More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6040 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_6040  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 
206 aa  392  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8263  homoserine/homoserine lactone efflux protein  56.06 
 
 
206 aa  206  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0435022 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0614  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  53.05 
 
 
207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.355661  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2238  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.92 
 
 
206 aa  123  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.44653  normal  0.0272312 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  32.52 
 
 
213 aa  118  7.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2237  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.87 
 
 
206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  normal  0.0264903 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  32.5 
 
 
208 aa  111  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02476  hypothetical protein  32.35 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1333  lysine exporter protein LysE/YggA  35.92 
 
 
212 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  32 
 
 
208 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126843  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1744  lysine exporter protein LysE/YggA  32 
 
 
208 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0257251  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 
209 aa  107  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1483  lysine exporter protein LysE/YggA  34.74 
 
 
215 aa  107  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1031  hypothetical protein  32.84 
 
 
212 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.332162  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003627  putative threonine efflux protein  31.86 
 
 
231 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2786  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.75 
 
 
206 aa  106  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  33.17 
 
 
210 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  32.66 
 
 
210 aa  105  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1731  lysine exporter protein LysE/YggA  31.5 
 
 
209 aa  105  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.820642  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  30.54 
 
 
210 aa  105  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  32.66 
 
 
210 aa  104  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  32.66 
 
 
210 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  32.16 
 
 
210 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  32.16 
 
 
210 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1925  putative homoserine/threonine efflux protein  31 
 
 
208 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82308e-38 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2383  homoserine/threonine efflux protein, putative  33.51 
 
 
210 aa  102  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.66 
 
 
205 aa  101  7e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  32.66 
 
 
210 aa  101  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1752  homoserine/threonine efflux protein  30.5 
 
 
208 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000289008  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1701  amino acid transporter LysE  30.5 
 
 
208 aa  101  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0912104  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1890  homoserine/threonine efflux protein  30.5 
 
 
208 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.131548  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3063  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.35 
 
 
210 aa  99.8  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0100  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.86 
 
 
234 aa  98.6  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0286  lysine exporter protein LysE/YggA  32.67 
 
 
211 aa  95.9  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2043  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.81 
 
 
208 aa  94.7  9e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000125036  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.52 
 
 
213 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  35.12 
 
 
217 aa  92.4  5e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2876  lysine exporter protein LysE/YggA  29.86 
 
 
218 aa  92  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000054165  unclonable  0.00000000000000325534 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.65 
 
 
204 aa  91.3  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.52 
 
 
213 aa  89.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2500  lysine exporter protein LysE/YggA  30.54 
 
 
213 aa  89  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106725  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  27.27 
 
 
205 aa  89  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2562  lysine exporter protein LysE/YggA  34.13 
 
 
211 aa  88.2  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  30.14 
 
 
213 aa  87.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  30.92 
 
 
211 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  32.18 
 
 
206 aa  87  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  32.98 
 
 
208 aa  86.3  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1537  lysine exporter protein LysE/YggA  32.04 
 
 
207 aa  86.3  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.798481  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  29.95 
 
 
211 aa  86.3  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3276  lysine exporter protein LysE/YggA  29.05 
 
 
206 aa  85.5  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.667965  normal  0.54958 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5581  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.82 
 
 
212 aa  85.1  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  29.95 
 
 
211 aa  84.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14510  putative threonine efflux protein  38.41 
 
 
211 aa  84.7  8e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.93793  normal  0.0749541 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06368  putative threonine efflux protein  29.13 
 
 
207 aa  84  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  34.95 
 
 
215 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  36.41 
 
 
211 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  36.41 
 
 
211 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  31.71 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  36.41 
 
 
211 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  36.41 
 
 
211 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.02 
 
 
218 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  42.36 
 
 
211 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.36 
 
 
218 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  31.05 
 
 
222 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  36.41 
 
 
211 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3591  lysine exporter protein LysE/YggA  35.03 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  36.41 
 
 
211 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.57 
 
 
211 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5436  lysine exporter protein LysE/YggA  35.03 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  36.41 
 
 
211 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  30.24 
 
 
208 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.69 
 
 
208 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  28.85 
 
 
212 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4824  lysine exporter protein LysE/YggA  30.9 
 
 
210 aa  82  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.322328  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  29.06 
 
 
211 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0287  lysine exporter protein LysE/YggA  32.67 
 
 
214 aa  82  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167258  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8095  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.49 
 
 
225 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.88 
 
 
208 aa  81.6  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1558  hypothetical protein  36 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6863  efflux protein  37.8 
 
 
218 aa  81.3  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286077  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.5 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  29.82 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  34.36 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  29.82 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2405  lysine exporter protein LysE/YggA  35.03 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.16 
 
 
204 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.42 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  32.07 
 
 
211 aa  79.7  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1886  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.23 
 
 
214 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259351  normal  0.142425 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  30.43 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1728  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.57 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000259292  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  30.43 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.37 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  33 
 
 
210 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  29.9 
 
 
217 aa  79.3  0.00000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  32.32 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  34.85 
 
 
208 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0893485  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4659  lysine exporter protein LysE/YggA  34.85 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.80151  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  31.19 
 
 
210 aa  79  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5030  lysine exporter protein LysE/YggA  35.35 
 
 
242 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778866  normal  0.678911 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>