More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2401 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2401  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 206 aa  407  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00829988 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3227  lysine exporter protein LysE/YggA  80.1 
 
 		 206 aa  320  7e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4180  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  68.12 
 
 		 207 aa  290  2e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4465  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  67.63 
 
 		 207 aa  287  7e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4133  lysine exporter protein LysE/YggA  48.08 
 
 		 210 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4264  lysine exporter protein LysE/YggA  48.08 
 
 		 210 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269909  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1467  lysine exporter protein LysE/YggA  46.7 
 
 		 210 aa  182  4.0000000000000006e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0349  lysine exporter protein LysE/YggA  52.61 
 
 		 209 aa  177  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3582  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.62 
 
 		 210 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.165726  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4075  LysE family efflux protein  40.19 
 
 		 221 aa  136  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02476  hypothetical protein  37.38 
 
 		 211 aa  133  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003627  putative threonine efflux protein  36.89 
 
 		 231 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.28 
 
 		 218 aa  132  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.05 
 
 		 213 aa  132  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295219  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1333  lysine exporter protein LysE/YggA  37.13 
 
 		 212 aa  129  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.39 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2562  lysine exporter protein LysE/YggA  35.75 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  39.42 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1031  hypothetical protein  35.89 
 
 		 212 aa  122  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.332162  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2786  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.15 
 
 		 206 aa  118  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  39 
 
 		 211 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2500  lysine exporter protein LysE/YggA  35.29 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106725  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  35.44 
 
 		 211 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0029  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.5 
 
 		 214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3141  lysine exporter protein LysE/YggA  37.68 
 
 		 213 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.514565  normal  0.554318 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  35.12 
 
 		 206 aa  111  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  38.61 
 
 		 211 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2511  lysine exporter protein LysE/YggA  38.73 
 
 		 213 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3125  lysine exporter protein LysE/YggA  38.73 
 
 		 213 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.298747  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  38.65 
 
 		 213 aa  111  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3063  lysine exporter protein LysE/YggA  38.24 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  31.43 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2043  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.2 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000125036  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3180  lysine exporter protein LysE/YggA  38.24 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.920743  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2381  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.39 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000868866  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4164  RhtB family transporter  38.1 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.95 
 
 		 211 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  34.95 
 
 		 211 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  34.31 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.89 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  34.31 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1483  lysine exporter protein LysE/YggA  35.92 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  32.21 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  34.31 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  34.31 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  38.65 
 
 		 214 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3063  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 210 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  31.58 
 
 		 210 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2495  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.32 
 
 		 211 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000331121  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  30.77 
 
 		 210 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  37.13 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  34.86 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  30.77 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  30.77 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  30.77 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  30.77 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0100  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 234 aa  106  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  31.25 
 
 		 210 aa  105  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  33.49 
 
 		 217 aa  105  6e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  34.93 
 
 		 213 aa  104  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  36.27 
 
 		 203 aa  104  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  30.1 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1238  lysine exporter protein LysE/YggA  35.61 
 
 		 212 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0801686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0286  lysine exporter protein LysE/YggA  34.3 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3625  amino acid transporter LysE  33.17 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2383  homoserine/threonine efflux protein, putative  33.33 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2108  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.451447 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29500  putative threonine efflux protein  37.17 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.585854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  35.58 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.56 
 
 		 211 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.4 
 
 		 219 aa  102  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  36.53 
 
 		 216 aa  101  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1731  lysine exporter protein LysE/YggA  27.54 
 
 		 209 aa  101  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.820642  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 213 aa  101  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  32.85 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126843  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  33.99 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  33.99 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  32.86 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.82 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.11 
 
 		 218 aa  99.4  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  30.85 
 
 		 210 aa  99.4  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  31.03 
 
 		 213 aa  99.4  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  34.31 
 
 		 204 aa  99  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1744  lysine exporter protein LysE/YggA  31.9 
 
 		 208 aa  99.4  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0257251  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  33.5 
 
 		 204 aa  99  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2313  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.74 
 
 		 208 aa  98.2  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00564099  hitchhiker  0.00590082 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2300  lysine exporter protein LysE/YggA  34.74 
 
 		 208 aa  98.2  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.735083  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  30.52 
 
 		 208 aa  98.2  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.27 
 
 		 211 aa  98.2  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1388  amino acid transporter LysE  34.3 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0501572  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2168  lysine exporter protein LysE/YggA  31.86 
 
 		 208 aa  97.4  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2459  lysine exporter protein LysE/YggA  33.8 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.593208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2073  lysine exporter protein LysE/YggA  39.39 
 
 		 208 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106619  normal  0.299626 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.02 
 
 		 209 aa  97.4  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2589  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.91 
 
 		 243 aa  97.1  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  32.52 
 
 		 204 aa  97.1  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  34.3 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  33 
 
 		 227 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 212 aa  96.7  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  32.52 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>