More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2930 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2930  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 205 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000123984  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3094  lysine exporter protein LysE/YggA  75.98 
 
 		 205 aa  314  6e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0890  lysine exporter protein LysE/YggA  75 
 
 		 204 aa  311  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3132  lysine exporter protein LysE/YggA  75 
 
 		 204 aa  311  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0792555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3224  lysine exporter protein LysE/YggA  75 
 
 		 204 aa  311  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3657  amino acid transporter LysE  74.02 
 
 		 229 aa  310  9e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1064  lysine exporter protein LysE/YggA  74.51 
 
 		 204 aa  308  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150207  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1031  lysine exporter protein LysE/YggA  74.51 
 
 		 204 aa  308  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0778058  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  74.51 
 
 		 204 aa  308  4e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.55802  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3991  lysine exporter protein LysE/YggA  73.53 
 
 		 204 aa  307  5.9999999999999995e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1147  normal  0.39027 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3328  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  74.02 
 
 		 204 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.740014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3076  lysine exporter protein LysE/YggA  73.53 
 
 		 204 aa  301  3.0000000000000004e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0974  lysine exporter protein LysE/YggA  72.55 
 
 		 204 aa  298  3e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.253527  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3318  lysine exporter protein LysE/YggA  73.53 
 
 		 204 aa  291  4e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.3253  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3692  lysine exporter protein (LysE/YggA)  68.81 
 
 		 218 aa  288  4e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2833  amino acid transporter LysE  66.83 
 
 		 208 aa  278  4e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.318432  normal  0.661514 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000550  putative threonine efflux protein  54.95 
 
 		 204 aa  241  3.9999999999999997e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0391  hypothetical protein  57.21 
 
 		 204 aa  232  4.0000000000000004e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05339  putative threonine efflux protein  58.05 
 
 		 187 aa  219  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3935  lysine exporter protein LysE/YggA  50.99 
 
 		 203 aa  197  7e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2828  lysine exporter protein LysE/YggA  50.25 
 
 		 202 aa  190  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192947  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1150  amino acid transporter LysE  43.75 
 
 		 204 aa  162  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2922  lysine exporter protein LysE/YggA  40.49 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0372  lysine exporter protein LysE/YggA  39.13 
 
 		 217 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.83228  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43570  hypothetical protein  33.5 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.443465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  32.51 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  32.81 
 
 		 205 aa  101  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2482  lysine exporter protein LysE/YggA  32.56 
 
 		 224 aa  102  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5674  lysine exporter protein LysE/YggA  32.29 
 
 		 205 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6038  lysine exporter protein LysE/YggA  32.29 
 
 		 205 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  30.73 
 
 		 205 aa  99  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0717  lysine exporter protein LysE/YggA  32.18 
 
 		 204 aa  98.6  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  31.55 
 
 		 213 aa  98.6  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1435  amino acid transporter LysE  31.19 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.410501  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7469  lysine exporter protein LysE/YggA  32.8 
 
 		 205 aa  97.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1256  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30 
 
 		 205 aa  97.4  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3644  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.19 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.67 
 
 		 204 aa  96.3  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3653  hypothetical protein  31 
 
 		 213 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0596  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.71 
 
 		 230 aa  95.1  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  36.04 
 
 		 207 aa  94.7  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  30 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0078  amino acid efflux protein  27.27 
 
 		 205 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2796  lysine exporter protein LysE/YggA  29.77 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  30.05 
 
 		 217 aa  93.2  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2768  lysine exporter protein LysE/YggA  30.92 
 
 		 221 aa  93.6  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0921  putative threonine efflux protein  30.05 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0699  amino acid transporter LysE  32.12 
 
 		 204 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0691811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  30.32 
 
 		 204 aa  92  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3404  lysine exporter protein LysE/YggA  28.44 
 
 		 211 aa  91.3  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0051  amino acid transporter LysE  31.77 
 
 		 210 aa  91.3  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5352  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1213  hypothetical protein  31.35 
 
 		 219 aa  90.9  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2461  lysine exporter protein LysE/YggA  30.85 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283309  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1219  hypothetical protein  30.11 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2862  lysine exporter protein LysE/YggA  38.1 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.68 
 
 		 204 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2771  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.32 
 
 		 203 aa  89  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.19 
 
 		 211 aa  89  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3536  lysine exporter protein LysE/YggA  29.36 
 
 		 234 aa  88.6  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.96 
 
 		 211 aa  88.6  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3987  hypothetical protein  30.85 
 
 		 204 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3581  lysine exporter protein LysE/YggA  30.69 
 
 		 222 aa  88.2  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  32.09 
 
 		 222 aa  88.2  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1800  threonine efflux protein, putative  27.36 
 
 		 212 aa  88.2  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3976  lysine exporter protein LysE/YggA  31.16 
 
 		 205 aa  88.2  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.42 
 
 		 205 aa  87.8  9e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  31.22 
 
 		 203 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.955446 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  29.9 
 
 		 212 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3366  lysine exporter protein LysE/YggA  28.14 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0587  lysine exporter protein LysE/YggA  28.69 
 
 		 236 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0782  LysE family translocator protein  29.26 
 
 		 204 aa  87  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.492943  normal  0.203666 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2383  homoserine/threonine efflux protein, putative  26.9 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0009  lysine exporter protein LysE/YggA  28.28 
 
 		 245 aa  86.7  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0108149 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  27.75 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2043  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.33 
 
 		 208 aa  86.3  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000125036  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2939  lysine exporter protein LysE/YggA  31.86 
 
 		 214 aa  86.3  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419308  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  27.75 
 
 		 210 aa  85.9  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  28.27 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  27.75 
 
 		 210 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  28.27 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  27.75 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  27.75 
 
 		 210 aa  85.9  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0936  lysine exporter protein LysE/YggA  31.03 
 
 		 212 aa  85.9  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.950459  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3452  LysE family translocator protein  30.16 
 
 		 204 aa  85.9  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5915  LysE family transporter  30.96 
 
 		 204 aa  85.5  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.723016 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1757  lysine exporter protein LysE/YggA  27.05 
 
 		 214 aa  85.5  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.290271  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1731  lysine exporter protein LysE/YggA  27.98 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.820642  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0111  hypothetical protein  29.32 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0765  threonine efflux protein, putative  27.27 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  26.7 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  27.23 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  32.12 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.824462  normal  0.397861 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4118  RhtB family transporter  31.4 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2833  hypothetical protein  35.66 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1462  lysine exporter protein LysE/YggA  31.18 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29100  hypothetical protein  29.79 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136638 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  32.47 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  31.16 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1476  lysine exporter protein LysE/YggA  32.85 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>