More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2922 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2922  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
206 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2828  lysine exporter protein LysE/YggA  45.32 
 
 
202 aa  167  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192947  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3094  lysine exporter protein LysE/YggA  43.28 
 
 
205 aa  161  6e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2930  lysine exporter protein LysE/YggA  40.49 
 
 
205 aa  160  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000123984  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3991  lysine exporter protein LysE/YggA  40.69 
 
 
204 aa  159  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1147  normal  0.39027 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000550  putative threonine efflux protein  40.98 
 
 
204 aa  156  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1031  lysine exporter protein LysE/YggA  41.79 
 
 
204 aa  154  6e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0778058  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1064  lysine exporter protein LysE/YggA  41.79 
 
 
204 aa  154  6e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150207  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  41.79 
 
 
204 aa  154  8e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.55802  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0890  lysine exporter protein LysE/YggA  41.79 
 
 
204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3132  lysine exporter protein LysE/YggA  41.79 
 
 
204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0792555  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3224  lysine exporter protein LysE/YggA  41.79 
 
 
204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2833  amino acid transporter LysE  42.79 
 
 
208 aa  152  4e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.318432  normal  0.661514 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3328  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.29 
 
 
204 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.740014  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3076  lysine exporter protein LysE/YggA  39.42 
 
 
204 aa  150  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0391  hypothetical protein  42.08 
 
 
204 aa  150  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3657  amino acid transporter LysE  40.3 
 
 
229 aa  148  6e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0974  lysine exporter protein LysE/YggA  39.3 
 
 
204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.253527  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3692  lysine exporter protein (LysE/YggA)  38.07 
 
 
218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3318  lysine exporter protein LysE/YggA  41.09 
 
 
204 aa  143  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.3253  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1150  amino acid transporter LysE  36.65 
 
 
204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3935  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 
203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05339  putative threonine efflux protein  38.51 
 
 
187 aa  123  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0372  lysine exporter protein LysE/YggA  37.99 
 
 
217 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.83228  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  28.43 
 
 
209 aa  111  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1476  lysine exporter protein LysE/YggA  34.16 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0078  amino acid efflux protein  30.5 
 
 
205 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0468  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33 
 
 
215 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.521562  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43570  hypothetical protein  31.31 
 
 
213 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.443465  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3653  hypothetical protein  30.88 
 
 
213 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1920  amino acid transporter LysE  31.19 
 
 
212 aa  92.8  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1849  amino acid transporter LysE  31.19 
 
 
212 aa  92.8  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0233  RhtB family transporter  29.9 
 
 
209 aa  92  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.77 
 
 
212 aa  91.7  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  32.08 
 
 
212 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2779  amino acid efflux pump, RhtB family protein  31.61 
 
 
211 aa  90.9  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000004006  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6764  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.88 
 
 
211 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406386  normal  0.273065 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.27 
 
 
204 aa  90.1  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2796  lysine exporter protein LysE/YggA  24.53 
 
 
214 aa  90.1  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  27 
 
 
205 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0936  lysine exporter protein LysE/YggA  30.35 
 
 
212 aa  89.4  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.950459  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003257  threonine efflux protein  26.73 
 
 
211 aa  88.6  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0921  putative threonine efflux protein  27.87 
 
 
205 aa  88.6  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3644  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.76 
 
 
204 aa  88.2  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0717  lysine exporter protein LysE/YggA  29.41 
 
 
204 aa  88.2  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7469  lysine exporter protein LysE/YggA  28.86 
 
 
205 aa  87.8  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3537  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.98 
 
 
208 aa  87.8  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.575737  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3488  lysine exporter protein LysE/YggA  30.69 
 
 
223 aa  87  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2768  lysine exporter protein LysE/YggA  27.44 
 
 
221 aa  86.7  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3404  lysine exporter protein LysE/YggA  27.09 
 
 
211 aa  86.3  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325379  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0596  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.8 
 
 
230 aa  86.3  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.76 
 
 
204 aa  86.3  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0856  lysine exporter protein LysE/YggA  27.36 
 
 
200 aa  86.3  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.985682  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0668  lysine exporter protein LysE/YggA  28.19 
 
 
235 aa  85.9  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3688  lysine exporter protein LysE/YggA  28.19 
 
 
235 aa  85.5  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2461  lysine exporter protein LysE/YggA  30.54 
 
 
210 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283309  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0699  lysine exporter protein LysE/YggA  28.19 
 
 
235 aa  85.5  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2482  lysine exporter protein LysE/YggA  25.35 
 
 
224 aa  85.5  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  26.11 
 
 
206 aa  85.1  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  30.24 
 
 
209 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  26 
 
 
204 aa  84.7  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.613043 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  26.11 
 
 
206 aa  84.7  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  26.11 
 
 
206 aa  84.7  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3976  lysine exporter protein LysE/YggA  28.43 
 
 
205 aa  84.7  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  26 
 
 
204 aa  84.7  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  25.62 
 
 
206 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  25.62 
 
 
206 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  25.62 
 
 
206 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1641  lysine exporter protein LysE/YggA  25.85 
 
 
212 aa  84.3  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.950543  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5674  lysine exporter protein LysE/YggA  27 
 
 
205 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6038  lysine exporter protein LysE/YggA  27 
 
 
205 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0765  threonine efflux protein, putative  25.44 
 
 
234 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  25.5 
 
 
204 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1227  lysine exporter protein LysE/YggA  28.87 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0689  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.75 
 
 
235 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2939  lysine exporter protein LysE/YggA  31.22 
 
 
214 aa  83.6  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419308  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  29.13 
 
 
214 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  29.61 
 
 
214 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3366  lysine exporter protein LysE/YggA  26.32 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1147  transporter, LysE family  29.35 
 
 
210 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1800  threonine efflux protein, putative  24.53 
 
 
212 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4239  threonine efflux system  25.12 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.890135 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5054  lysine exporter protein LysE/YggA  29.7 
 
 
212 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199833  normal  0.295211 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0989  lysine exporter protein LysE/YggA  30.43 
 
 
210 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3909  lysine exporter protein LysE/YggA  31.63 
 
 
210 aa  82  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.806528  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4286  threonine efflux system  25.12 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.492935 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0699  amino acid transporter LysE  27.59 
 
 
204 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0691811  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4346  threonine efflux system  25.12 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.459932  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4167  threonine efflux system  25.12 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  25.62 
 
 
206 aa  81.3  0.000000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4188  threonine efflux system  25 
 
 
206 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1219  hypothetical protein  30.1 
 
 
219 aa  81.3  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14510  putative threonine efflux protein  36.09 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.93793  normal  0.0749541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0587  lysine exporter protein LysE/YggA  25.54 
 
 
236 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5352  lysine exporter protein LysE/YggA  28.21 
 
 
204 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1213  hypothetical protein  29.9 
 
 
219 aa  80.1  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3556  lysine exporter protein LysE/YggA  30.69 
 
 
212 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.384892 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  26.73 
 
 
205 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.94 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3536  lysine exporter protein LysE/YggA  25 
 
 
234 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>