More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0051 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0051  amino acid transporter LysE  100 
 
 
210 aa  410  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  33.97 
 
 
208 aa  125  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126843  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1731  lysine exporter protein LysE/YggA  33.49 
 
 
209 aa  119  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.820642  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 
209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  32.06 
 
 
208 aa  118  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1744  lysine exporter protein LysE/YggA  33.01 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0257251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1701  amino acid transporter LysE  32.54 
 
 
208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0912104  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1925  putative homoserine/threonine efflux protein  32.54 
 
 
208 aa  116  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82308e-38 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  30 
 
 
210 aa  116  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1752  homoserine/threonine efflux protein  33.01 
 
 
208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000289008  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1890  homoserine/threonine efflux protein  33.01 
 
 
208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.131548  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3063  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.54 
 
 
210 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  30.39 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  30.39 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  30.39 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  30.39 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  29.52 
 
 
210 aa  112  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  32.2 
 
 
210 aa  112  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  29.9 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1728  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.66 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000259292  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.22 
 
 
212 aa  109  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0286  lysine exporter protein LysE/YggA  30.24 
 
 
211 aa  109  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29500  putative threonine efflux protein  29.23 
 
 
207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.585854  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  30.54 
 
 
215 aa  105  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2383  homoserine/threonine efflux protein, putative  30.05 
 
 
210 aa  105  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4844  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.03 
 
 
212 aa  105  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2495  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.33 
 
 
211 aa  104  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000331121  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  30.05 
 
 
211 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.01 
 
 
213 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295219  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2043  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.4 
 
 
208 aa  103  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000125036  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 
204 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  32 
 
 
209 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0699  amino acid transporter LysE  34.45 
 
 
204 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0691811  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  31.03 
 
 
213 aa  102  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 
214 aa  101  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0905  hypothetical protein  33.33 
 
 
208 aa  100  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.772442  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0530  amino acid transporter LysE  32.49 
 
 
203 aa  100  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.57 
 
 
205 aa  100  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1256  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.67 
 
 
205 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3644  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.5 
 
 
204 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1343  LysE family translocator protein  30.73 
 
 
210 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06605  putative threonine efflux protein  31.91 
 
 
203 aa  98.2  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5915  LysE family transporter  31.19 
 
 
204 aa  98.2  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.723016 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2925  amino acid transporter LysE  31.88 
 
 
209 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0920317  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0531  lysine exporter protein LysE/YggA  31.98 
 
 
203 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  30.29 
 
 
211 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3141  lysine exporter protein LysE/YggA  30.05 
 
 
213 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.514565  normal  0.554318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0029  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.59 
 
 
214 aa  97.1  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  31.94 
 
 
203 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.955446 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3778  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.77 
 
 
203 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  30.29 
 
 
211 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3961  lysine exporter protein LysE/YggA  30.77 
 
 
203 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0490  lysine exporter protein LysE/YggA  30.77 
 
 
203 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3063  lysine exporter protein LysE/YggA  30.05 
 
 
213 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4414  amino acid efflux pump, RhtB family protein  32.66 
 
 
213 aa  97.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.897061 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2168  lysine exporter protein LysE/YggA  29.05 
 
 
208 aa  96.7  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  30.29 
 
 
211 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  30.29 
 
 
211 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  29.76 
 
 
209 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2511  lysine exporter protein LysE/YggA  30.05 
 
 
213 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3180  lysine exporter protein LysE/YggA  29.56 
 
 
213 aa  96.3  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.920743  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3125  lysine exporter protein LysE/YggA  30.05 
 
 
213 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.298747  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.29 
 
 
211 aa  95.5  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.94 
 
 
218 aa  95.9  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  30.29 
 
 
211 aa  95.5  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  28.78 
 
 
213 aa  95.5  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.92 
 
 
218 aa  95.5  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2223  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.94 
 
 
209 aa  95.1  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172152  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3976  lysine exporter protein LysE/YggA  29.86 
 
 
205 aa  95.1  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7469  lysine exporter protein LysE/YggA  30.05 
 
 
205 aa  95.1  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  30.29 
 
 
211 aa  95.1  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0100  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.32 
 
 
234 aa  95.1  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4978  lysine exporter protein LysE/YggA  31.22 
 
 
207 aa  94.7  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0717  lysine exporter protein LysE/YggA  30.85 
 
 
204 aa  94.4  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2459  lysine exporter protein LysE/YggA  28.04 
 
 
215 aa  94.7  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.593208  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  29.44 
 
 
214 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  29.7 
 
 
211 aa  94.4  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2019  lysine exporter protein LysE/YggA  25 
 
 
248 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.318946 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  31.6 
 
 
204 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1476  lysine exporter protein LysE/YggA  30.29 
 
 
212 aa  94.7  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.16 
 
 
204 aa  93.2  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  27.49 
 
 
211 aa  93.6  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  29.52 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0836  lysine exporter protein LysE/YggA  28.5 
 
 
207 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1060  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.41 
 
 
209 aa  92.8  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.741251  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2347  lysine exporter protein LysE/YggA  30.53 
 
 
207 aa  93.2  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  28.7 
 
 
217 aa  92.4  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0596  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.5 
 
 
230 aa  92  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  28.43 
 
 
214 aa  92  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  30.84 
 
 
204 aa  92  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  31.1 
 
 
206 aa  91.7  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  29.58 
 
 
208 aa  91.7  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30 
 
 
204 aa  91.3  9e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  30.84 
 
 
204 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  30.19 
 
 
204 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  29.38 
 
 
204 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  29.38 
 
 
204 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3097  lysine exporter protein LysE/YggA  27.19 
 
 
215 aa  90.5  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  28.91 
 
 
205 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  30.37 
 
 
204 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>