More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1528 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1528  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  409  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05364  putative threonine efflux protein  73.3 
 
 
206 aa  310  1e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0883  amino acid transport protein, LysE type  68.63 
 
 
206 aa  272  2.0000000000000002e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.325897  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000521  putative threonine efflux protein  72.13 
 
 
183 aa  269  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2295  lysine exporter protein LysE/YggA  63.9 
 
 
207 aa  268  4e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.536806  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1669  lysine exporter protein LysE/YggA  63.41 
 
 
207 aa  267  7e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2367  lysine exporter protein LysE/YggA  63.41 
 
 
207 aa  267  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.01403  normal  0.272564 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2485  lysine exporter protein LysE/YggA  63.41 
 
 
207 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.74737 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2618  lysine exporter protein LysE/YggA  62.44 
 
 
229 aa  265  4e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1954  amino acid transporter LysE  63.41 
 
 
207 aa  265  5e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2731  lysine exporter protein LysE/YggA  62.44 
 
 
229 aa  264  5e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.979652  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2656  lysine exporter protein LysE/YggA  62.44 
 
 
207 aa  264  8e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0662609  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1729  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  62.44 
 
 
207 aa  264  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.339884  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4719  amino acid transporter LysE  60 
 
 
205 aa  256  2e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1931  lysine exporter protein LysE/YggA  62.87 
 
 
205 aa  255  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0747907 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2688  lysine exporter protein (LysE/YggA)  59.9 
 
 
205 aa  255  4e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.666763 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2164  lysine exporter protein LysE/YggA  56.82 
 
 
225 aa  248  4e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3276  lysine exporter protein LysE/YggA  59.11 
 
 
206 aa  247  8e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.667965  normal  0.54958 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2328  lysine exporter protein LysE/YggA  60.4 
 
 
205 aa  247  8e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.49697  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2289  lysine exporter protein LysE/YggA  59.8 
 
 
204 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2183  lysine exporter protein LysE/YggA  57.42 
 
 
206 aa  236  1e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.358199 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1869  lysine exporter protein LysE/YggA  63.37 
 
 
206 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.051717  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2156  lysine exporter protein LysE/YggA  63.82 
 
 
205 aa  229  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.823885 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1537  lysine exporter protein LysE/YggA  59.61 
 
 
207 aa  228  3e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.798481  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1567  amino acid transporter LysE  61.76 
 
 
206 aa  225  4e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1266  homogentisate export protein  34.17 
 
 
198 aa  143  2e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.733193  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1363  LysE family translocator protein  35.71 
 
 
195 aa  142  3e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00372502  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1022  homogentisate export protein  38.3 
 
 
199 aa  137  8.999999999999999e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000262161  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0032  LysE family translocator protein  33.33 
 
 
199 aa  128  6e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.787498  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1023  LysE family translocator protein  31 
 
 
204 aa  122  5e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000160759  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  34.88 
 
 
222 aa  111  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  34.88 
 
 
222 aa  111  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  35.47 
 
 
211 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  34.42 
 
 
222 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  34.48 
 
 
211 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  33.66 
 
 
213 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  32.99 
 
 
208 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  36.02 
 
 
218 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4795  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 
206 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  34.48 
 
 
211 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  34.98 
 
 
211 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  34.98 
 
 
211 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0287  lysine exporter protein LysE/YggA  35.68 
 
 
214 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167258  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  32.35 
 
 
212 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1739  lysine exporter protein LysE/YggA  31.96 
 
 
208 aa  103  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0365796  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.68 
 
 
213 aa  101  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.16 
 
 
211 aa  99.4  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3909  lysine exporter protein LysE/YggA  31.75 
 
 
210 aa  99.8  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.806528  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0891  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.49 
 
 
209 aa  99.8  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 
213 aa  99  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  33.67 
 
 
211 aa  99.4  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  35.48 
 
 
203 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1876  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 
224 aa  97.4  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2876  lysine exporter protein LysE/YggA  30.54 
 
 
218 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000054165  unclonable  0.00000000000000325534 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  31.98 
 
 
209 aa  96.3  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0236  lysine exporter protein LysE/YggA  32.12 
 
 
214 aa  96.3  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  35.48 
 
 
203 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  35.53 
 
 
203 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3915  lysine exporter protein LysE/YggA  36.17 
 
 
212 aa  95.5  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.652927 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1667  lysine exporter protein LysE/YggA  34.38 
 
 
209 aa  95.5  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931902  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  30.43 
 
 
213 aa  94.7  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.38 
 
 
206 aa  94.7  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.513568 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  31.05 
 
 
211 aa  94  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2660  lysine exporter protein LysE/YggA  31.96 
 
 
217 aa  94.4  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0329872  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3117  lysine exporter protein LysE/YggA  34.91 
 
 
210 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5250  lysine exporter protein LysE/YggA  34.91 
 
 
210 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4701  lysine exporter protein LysE/YggA  28.87 
 
 
207 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0229835 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5023  lysine exporter protein LysE/YggA  34.32 
 
 
210 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.904579 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0403  lysine exporter protein LysE/YggA  34.71 
 
 
211 aa  92.4  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.07 
 
 
208 aa  91.3  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3025  amino acid transporter LysE  31.5 
 
 
206 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0495687 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2512  LysE family efflux protein  29.02 
 
 
209 aa  89.7  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.77155  normal  0.629376 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2480  lysine exporter protein LysE/YggA  34.22 
 
 
203 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.55 
 
 
205 aa  88.6  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3544  lysine exporter protein LysE/YggA  31.82 
 
 
212 aa  88.6  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0116705  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2770  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
233 aa  88.2  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0815  lysine exporter protein LysE/YggA  34.95 
 
 
204 aa  88.2  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  30.26 
 
 
211 aa  88.2  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0050  lysine exporter protein LysE/YggA  30.93 
 
 
210 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1767  homoserine/homoserine lactone efflux pump  30.86 
 
 
249 aa  87.4  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0679  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.87 
 
 
207 aa  87.8  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000948495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4165  amino acid transporter LysE  33.33 
 
 
203 aa  87.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2867  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.82 
 
 
212 aa  87.8  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4610  lysine exporter protein LysE/YggA  31.32 
 
 
210 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5994  hypothetical protein  29.51 
 
 
209 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1221  transporter, LysE family  29.17 
 
 
209 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360927  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2160  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 
206 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17805  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  27.32 
 
 
208 aa  87  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.49 
 
 
208 aa  86.7  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0303  lysine exporter protein LysE/YggA  31.31 
 
 
205 aa  85.9  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.85144e-16  normal  0.0852573 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.41 
 
 
208 aa  86.3  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  29.35 
 
 
213 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  29 
 
 
205 aa  85.1  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  31.35 
 
 
212 aa  85.1  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2902  lysine exporter protein LysE/YggA  29.85 
 
 
206 aa  85.1  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000642  transporter LysE family  29 
 
 
204 aa  85.1  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.85 
 
 
204 aa  84.7  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2048  lysine exporter protein LysE/YggA  31.28 
 
 
249 aa  84  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.675394 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2393  lysine exporter protein LysE/YggA  32.64 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0266  lysine exporter protein LysE/YggA  26.4 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>