More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2562 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2562  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
211 aa  414  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0286  lysine exporter protein LysE/YggA  45.89 
 
 
211 aa  189  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2500  lysine exporter protein LysE/YggA  45.71 
 
 
213 aa  181  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106725  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2786  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.29 
 
 
206 aa  177  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02476  hypothetical protein  42.08 
 
 
211 aa  169  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1333  lysine exporter protein LysE/YggA  42.57 
 
 
212 aa  169  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  42.57 
 
 
213 aa  166  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003627  putative threonine efflux protein  40.2 
 
 
231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  40.1 
 
 
210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1031  hypothetical protein  42.36 
 
 
212 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.332162  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2043  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.1 
 
 
208 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000125036  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1731  lysine exporter protein LysE/YggA  40.31 
 
 
209 aa  159  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.820642  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  39.29 
 
 
210 aa  158  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  39.29 
 
 
210 aa  158  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  39.29 
 
 
210 aa  158  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  39.29 
 
 
210 aa  158  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  39.09 
 
 
210 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  39.52 
 
 
217 aa  155  3e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2383  homoserine/threonine efflux protein, putative  38.86 
 
 
210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  38.78 
 
 
210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  38.78 
 
 
210 aa  154  9e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  36.04 
 
 
209 aa  152  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  40.95 
 
 
217 aa  151  8.999999999999999e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2019  lysine exporter protein LysE/YggA  36.14 
 
 
248 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.318946 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3063  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37 
 
 
210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1483  lysine exporter protein LysE/YggA  41.36 
 
 
215 aa  142  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  38.1 
 
 
217 aa  142  5e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4180  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.71 
 
 
207 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.87 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4465  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.23 
 
 
207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  37.07 
 
 
208 aa  139  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4824  lysine exporter protein LysE/YggA  40.33 
 
 
210 aa  138  7.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.322328  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1388  amino acid transporter LysE  39.51 
 
 
228 aa  137  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0501572  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  37.13 
 
 
208 aa  136  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126843  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1341  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.72 
 
 
245 aa  136  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.40784 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4075  LysE family efflux protein  38.6 
 
 
221 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1744  lysine exporter protein LysE/YggA  36.63 
 
 
208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0257251  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29500  putative threonine efflux protein  37.13 
 
 
207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.585854  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1467  lysine exporter protein LysE/YggA  38.28 
 
 
210 aa  131  6.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1701  amino acid transporter LysE  36.63 
 
 
208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0912104  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.83 
 
 
208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1925  putative homoserine/threonine efflux protein  37.56 
 
 
208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82308e-38 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2495  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.61 
 
 
211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000331121  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1752  homoserine/threonine efflux protein  36.63 
 
 
208 aa  129  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000289008  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1890  homoserine/threonine efflux protein  36.63 
 
 
208 aa  129  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.131548  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4264  lysine exporter protein LysE/YggA  37.38 
 
 
210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269909  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4133  lysine exporter protein LysE/YggA  37.38 
 
 
210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.2 
 
 
218 aa  128  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3227  lysine exporter protein LysE/YggA  38.57 
 
 
206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  35.98 
 
 
211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  35.98 
 
 
211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  35.98 
 
 
211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  35.98 
 
 
211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  35.98 
 
 
211 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.93 
 
 
208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  35.98 
 
 
211 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.98 
 
 
211 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.23 
 
 
218 aa  125  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  39.39 
 
 
206 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.29 
 
 
211 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  35.44 
 
 
215 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  38.5 
 
 
208 aa  124  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  37.21 
 
 
213 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.12 
 
 
212 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  34.93 
 
 
211 aa  123  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  35.12 
 
 
213 aa  122  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.49 
 
 
211 aa  121  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  37.68 
 
 
206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  36.71 
 
 
211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0300  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.58 
 
 
206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2459  lysine exporter protein LysE/YggA  32.51 
 
 
215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.593208  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  35.64 
 
 
216 aa  119  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0111  hypothetical protein  33.5 
 
 
215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0867  lysine exporter protein LysE/YggA  37.38 
 
 
207 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.627781  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.15 
 
 
213 aa  118  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295219  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0100  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.11 
 
 
234 aa  118  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2401  lysine exporter protein LysE/YggA  34.38 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00829988 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2168  lysine exporter protein LysE/YggA  34.95 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  33.66 
 
 
214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5030  lysine exporter protein LysE/YggA  37.93 
 
 
242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778866  normal  0.678911 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1238  lysine exporter protein LysE/YggA  36.59 
 
 
212 aa  116  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0801686  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  35.61 
 
 
211 aa  116  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3105  lysine exporter protein LysE/YggA  36.15 
 
 
207 aa  116  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0921  putative threonine efflux protein  34.43 
 
 
205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  37.37 
 
 
210 aa  115  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2405  lysine exporter protein LysE/YggA  38.28 
 
 
208 aa  115  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1728  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.21 
 
 
208 aa  115  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000259292  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3141  lysine exporter protein LysE/YggA  35.92 
 
 
213 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.514565  normal  0.554318 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0836  lysine exporter protein LysE/YggA  35.02 
 
 
207 aa  115  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3591  lysine exporter protein LysE/YggA  37.93 
 
 
209 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3539  lysine exporter protein LysE/YggA  38.28 
 
 
216 aa  115  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.439098 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5436  lysine exporter protein LysE/YggA  37.93 
 
 
209 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  38.5 
 
 
208 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4659  lysine exporter protein LysE/YggA  38.42 
 
 
208 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.80151  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3704  lysine exporter protein LysE/YggA  38.42 
 
 
208 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326067  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  34.01 
 
 
203 aa  114  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  38.42 
 
 
208 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0893485  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0273  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.56 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0905  hypothetical protein  36.11 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.772442  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>