More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3227 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3227  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 206 aa  400  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2401  lysine exporter protein LysE/YggA  80.1 
 
 		 206 aa  313  9e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00829988 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4180  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  64.73 
 
 		 207 aa  279  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4465  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  63.77 
 
 		 207 aa  274  5e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1467  lysine exporter protein LysE/YggA  48.56 
 
 		 210 aa  180  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4264  lysine exporter protein LysE/YggA  50 
 
 		 210 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269909  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4133  lysine exporter protein LysE/YggA  50 
 
 		 210 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0349  lysine exporter protein LysE/YggA  55.24 
 
 		 209 aa  176  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3582  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.21 
 
 		 210 aa  141  7e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.165726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.09 
 
 		 213 aa  137  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295219  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2562  lysine exporter protein LysE/YggA  38.57 
 
 		 211 aa  134  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4075  LysE family efflux protein  42.06 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1333  lysine exporter protein LysE/YggA  38.16 
 
 		 212 aa  132  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02476  hypothetical protein  36.89 
 
 		 211 aa  131  6.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.86 
 
 		 218 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  39.9 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003627  putative threonine efflux protein  36.41 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.91 
 
 		 218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1031  hypothetical protein  37.2 
 
 		 212 aa  122  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.332162  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2786  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.95 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2500  lysine exporter protein LysE/YggA  36.32 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106725  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  39.11 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3141  lysine exporter protein LysE/YggA  38.24 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.514565  normal  0.554318 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2511  lysine exporter protein LysE/YggA  38.24 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3125  lysine exporter protein LysE/YggA  38.24 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.298747  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  39.9 
 
 		 211 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3063  lysine exporter protein LysE/YggA  37.75 
 
 		 213 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  38.46 
 
 		 216 aa  112  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  36.45 
 
 		 211 aa  113  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  34.16 
 
 		 217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  38.31 
 
 		 203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3180  lysine exporter protein LysE/YggA  37.75 
 
 		 213 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.920743  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0286  lysine exporter protein LysE/YggA  36.1 
 
 		 211 aa  111  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  35.64 
 
 		 211 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  35.64 
 
 		 211 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  35.64 
 
 		 211 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  35.64 
 
 		 211 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  39.13 
 
 		 213 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  35.64 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.64 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  40.29 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  35.15 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1483  lysine exporter protein LysE/YggA  39.9 
 
 		 215 aa  108  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.56 
 
 		 208 aa  108  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.62 
 
 		 219 aa  108  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  32.84 
 
 		 213 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 210 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  36.06 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  36.59 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.79 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1388  amino acid transporter LysE  39.61 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0501572  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.13 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  32.08 
 
 		 217 aa  105  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2043  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.34 
 
 		 208 aa  105  6e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000125036  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0029  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.06 
 
 		 214 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2495  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.56 
 
 		 211 aa  103  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000331121  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  36.71 
 
 		 211 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.05 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  35.12 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3625  amino acid transporter LysE  35.58 
 
 		 213 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  36.95 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  36.95 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1238  lysine exporter protein LysE/YggA  38.42 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0801686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.08 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2108  lysine exporter protein LysE/YggA  35.58 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.451447 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.46 
 
 		 209 aa  102  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  36.95 
 
 		 204 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29500  putative threonine efflux protein  37.82 
 
 		 207 aa  101  8e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.585854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2589  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.47 
 
 		 243 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  36.45 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4164  RhtB family transporter  34.11 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2381  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.44 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000868866  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0100  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.2 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3063  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.24 
 
 		 210 aa  99.8  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1731  lysine exporter protein LysE/YggA  25.6 
 
 		 209 aa  98.6  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.820642  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  28.1 
 
 		 209 aa  98.6  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1795  lysine exporter protein LysE/YggA  34.13 
 
 		 212 aa  97.8  9e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0929  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.68 
 
 		 209 aa  97.8  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4659  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 208 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.80151  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3591  lysine exporter protein LysE/YggA  33.68 
 
 		 209 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 208 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0893485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5436  lysine exporter protein LysE/YggA  33.68 
 
 		 209 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3704  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 208 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326067  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0311  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.59 
 
 		 214 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  29.19 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  32.06 
 
 		 213 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5030  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 242 aa  96.7  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778866  normal  0.678911 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  30.77 
 
 		 208 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4414  amino acid efflux pump, RhtB family protein  36.76 
 
 		 213 aa  95.9  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.897061 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  34.36 
 
 		 208 aa  96.3  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  35.47 
 
 		 204 aa  95.9  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4206  lysine exporter protein LysE/YggA  35.55 
 
 		 237 aa  95.9  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158668 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  34.48 
 
 		 204 aa  95.9  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  28.85 
 
 		 210 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2405  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 		 208 aa  95.5  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  34.48 
 
 		 227 aa  95.5  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2168  lysine exporter protein LysE/YggA  33.82 
 
 		 208 aa  95.5  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  28.37 
 
 		 210 aa  95.1  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4844  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.29 
 
 		 212 aa  95.1  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  34.48 
 
 		 204 aa  95.1  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>