More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4206 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4206  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 237 aa  451  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158668 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  45.15 
 
 		 211 aa  148  7e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  35.74 
 
 		 210 aa  142  5e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  34.75 
 
 		 213 aa  136  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2589  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.96 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.13 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4362  lysine exporter protein LysE/YggA  44.96 
 
 		 211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  39.57 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  41.95 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.61 
 
 		 218 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.18 
 
 		 218 aa  121  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  31.6 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  37.71 
 
 		 216 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  34.62 
 
 		 214 aa  119  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  34.05 
 
 		 211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  34.05 
 
 		 211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  34.05 
 
 		 211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  34.05 
 
 		 211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.05 
 
 		 211 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  34.05 
 
 		 211 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  37.71 
 
 		 211 aa  115  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  34.05 
 
 		 211 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1385  LysE family amino acid efflux protein  39.33 
 
 		 213 aa  112  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.159501  normal  0.0685235 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  30.74 
 
 		 217 aa  112  7.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.64 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1238  lysine exporter protein LysE/YggA  36.29 
 
 		 212 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0801686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4164  RhtB family transporter  35.74 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  30.74 
 
 		 217 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3180  lysine exporter protein LysE/YggA  37.71 
 
 		 213 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.920743  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3063  lysine exporter protein LysE/YggA  37.71 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4942  lysine exporter protein LysE/YggA  35.24 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.20679 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3141  lysine exporter protein LysE/YggA  37.71 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.514565  normal  0.554318 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2511  lysine exporter protein LysE/YggA  38.14 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3125  lysine exporter protein LysE/YggA  38.14 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.298747  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3366  Rht family transporter amino acid efflux protein  45.61 
 
 		 217 aa  105  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0969  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.22 
 
 		 218 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  37.17 
 
 		 211 aa  105  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  35.34 
 
 		 208 aa  105  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0023  lysine exporter protein LysE/YggA  32.44 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.04 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3040  lysine exporter protein LysE/YggA  34.36 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.408857  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3077  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.47 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5326  lysine exporter protein LysE/YggA  34.36 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.692371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0905  hypothetical protein  31.38 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.772442  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2073  lysine exporter protein LysE/YggA  32.77 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106619  normal  0.299626 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.34 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  32.77 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2313  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.19 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00564099  hitchhiker  0.00590082 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2562  lysine exporter protein LysE/YggA  32.74 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2300  lysine exporter protein LysE/YggA  33.19 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.735083  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0885  lysine exporter protein LysE/YggA  39.57 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3105  lysine exporter protein LysE/YggA  32.49 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  32.03 
 
 		 203 aa  102  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0914  amino acid efflux protein, putative  35.47 
 
 		 209 aa  102  5e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1795  lysine exporter protein LysE/YggA  34.84 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  28.94 
 
 		 210 aa  102  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1194  amino acid transporter LysE  32.87 
 
 		 206 aa  102  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00235397  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3385  lysine exporter protein LysE/YggA  29.83 
 
 		 214 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201071 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  28.94 
 
 		 210 aa  101  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0929  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.07 
 
 		 209 aa  101  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  28.94 
 
 		 210 aa  101  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  28.51 
 
 		 210 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  28.51 
 
 		 210 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0322  lysine exporter protein LysE/YggA  33.92 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279488  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0836  lysine exporter protein LysE/YggA  32.91 
 
 		 207 aa  101  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  28.95 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126843  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2925  amino acid transporter LysE  28.27 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0920317  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2500  lysine exporter protein LysE/YggA  31 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106725  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003307  putative threonine efflux protein  31.06 
 
 		 208 aa  99.8  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  28.51 
 
 		 210 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0311  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.86 
 
 		 214 aa  99.8  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.21 
 
 		 211 aa  99.4  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  28.21 
 
 		 209 aa  99.8  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0100  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.19 
 
 		 234 aa  99.4  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  27.54 
 
 		 210 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  29.06 
 
 		 210 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5446  lysine exporter protein LysE/YggA  37.61 
 
 		 214 aa  99  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0867  lysine exporter protein LysE/YggA  32.07 
 
 		 207 aa  99  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.627781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  28.02 
 
 		 207 aa  98.6  7e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  28.45 
 
 		 208 aa  99  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4075  LysE family efflux protein  35.27 
 
 		 221 aa  98.6  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2383  homoserine/threonine efflux protein, putative  28.9 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3227  lysine exporter protein LysE/YggA  35.34 
 
 		 206 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4414  amino acid efflux pump, RhtB family protein  36.86 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.897061 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.21 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0029  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.07 
 
 		 214 aa  97.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0387  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.36 
 
 		 203 aa  97.1  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.45744 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0823  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.43 
 
 		 208 aa  97.4  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000549104  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0584  lysine exporter protein LysE/YggA  40 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  27.83 
 
 		 213 aa  96.3  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.48 
 
 		 208 aa  95.5  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4244  lysine exporter protein LysE/YggA  34.81 
 
 		 212 aa  95.5  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1925  putative homoserine/threonine efflux protein  27.16 
 
 		 208 aa  95.1  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82308e-38 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2495  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.06 
 
 		 211 aa  95.1  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000331121  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1701  amino acid transporter LysE  27.16 
 
 		 208 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0912104  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  33.48 
 
 		 206 aa  94.7  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  36 
 
 		 211 aa  94.7  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  31.72 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2786  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.76 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2019  lysine exporter protein LysE/YggA  33.19 
 
 		 248 aa  94  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.318946 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>