More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4075 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4075  LysE family efflux protein  100 
 
 		 221 aa  421  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0029  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.45 
 
 		 214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4465  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.25 
 
 		 207 aa  149  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4180  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.79 
 
 		 207 aa  146  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.94 
 
 		 212 aa  142  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4133  lysine exporter protein LysE/YggA  41.2 
 
 		 210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4264  lysine exporter protein LysE/YggA  41.2 
 
 		 210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269909  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0349  lysine exporter protein LysE/YggA  42.59 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.63 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295219  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3227  lysine exporter protein LysE/YggA  40.93 
 
 		 206 aa  139  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2401  lysine exporter protein LysE/YggA  39 
 
 		 206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00829988 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2562  lysine exporter protein LysE/YggA  38.14 
 
 		 211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1467  lysine exporter protein LysE/YggA  40.74 
 
 		 210 aa  138  6e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  41.74 
 
 		 215 aa  138  7.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.18 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3582  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.84 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.165726  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.09 
 
 		 218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2043  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 208 aa  129  3e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000125036  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2019  lysine exporter protein LysE/YggA  38.2 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.318946 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2381  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.46 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000868866  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3063  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.34 
 
 		 210 aa  122  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0286  lysine exporter protein LysE/YggA  33.96 
 
 		 211 aa  122  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1728  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.86 
 
 		 208 aa  121  7e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000259292  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1731  lysine exporter protein LysE/YggA  28.04 
 
 		 209 aa  121  7e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.820642  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  31.9 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  29.09 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2500  lysine exporter protein LysE/YggA  36.28 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106725  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2168  lysine exporter protein LysE/YggA  34.42 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4844  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.41 
 
 		 212 aa  119  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  28.18 
 
 		 210 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  33.95 
 
 		 211 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  28.18 
 
 		 210 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  33.95 
 
 		 211 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  33.95 
 
 		 211 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0100  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.04 
 
 		 234 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  33.95 
 
 		 211 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  28.18 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  28.18 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  33.95 
 
 		 211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.95 
 
 		 211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  28.51 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1388  amino acid transporter LysE  40.93 
 
 		 228 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0501572  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  38.57 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29500  putative threonine efflux protein  36.15 
 
 		 207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.585854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  28.64 
 
 		 210 aa  116  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2495  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.43 
 
 		 211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000331121  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  37.21 
 
 		 211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1031  hypothetical protein  31.96 
 
 		 212 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.332162  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  40.58 
 
 		 213 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  31.08 
 
 		 217 aa  115  7.999999999999999e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  27.73 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  33.49 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  32.38 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  27.98 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02476  hypothetical protein  33.49 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2459  lysine exporter protein LysE/YggA  31.82 
 
 		 215 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.593208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  34.84 
 
 		 210 aa  111  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  35.45 
 
 		 210 aa  111  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  35.29 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  35.43 
 
 		 216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2786  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.18 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  31.28 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  35.81 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  32.57 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  33.81 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003627  putative threonine efflux protein  31.31 
 
 		 231 aa  109  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  34.39 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  34.39 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  38.21 
 
 		 214 aa  109  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1238  lysine exporter protein LysE/YggA  38.07 
 
 		 212 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0801686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  41.06 
 
 		 211 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.4 
 
 		 219 aa  108  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1333  lysine exporter protein LysE/YggA  32.71 
 
 		 212 aa  108  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4206  lysine exporter protein LysE/YggA  37.07 
 
 		 237 aa  108  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158668 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2383  homoserine/threonine efflux protein, putative  29.7 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.26 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2416  RhtB family transporter  35.16 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4824  lysine exporter protein LysE/YggA  34.55 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.322328  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.1 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.87 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1483  lysine exporter protein LysE/YggA  33.65 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19390  putative threonine efflux protein  42.99 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.018608  normal  0.131617 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  29.73 
 
 		 217 aa  106  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2511  lysine exporter protein LysE/YggA  36.74 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3125  lysine exporter protein LysE/YggA  36.74 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.298747  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3180  lysine exporter protein LysE/YggA  37.21 
 
 		 213 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.920743  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3063  lysine exporter protein LysE/YggA  36.74 
 
 		 213 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1343  LysE family translocator protein  40.55 
 
 		 210 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2108  lysine exporter protein LysE/YggA  32.86 
 
 		 213 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.451447 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  33.64 
 
 		 203 aa  105  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.73 
 
 		 211 aa  104  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4414  amino acid efflux pump, RhtB family protein  37.96 
 
 		 213 aa  104  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.897061 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  28.04 
 
 		 213 aa  104  9e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.85 
 
 		 216 aa  104  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3141  lysine exporter protein LysE/YggA  35.81 
 
 		 213 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.514565  normal  0.554318 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3625  amino acid transporter LysE  32.38 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3344  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.79 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240621 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  36.24 
 
 		 211 aa  102  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.87 
 
 		 209 aa  101  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  29.68 
 
 		 208 aa  101  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>