More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4844 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4844  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 
212 aa  407  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29500  putative threonine efflux protein  50 
 
 
207 aa  191  7e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.585854  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2223  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  56.6 
 
 
209 aa  169  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172152  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.35 
 
 
213 aa  135  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295219  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3063  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.84 
 
 
210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0286  lysine exporter protein LysE/YggA  39.41 
 
 
211 aa  132  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2500  lysine exporter protein LysE/YggA  42.23 
 
 
213 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106725  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2741  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.76 
 
 
217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.119177  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  33 
 
 
208 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1333  lysine exporter protein LysE/YggA  34.47 
 
 
212 aa  123  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1731  lysine exporter protein LysE/YggA  30.54 
 
 
209 aa  123  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.820642  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2043  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.32 
 
 
208 aa  120  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000125036  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1925  putative homoserine/threonine efflux protein  32.51 
 
 
208 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82308e-38 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  29.61 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1031  hypothetical protein  34.62 
 
 
212 aa  119  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.332162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1701  amino acid transporter LysE  32.51 
 
 
208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0912104  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  33 
 
 
208 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126843  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4075  LysE family efflux protein  37.27 
 
 
221 aa  118  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  29.61 
 
 
209 aa  118  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0051  amino acid transporter LysE  32.63 
 
 
210 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2168  lysine exporter protein LysE/YggA  36.67 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  29.61 
 
 
210 aa  116  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1483  lysine exporter protein LysE/YggA  34.9 
 
 
215 aa  116  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  29.06 
 
 
210 aa  115  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1388  amino acid transporter LysE  37.85 
 
 
228 aa  115  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0501572  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  29.06 
 
 
210 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  29.06 
 
 
210 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  29.06 
 
 
210 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  29.06 
 
 
210 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  29.06 
 
 
210 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1728  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.68 
 
 
208 aa  112  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000259292  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1752  homoserine/threonine efflux protein  32.02 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000289008  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.79 
 
 
208 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1744  lysine exporter protein LysE/YggA  31.53 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0257251  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2562  lysine exporter protein LysE/YggA  33.01 
 
 
211 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1890  homoserine/threonine efflux protein  32.02 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.131548  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2786  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.88 
 
 
206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  38.03 
 
 
211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2383  homoserine/threonine efflux protein, putative  29.69 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2459  lysine exporter protein LysE/YggA  34.33 
 
 
215 aa  108  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.593208  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  31.03 
 
 
213 aa  108  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02476  hypothetical protein  31.55 
 
 
211 aa  108  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0029  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.64 
 
 
214 aa  108  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1341  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.68 
 
 
245 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.40784 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1343  LysE family translocator protein  38.14 
 
 
210 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2495  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.07 
 
 
211 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000331121  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2019  lysine exporter protein LysE/YggA  31.44 
 
 
248 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.318946 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003627  putative threonine efflux protein  30.33 
 
 
231 aa  100  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0100  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.63 
 
 
234 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  33.82 
 
 
214 aa  99.8  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.88 
 
 
212 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3227  lysine exporter protein LysE/YggA  35.26 
 
 
206 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4180  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.37 
 
 
207 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1194  amino acid transporter LysE  37.44 
 
 
206 aa  99.4  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00235397  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.45 
 
 
211 aa  99  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  34.45 
 
 
211 aa  99  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33 
 
 
218 aa  99  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0349  lysine exporter protein LysE/YggA  39.62 
 
 
209 aa  99  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  34.45 
 
 
211 aa  99  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  34.45 
 
 
211 aa  98.6  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  34.45 
 
 
211 aa  98.6  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0905  hypothetical protein  31.22 
 
 
208 aa  98.6  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.772442  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  34.45 
 
 
211 aa  98.6  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  34.45 
 
 
211 aa  98.6  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4465  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.37 
 
 
207 aa  98.2  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.94 
 
 
211 aa  98.2  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3961  lysine exporter protein LysE/YggA  33.49 
 
 
203 aa  97.8  9e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3778  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.49 
 
 
203 aa  97.8  9e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.64 
 
 
209 aa  97.8  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0490  lysine exporter protein LysE/YggA  33.49 
 
 
203 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0078  amino acid efflux protein  32.65 
 
 
205 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.45 
 
 
211 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33 
 
 
218 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2401  lysine exporter protein LysE/YggA  33.68 
 
 
206 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00829988 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  33.02 
 
 
208 aa  95.9  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0867  lysine exporter protein LysE/YggA  32.41 
 
 
207 aa  95.9  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.627781  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  35.71 
 
 
216 aa  95.5  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.12 
 
 
223 aa  95.5  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  33.65 
 
 
211 aa  95.1  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2073  lysine exporter protein LysE/YggA  33.02 
 
 
208 aa  95.1  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106619  normal  0.299626 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2300  lysine exporter protein LysE/YggA  33.02 
 
 
208 aa  94.7  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.735083  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2313  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.02 
 
 
208 aa  94.7  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00564099  hitchhiker  0.00590082 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4414  amino acid efflux pump, RhtB family protein  35.27 
 
 
213 aa  94.7  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.897061 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3130  lysine exporter protein LysE/YggA  38.78 
 
 
215 aa  94.7  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.376796 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06605  putative threonine efflux protein  32.49 
 
 
203 aa  94.4  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  34.63 
 
 
213 aa  94.4  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  36.1 
 
 
203 aa  94  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3385  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 
214 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201071 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  31.07 
 
 
209 aa  94  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1795  lysine exporter protein LysE/YggA  35.1 
 
 
212 aa  94  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0836  lysine exporter protein LysE/YggA  31.94 
 
 
207 aa  93.2  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02483  hypothetical protein  30.62 
 
 
209 aa  92.8  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3105  lysine exporter protein LysE/YggA  31.94 
 
 
207 aa  92.4  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  35.75 
 
 
203 aa  91.7  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  31.07 
 
 
217 aa  91.7  8e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1238  lysine exporter protein LysE/YggA  31.51 
 
 
212 aa  91.7  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0801686  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  33.99 
 
 
215 aa  90.9  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5326  lysine exporter protein LysE/YggA  37.5 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.692371  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3040  lysine exporter protein LysE/YggA  37.5 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.408857  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.99 
 
 
204 aa  90.1  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>