More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3040 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_3040  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
208 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.408857  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5326  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
208 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.692371  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4942  lysine exporter protein LysE/YggA  99.04 
 
 
208 aa  394  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.20679 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0322  lysine exporter protein LysE/YggA  92.82 
 
 
209 aa  345  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279488  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  40 
 
 
217 aa  154  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  43.35 
 
 
217 aa  152  4e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  39.52 
 
 
217 aa  150  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  46.08 
 
 
211 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  42.64 
 
 
203 aa  141  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1194  amino acid transporter LysE  41.94 
 
 
206 aa  139  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00235397  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.09 
 
 
208 aa  138  6e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1795  lysine exporter protein LysE/YggA  40.98 
 
 
212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40 
 
 
211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.15 
 
 
211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  41.5 
 
 
204 aa  132  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0286  lysine exporter protein LysE/YggA  39.35 
 
 
211 aa  131  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  40.1 
 
 
208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.272931  normal  0.707068 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  41 
 
 
227 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0387  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.62 
 
 
203 aa  129  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.45744 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  39.7 
 
 
204 aa  129  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  41 
 
 
204 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  41 
 
 
204 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.8 
 
 
208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  39.32 
 
 
211 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  39.32 
 
 
211 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  39.7 
 
 
204 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  39.32 
 
 
211 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1238  lysine exporter protein LysE/YggA  41.75 
 
 
212 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0801686  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.2 
 
 
218 aa  128  7.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  39.32 
 
 
211 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  39.32 
 
 
211 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  39.32 
 
 
211 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  39.32 
 
 
211 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0273  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.79 
 
 
205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  40.2 
 
 
204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0300  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.83 
 
 
206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  40.2 
 
 
204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  35.89 
 
 
213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  39.71 
 
 
213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2925  amino acid transporter LysE  33.99 
 
 
209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0920317  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  40.2 
 
 
204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  40.5 
 
 
204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  39.2 
 
 
204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.1 
 
 
218 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  40.7 
 
 
204 aa  126  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  34.76 
 
 
210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  40.19 
 
 
215 aa  124  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  37.93 
 
 
208 aa  124  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.61 
 
 
218 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.61 
 
 
208 aa  123  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.45 
 
 
209 aa  123  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3385  lysine exporter protein LysE/YggA  36.54 
 
 
214 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201071 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3063  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.24 
 
 
210 aa  122  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.07 
 
 
207 aa  122  4e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  38.83 
 
 
211 aa  121  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2775  lysine exporter protein LysE/YggA  37.31 
 
 
205 aa  121  8e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1790  lysine exporter protein  36.68 
 
 
202 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.217291  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4362  lysine exporter protein LysE/YggA  45.19 
 
 
211 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  38.83 
 
 
211 aa  119  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4114  amino acid efflux pump, RhtB family protein  40.1 
 
 
204 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  38.16 
 
 
208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  35.55 
 
 
213 aa  118  6e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2485  lysine exporter protein LysE/YggA  37.13 
 
 
204 aa  118  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.238287  normal  0.209 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  35.75 
 
 
211 aa  117  9e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  34.6 
 
 
210 aa  117  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  35.35 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126843  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  36.63 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  35.58 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0887  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.32 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02476  hypothetical protein  37.32 
 
 
211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.5 
 
 
208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  35.61 
 
 
209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5446  lysine exporter protein LysE/YggA  39.61 
 
 
214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0088  lysine exporter protein LysE/YggA  39.66 
 
 
219 aa  116  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  37.56 
 
 
214 aa  116  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1333  lysine exporter protein LysE/YggA  36.84 
 
 
212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8095  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.27 
 
 
225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0604  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.7 
 
 
204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0141585 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  35.51 
 
 
208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2043  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.21 
 
 
208 aa  115  5e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000125036  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0311  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.05 
 
 
214 aa  115  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  33.81 
 
 
210 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4486  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.99 
 
 
211 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5030  lysine exporter protein LysE/YggA  39.61 
 
 
242 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778866  normal  0.678911 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  32.84 
 
 
207 aa  114  7.999999999999999e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36 
 
 
208 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2405  lysine exporter protein LysE/YggA  38.65 
 
 
208 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4659  lysine exporter protein LysE/YggA  39.13 
 
 
208 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.80151  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3704  lysine exporter protein LysE/YggA  39.13 
 
 
208 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326067  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  32.86 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  33.33 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  32.86 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  34.47 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  39.11 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0893485  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0885  lysine exporter protein LysE/YggA  39.23 
 
 
218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347055  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  33.33 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  39.13 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2500  lysine exporter protein LysE/YggA  38.46 
 
 
213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106725  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1925  putative homoserine/threonine efflux protein  35.51 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82308e-38 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003627  putative threonine efflux protein  36.71 
 
 
231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>