysine exporter protein LysE/YggA  21.3 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1886  leucine export protein LeuE  29.22 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0815  lysine exporter protein LysE/YggA  21.99 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  26.34 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>