More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1537 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1537  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 207 aa  400  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.798481  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3276  lysine exporter protein LysE/YggA  66.5 
 
 		 206 aa  288  3e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.667965  normal  0.54958 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1669  lysine exporter protein LysE/YggA  62.62 
 
 		 207 aa  274  5e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2295  lysine exporter protein LysE/YggA  63.59 
 
 		 207 aa  274  6e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.536806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2731  lysine exporter protein LysE/YggA  62.62 
 
 		 229 aa  274  8e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.979652  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2367  lysine exporter protein LysE/YggA  63.11 
 
 		 207 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.01403  normal  0.272564 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2656  lysine exporter protein LysE/YggA  62.14 
 
 		 207 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0662609  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2618  lysine exporter protein LysE/YggA  61.65 
 
 		 229 aa  272  3e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1954  amino acid transporter LysE  62.14 
 
 		 207 aa  271  5.000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1729  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  61.65 
 
 		 207 aa  270  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.339884  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2485  lysine exporter protein LysE/YggA  62.62 
 
 		 207 aa  270  9e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.74737 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1931  lysine exporter protein LysE/YggA  61.84 
 
 		 205 aa  265  5e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0747907 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4719  amino acid transporter LysE  60.68 
 
 		 205 aa  261  4e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2183  lysine exporter protein LysE/YggA  62.87 
 
 		 206 aa  259  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.358199 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2688  lysine exporter protein (LysE/YggA)  58.94 
 
 		 205 aa  256  1e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.666763 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2328  lysine exporter protein LysE/YggA  60.39 
 
 		 205 aa  256  2e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.49697  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2164  lysine exporter protein LysE/YggA  56 
 
 		 225 aa  252  3e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05364  putative threonine efflux protein  59.11 
 
 		 206 aa  250  9.000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1869  lysine exporter protein LysE/YggA  62.8 
 
 		 206 aa  240  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.051717  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2289  lysine exporter protein LysE/YggA  57.49 
 
 		 204 aa  239  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1567  amino acid transporter LysE  60.87 
 
 		 206 aa  234  8e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1528  hypothetical protein  59.61 
 
 		 206 aa  231  7.000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2156  lysine exporter protein LysE/YggA  60.89 
 
 		 205 aa  228  6e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.823885 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000521  putative threonine efflux protein  59.89 
 
 		 183 aa  222  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0883  amino acid transport protein, LysE type  54.85 
 
 		 206 aa  220  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.325897  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1266  homogentisate export protein  32.97 
 
 		 198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.733193  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1022  homogentisate export protein  34.92 
 
 		 199 aa  122  4e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000262161  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0032  LysE family translocator protein  32.28 
 
 		 199 aa  121  9e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.787498  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1363  LysE family translocator protein  33.67 
 
 		 195 aa  118  6e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00372502  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  36.45 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  36.36 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.62 
 
 		 211 aa  112  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1023  LysE family translocator protein  29.15 
 
 		 204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000160759  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  35.82 
 
 		 211 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  36.27 
 
 		 212 aa  108  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2876  lysine exporter protein LysE/YggA  33.49 
 
 		 218 aa  105  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000054165  unclonable  0.00000000000000325534 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  34.56 
 
 		 222 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  34.56 
 
 		 222 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5023  lysine exporter protein LysE/YggA  36.93 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.904579 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  35.89 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2770  lysine exporter protein LysE/YggA  36.78 
 
 		 233 aa  105  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  35.82 
 
 		 211 aa  104  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0403  lysine exporter protein LysE/YggA  36.72 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  34.1 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  35.82 
 
 		 211 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  34.83 
 
 		 211 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  35.82 
 
 		 211 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3117  lysine exporter protein LysE/YggA  36.11 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5250  lysine exporter protein LysE/YggA  36.11 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1667  lysine exporter protein LysE/YggA  34.04 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4610  lysine exporter protein LysE/YggA  35.8 
 
 		 210 aa  98.2  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1739  lysine exporter protein LysE/YggA  31.96 
 
 		 208 aa  97.4  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0365796  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3915  lysine exporter protein LysE/YggA  38.46 
 
 		 212 aa  96.7  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652927 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5994  hypothetical protein  33.87 
 
 		 209 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3909  lysine exporter protein LysE/YggA  32.31 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.806528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0266  lysine exporter protein LysE/YggA  31.82 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  30.43 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  31.47 
 
 		 208 aa  95.9  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  35.9 
 
 		 203 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.08 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.24 
 
 		 208 aa  93.2  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6040  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.04 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  28.57 
 
 		 205 aa  93.2  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1489  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.19 
 
 		 230 aa  92.8  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3462  lysine exporter protein LysE/YggA  31.25 
 
 		 209 aa  93.2  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  30.93 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2512  LysE family efflux protein  31.84 
 
 		 209 aa  92.8  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.77155  normal  0.629376 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2802  lysine exporter protein LysE/YggA  31.15 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69310  LysE family efflux protein  32.8 
 
 		 209 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0219  lysine exporter protein LysE/YggA  32.14 
 
 		 210 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  33.51 
 
 		 208 aa  92  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.98 
 
 		 206 aa  92  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0222  lysine exporter protein LysE/YggA  32.14 
 
 		 210 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0891  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.46 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0287  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 		 214 aa  91.3  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167258  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  35.57 
 
 		 203 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  29.8 
 
 		 209 aa  91.3  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000194499  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  31.72 
 
 		 213 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  27.04 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1876  lysine exporter protein LysE/YggA  31.58 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0198  amino acid transporter LysE  31.12 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.37 
 
 		 208 aa  89.4  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.03 
 
 		 207 aa  89.7  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  34.54 
 
 		 203 aa  89  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4576  lysine exporter protein LysE/YggA  36.32 
 
 		 203 aa  89  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  29.95 
 
 		 209 aa  89  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  30.85 
 
 		 211 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4137  lysine exporter protein LysE/YggA  33.98 
 
 		 205 aa  88.6  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3980  lysine exporter protein LysE/YggA  33.98 
 
 		 205 aa  88.6  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.37 
 
 		 212 aa  89  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1476  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.75 
 
 		 205 aa  88.2  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.779186  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3544  lysine exporter protein LysE/YggA  34.72 
 
 		 212 aa  88.2  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0116705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3288  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.71 
 
 		 211 aa  88.2  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  29.17 
 
 		 207 aa  87.8  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.957378  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4577  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.499948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2660  lysine exporter protein LysE/YggA  30.37 
 
 		 217 aa  87.8  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0329872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2867  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.72 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0140  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.31 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.1 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3589  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.55 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0368885 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>