More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2741 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2741  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 
217 aa  415  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.119177  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2223  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  51.22 
 
 
209 aa  158  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172152  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29500  putative threonine efflux protein  42.36 
 
 
207 aa  142  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.585854  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4844  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.76 
 
 
212 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5867  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.6 
 
 
204 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2459  lysine exporter protein LysE/YggA  31.03 
 
 
215 aa  100  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.593208  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1483  lysine exporter protein LysE/YggA  36.1 
 
 
215 aa  99.8  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3063  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.43 
 
 
210 aa  99.4  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2416  RhtB family transporter  33.65 
 
 
210 aa  99  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4075  LysE family efflux protein  38.43 
 
 
221 aa  98.6  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.02 
 
 
212 aa  98.6  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0531  lysine exporter protein LysE/YggA  28.22 
 
 
203 aa  95.9  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06605  putative threonine efflux protein  29.08 
 
 
203 aa  95.5  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  29.56 
 
 
209 aa  94.7  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003627  putative threonine efflux protein  29.8 
 
 
231 aa  93.6  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.93 
 
 
209 aa  94  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1731  lysine exporter protein LysE/YggA  28.92 
 
 
209 aa  93.6  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.820642  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  28.5 
 
 
210 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1031  hypothetical protein  34.51 
 
 
212 aa  92.4  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.332162  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2802  lysine exporter protein LysE/YggA  39.02 
 
 
212 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  28.02 
 
 
210 aa  91.7  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02476  hypothetical protein  29.29 
 
 
211 aa  91.7  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  27.54 
 
 
210 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5476  lysine exporter protein LysE/YggA  36.81 
 
 
210 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  28.02 
 
 
210 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  28.02 
 
 
210 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  28.02 
 
 
210 aa  90.5  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.01 
 
 
208 aa  90.1  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  28.02 
 
 
210 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  41.26 
 
 
207 aa  90.1  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  27.05 
 
 
210 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0266  lysine exporter protein LysE/YggA  39.13 
 
 
210 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0140  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.65 
 
 
210 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1333  lysine exporter protein LysE/YggA  34.91 
 
 
212 aa  89.4  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  30.5 
 
 
208 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 
211 aa  89.4  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3077  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.81 
 
 
206 aa  89  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4264  lysine exporter protein LysE/YggA  34.33 
 
 
210 aa  88.6  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269909  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  33.5 
 
 
208 aa  88.6  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126843  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4133  lysine exporter protein LysE/YggA  34.33 
 
 
210 aa  88.6  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1701  amino acid transporter LysE  31.66 
 
 
208 aa  88.2  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0912104  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2043  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.89 
 
 
208 aa  87.4  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000125036  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0050  lysine exporter protein LysE/YggA  34.65 
 
 
210 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0122  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.01 
 
 
207 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  34.01 
 
 
207 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0530  amino acid transporter LysE  25.87 
 
 
203 aa  87  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2925  amino acid transporter LysE  26.63 
 
 
209 aa  87  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0920317  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  30.33 
 
 
213 aa  87.4  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0286  lysine exporter protein LysE/YggA  30.61 
 
 
211 aa  87  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0123  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 
207 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0222  lysine exporter protein LysE/YggA  39.13 
 
 
210 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  39.04 
 
 
213 aa  86.3  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.54 
 
 
218 aa  86.7  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1925  putative homoserine/threonine efflux protein  30.65 
 
 
208 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82308e-38 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.5 
 
 
213 aa  85.9  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295219  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2562  lysine exporter protein LysE/YggA  32.63 
 
 
211 aa  85.5  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4236  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 
207 aa  85.9  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02483  hypothetical protein  27.84 
 
 
209 aa  85.5  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1744  lysine exporter protein LysE/YggA  35 
 
 
208 aa  85.5  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0257251  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.35 
 
 
208 aa  85.1  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0936  lysine exporter protein LysE/YggA  28.5 
 
 
212 aa  85.1  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.950459  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.17 
 
 
211 aa  84.7  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  32.34 
 
 
203 aa  84.7  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  35.78 
 
 
215 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1920  amino acid transporter LysE  30.95 
 
 
212 aa  84.7  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1388  amino acid transporter LysE  36.45 
 
 
228 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0501572  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4180  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.09 
 
 
207 aa  84  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3778  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  24.75 
 
 
203 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0867  lysine exporter protein LysE/YggA  33.99 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.627781  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3961  lysine exporter protein LysE/YggA  24.75 
 
 
203 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  33.82 
 
 
208 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1849  amino acid transporter LysE  30.95 
 
 
212 aa  84.7  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5636  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.71 
 
 
211 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0625165 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.14 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  29.9 
 
 
217 aa  84  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0490  lysine exporter protein LysE/YggA  24.75 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2168  lysine exporter protein LysE/YggA  35.15 
 
 
208 aa  83.6  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3097  lysine exporter protein LysE/YggA  32.5 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69310  LysE family efflux protein  31.16 
 
 
209 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2383  homoserine/threonine efflux protein, putative  28.04 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3615  lysine exporter protein LysE/YggA  37.09 
 
 
208 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0587499  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1752  homoserine/threonine efflux protein  35 
 
 
208 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000289008  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  31.5 
 
 
211 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1323  lysine exporter protein LysE/YggA  26.34 
 
 
211 aa  83.2  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.848324 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  37.11 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1890  homoserine/threonine efflux protein  35 
 
 
208 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.131548  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  31.73 
 
 
211 aa  83.2  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  31.5 
 
 
211 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  31.5 
 
 
211 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  31.5 
 
 
211 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  37.11 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  42.07 
 
 
211 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.73 
 
 
218 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1467  lysine exporter protein LysE/YggA  32.84 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  35.15 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5994  hypothetical protein  30.7 
 
 
209 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  37.11 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  36.77 
 
 
208 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  32.45 
 
 
209 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000194499  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0836  lysine exporter protein LysE/YggA  34.8 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>