More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2168 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2168  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 208 aa  402  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4824  lysine exporter protein LysE/YggA  41.21 
 
 		 210 aa  129  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.322328  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1031  hypothetical protein  39.41 
 
 		 212 aa  128  7.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.332162  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02476  hypothetical protein  36.02 
 
 		 211 aa  121  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1333  lysine exporter protein LysE/YggA  36.23 
 
 		 212 aa  119  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3063  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.88 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003627  putative threonine efflux protein  35.07 
 
 		 231 aa  116  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1731  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 		 209 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.820642  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1483  lysine exporter protein LysE/YggA  38.05 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2786  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.68 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  32.04 
 
 		 210 aa  112  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  31.55 
 
 		 210 aa  112  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  31.84 
 
 		 209 aa  112  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  32.04 
 
 		 210 aa  112  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  31.55 
 
 		 210 aa  112  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  31.55 
 
 		 210 aa  112  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  31.55 
 
 		 210 aa  112  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  31.07 
 
 		 210 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  31.86 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2500  lysine exporter protein LysE/YggA  35.78 
 
 		 213 aa  107  9.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106725  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2383  homoserine/threonine efflux protein, putative  31.79 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2459  lysine exporter protein LysE/YggA  33.18 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.593208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4075  LysE family efflux protein  34.88 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  33.65 
 
 		 217 aa  105  7e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  33.33 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2562  lysine exporter protein LysE/YggA  34.95 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  35.61 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  35.85 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0699  amino acid transporter LysE  33.33 
 
 		 204 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0691811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.29 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295219  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1388  amino acid transporter LysE  33.49 
 
 		 228 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0501572  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  30.29 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 212 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0286  lysine exporter protein LysE/YggA  34.67 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1341  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.06 
 
 		 245 aa  99.8  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.40784 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0100  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.05 
 
 		 234 aa  99.4  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 208 aa  99.4  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.272931  normal  0.707068 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  33.18 
 
 		 209 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  32.14 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4844  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.67 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29500  putative threonine efflux protein  33.67 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.585854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1343  LysE family translocator protein  33 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3778  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.88 
 
 		 203 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0490  lysine exporter protein LysE/YggA  35.88 
 
 		 203 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3961  lysine exporter protein LysE/YggA  35.88 
 
 		 203 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2019  lysine exporter protein LysE/YggA  31.6 
 
 		 248 aa  96.3  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.318946 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  31.84 
 
 		 217 aa  95.9  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2043  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.18 
 
 		 208 aa  96.3  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000125036  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.35 
 
 		 218 aa  95.9  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  32.52 
 
 		 208 aa  95.5  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126843  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0111  hypothetical protein  31.55 
 
 		 215 aa  95.1  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0989  lysine exporter protein LysE/YggA  33.65 
 
 		 210 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06605  putative threonine efflux protein  30.62 
 
 		 203 aa  95.1  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  34.56 
 
 		 210 aa  95.1  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  31.28 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4180  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.33 
 
 		 207 aa  94  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  31.28 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.63 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  31.28 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4118  RhtB family transporter  30.19 
 
 		 213 aa  94  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3976  lysine exporter protein LysE/YggA  32.69 
 
 		 205 aa  94.4  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  30.73 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  31.28 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  33.68 
 
 		 210 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  31.63 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  33.68 
 
 		 210 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  30.58 
 
 		 208 aa  94  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1238  lysine exporter protein LysE/YggA  30.73 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0801686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  32.49 
 
 		 210 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.63 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.72 
 
 		 219 aa  93.2  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 204 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.824462  normal  0.397861 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.49 
 
 		 218 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4465  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.25 
 
 		 207 aa  92.4  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  32.02 
 
 		 213 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 204 aa  92  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0936  lysine exporter protein LysE/YggA  32.86 
 
 		 212 aa  91.7  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.950459  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2925  amino acid transporter LysE  32.51 
 
 		 209 aa  91.7  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0920317  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1920  amino acid transporter LysE  32.23 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1147  transporter, LysE family  32.69 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1849  amino acid transporter LysE  32.23 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7469  lysine exporter protein LysE/YggA  32.37 
 
 		 205 aa  91.3  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02483  hypothetical protein  32.2 
 
 		 209 aa  90.5  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0078  amino acid efflux protein  32.85 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  31.86 
 
 		 213 aa  89.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  31.55 
 
 		 203 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.955446 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0867  lysine exporter protein LysE/YggA  32.86 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.627781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  32.84 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0531  lysine exporter protein LysE/YggA  35.26 
 
 		 203 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  32.84 
 
 		 204 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  32.84 
 
 		 227 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  32.84 
 
 		 204 aa  89.4  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1701  amino acid transporter LysE  27.09 
 
 		 208 aa  89  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0912104  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  33.85 
 
 		 210 aa  89  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1925  putative homoserine/threonine efflux protein  28.43 
 
 		 208 aa  89  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82308e-38 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1728  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.04 
 
 		 208 aa  89.4  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000259292  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1886  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.87 
 
 		 214 aa  89  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259351  normal  0.142425 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.62 
 
 		 218 aa  89  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4244  lysine exporter protein LysE/YggA  35.17 
 
 		 212 aa  88.6  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>