More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6863 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6863  efflux protein  100 
 
 		 218 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0029  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.6 
 
 		 214 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2381  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.59 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000868866  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.41 
 
 		 212 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2786  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.95 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1031  hypothetical protein  32.39 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.332162  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2043  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.48 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000125036  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4264  lysine exporter protein LysE/YggA  36.7 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269909  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4133  lysine exporter protein LysE/YggA  36.7 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.96 
 
 		 213 aa  108  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295219  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  29.3 
 
 		 213 aa  106  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02476  hypothetical protein  33.33 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6040  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.8 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1467  lysine exporter protein LysE/YggA  35.32 
 
 		 210 aa  106  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003627  putative threonine efflux protein  30.52 
 
 		 231 aa  105  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3025  lysine exporter protein LysE/YggA  39.09 
 
 		 211 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0913763 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  26.44 
 
 		 208 aa  105  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3056  lysine exporter protein LysE/YggA  39.39 
 
 		 211 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3010  lysine exporter protein LysE/YggA  39.39 
 
 		 211 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1343  LysE family translocator protein  42.86 
 
 		 210 aa  104  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1333  lysine exporter protein LysE/YggA  29.77 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4465  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.11 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  28.29 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126843  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0286  lysine exporter protein LysE/YggA  31.58 
 
 		 211 aa  101  9e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  36.87 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1925  putative homoserine/threonine efflux protein  25.96 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82308e-38 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.56 
 
 		 218 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4180  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.65 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.49 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  34.4 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1752  homoserine/threonine efflux protein  25.96 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000289008  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1701  amino acid transporter LysE  25.96 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0912104  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.4 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1890  homoserine/threonine efflux protein  25.96 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.131548  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1728  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.5 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000259292  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  34.4 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1166  lysine exporter protein LysE/YggA  30.2 
 
 		 211 aa  99.8  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  34.4 
 
 		 211 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  34.4 
 
 		 211 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.56 
 
 		 218 aa  99.4  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  34.4 
 
 		 211 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  34.4 
 
 		 211 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.66 
 
 		 213 aa  99  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.96 
 
 		 209 aa  98.6  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  32 
 
 		 203 aa  98.6  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.21 
 
 		 206 aa  98.2  8e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  29.91 
 
 		 217 aa  97.8  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1744  lysine exporter protein LysE/YggA  25.49 
 
 		 208 aa  97.8  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0257251  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2562  lysine exporter protein LysE/YggA  29.77 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.17 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2660  lysine exporter protein LysE/YggA  33.82 
 
 		 217 aa  95.1  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0329872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  36.49 
 
 		 211 aa  95.1  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  26.32 
 
 		 210 aa  95.1  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  33.65 
 
 		 211 aa  94.7  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  28.1 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  28.1 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  24.52 
 
 		 210 aa  94  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  34.15 
 
 		 211 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  28.23 
 
 		 206 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  28.23 
 
 		 206 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  35.48 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  28.1 
 
 		 210 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  28.23 
 
 		 206 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29500  putative threonine efflux protein  32.09 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.585854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  28.23 
 
 		 206 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4075  LysE family efflux protein  34.05 
 
 		 221 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  28.23 
 
 		 206 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03652  hypothetical protein  28.23 
 
 		 206 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  28.1 
 
 		 210 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  26.92 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  28.23 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4405  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.69 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  28.23 
 
 		 206 aa  93.2  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  25.93 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0836  lysine exporter protein LysE/YggA  32.56 
 
 		 207 aa  94  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.15 
 
 		 211 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  34.63 
 
 		 211 aa  93.2  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3063  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.36 
 
 		 210 aa  93.2  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2383  homoserine/threonine efflux protein, putative  27.41 
 
 		 210 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  28.02 
 
 		 206 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3972  homoserine/homoserine lactone efflux protein  28.5 
 
 		 206 aa  92.8  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.422052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3227  lysine exporter protein LysE/YggA  33.94 
 
 		 206 aa  92  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.37 
 
 		 209 aa  92  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2500  lysine exporter protein LysE/YggA  29.82 
 
 		 213 aa  92  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106725  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003307  putative threonine efflux protein  32.88 
 
 		 208 aa  91.7  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  35.65 
 
 		 211 aa  91.7  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0905  hypothetical protein  31.22 
 
 		 208 aa  90.9  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.772442  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2495  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.84 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000331121  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  27.62 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  34.27 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  32.06 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.56 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  29.95 
 
 		 217 aa  90.1  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  29.28 
 
 		 208 aa  89.4  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  30.69 
 
 		 208 aa  89.7  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  34.29 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4347  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.23 
 
 		 206 aa  89  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1739  lysine exporter protein LysE/YggA  33.8 
 
 		 208 aa  89.4  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0365796  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2922  lysine exporter protein LysE/YggA  32.88 
 
 		 206 aa  89.4  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2511  lysine exporter protein LysE/YggA  36.97 
 
 		 213 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>