More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1266 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1266  homogentisate export protein  100 
 
 		 198 aa  378  1e-104  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.733193  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1022  homogentisate export protein  41.08 
 
 		 199 aa  153  1e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000262161  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0032  LysE family translocator protein  39.2 
 
 		 199 aa  144  9e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.787498  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1023  LysE family translocator protein  40.3 
 
 		 204 aa  142  4e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000160759  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1363  LysE family translocator protein  38.34 
 
 		 195 aa  141  7e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00372502  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2183  lysine exporter protein LysE/YggA  35.94 
 
 		 206 aa  137  8.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.358199 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1528  hypothetical protein  34.17 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3276  lysine exporter protein LysE/YggA  34.78 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.667965  normal  0.54958 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05364  putative threonine efflux protein  35.68 
 
 		 206 aa  131  6e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2731  lysine exporter protein LysE/YggA  34.59 
 
 		 229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.979652  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4719  amino acid transporter LysE  32.79 
 
 		 205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2618  lysine exporter protein LysE/YggA  34.05 
 
 		 229 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2656  lysine exporter protein LysE/YggA  34.05 
 
 		 207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0662609  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1729  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.05 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.339884  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2367  lysine exporter protein LysE/YggA  34.05 
 
 		 207 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.01403  normal  0.272564 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1954  amino acid transporter LysE  32.43 
 
 		 207 aa  128  6e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2295  lysine exporter protein LysE/YggA  34.05 
 
 		 207 aa  128  6e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.536806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2289  lysine exporter protein LysE/YggA  33.7 
 
 		 204 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2485  lysine exporter protein LysE/YggA  34.05 
 
 		 207 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.74737 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1669  lysine exporter protein LysE/YggA  32.97 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1537  lysine exporter protein LysE/YggA  32.97 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.798481  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1931  lysine exporter protein LysE/YggA  33.88 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0747907 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2688  lysine exporter protein (LysE/YggA)  33.33 
 
 		 205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.666763 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0883  amino acid transport protein, LysE type  35.33 
 
 		 206 aa  124  9e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.325897  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2328  lysine exporter protein LysE/YggA  32.8 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.49697  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1567  amino acid transporter LysE  35.2 
 
 		 206 aa  122  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2164  lysine exporter protein LysE/YggA  30.05 
 
 		 225 aa  120  9e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1869  lysine exporter protein LysE/YggA  34.59 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.051717  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000521  putative threonine efflux protein  35.67 
 
 		 183 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2156  lysine exporter protein LysE/YggA  32.8 
 
 		 205 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.823885 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  28.14 
 
 		 211 aa  88.6  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  28.14 
 
 		 211 aa  88.6  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  28.74 
 
 		 211 aa  88.6  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  26.32 
 
 		 213 aa  88.2  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.15 
 
 		 207 aa  87.8  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  28.14 
 
 		 211 aa  87.8  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.3 
 
 		 211 aa  87  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.3 
 
 		 207 aa  86.7  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  26.7 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  27.87 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0236  lysine exporter protein LysE/YggA  34.62 
 
 		 214 aa  85.1  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3909  lysine exporter protein LysE/YggA  28.49 
 
 		 210 aa  85.1  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.806528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  28.41 
 
 		 218 aa  84.7  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  28.48 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  27.78 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  28.57 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1489  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.78 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  27.78 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  27.78 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1667  lysine exporter protein LysE/YggA  31.32 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0815  lysine exporter protein LysE/YggA  31.15 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  27.38 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  27.38 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.14 
 
 		 213 aa  81.3  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  32.93 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161757 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4157  lysine exporter protein LysE/YggA  35.37 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.34 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1739  lysine exporter protein LysE/YggA  28 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0365796  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1166  lysine exporter protein LysE/YggA  30.57 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  32.32 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934187 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  26.23 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0113  lysine exporter protein LysE/YggA  32.93 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.894147 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4152  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.61 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000943916  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  26.23 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  26.23 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0287  lysine exporter protein LysE/YggA  30.98 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167258  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  26.23 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.55 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03652  hypothetical protein  26.23 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  26.23 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2660  lysine exporter protein LysE/YggA  28.9 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0329872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  26.23 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  26.23 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  32.64 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000194499  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  26.23 
 
 		 206 aa  77.8  0.00000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0593  lysine exporter protein LysE/YggA  30.46 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0123  lysine exporter protein LysE/YggA  30.49 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  29.49 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5514  lysine exporter protein LysE/YggA  26.01 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  29.7 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  30.49 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0122  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.49 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2876  lysine exporter protein LysE/YggA  25.42 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000054165  unclonable  0.00000000000000325534 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0119  lysine exporter protein LysE/YggA  31.71 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3633  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.3 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4402  lysine exporter protein LysE/YggA  27.37 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.649358  normal  0.816137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  29.88 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3962  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.2 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.149154  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  29.49 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  30.71 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.957378  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3915  lysine exporter protein LysE/YggA  28.32 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652927 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4441  lysine exporter protein (LysE/YggA)  31.1 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.568773  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0122  amino acid transporter LysE  32.32 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3544  lysine exporter protein LysE/YggA  27.37 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0116705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0891  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  23.62 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4236  lysine exporter protein LysE/YggA  29.88 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4165  amino acid transporter LysE  30.97 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  25.39 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3290  lysine exporter protein LysE/YggA  27.32 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76234  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  26.78 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>