More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2482 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2482  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 224 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0765  threonine efflux protein, putative  52.59 
 
 		 234 aa  229  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3366  lysine exporter protein LysE/YggA  53.39 
 
 		 234 aa  226  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0587  lysine exporter protein LysE/YggA  52.94 
 
 		 236 aa  225  4e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3536  lysine exporter protein LysE/YggA  54.51 
 
 		 234 aa  224  6e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1800  threonine efflux protein, putative  48.85 
 
 		 212 aa  216  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0689  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  53.65 
 
 		 235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0668  lysine exporter protein LysE/YggA  53.22 
 
 		 235 aa  215  4e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0699  lysine exporter protein LysE/YggA  53.22 
 
 		 235 aa  215  5e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3688  lysine exporter protein LysE/YggA  53.22 
 
 		 235 aa  214  7e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2796  lysine exporter protein LysE/YggA  50 
 
 		 214 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1757  lysine exporter protein LysE/YggA  51.38 
 
 		 214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.290271  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2363  lysine exporter protein LysE/YggA  47.52 
 
 		 249 aa  210  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1462  lysine exporter protein LysE/YggA  53.05 
 
 		 216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0694  lysine exporter protein LysE/YggA  53.57 
 
 		 227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1550  threonine efflux protein, putative  48.87 
 
 		 227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.306225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3653  hypothetical protein  38.81 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00347  threonine efflux system  45.05 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  40.29 
 
 		 222 aa  151  7e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002089  threonine efflux protein  44.81 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43570  hypothetical protein  37.9 
 
 		 213 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.443465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2461  lysine exporter protein LysE/YggA  37.33 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  31.75 
 
 		 209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  33.98 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2977  amino acid transporter LysE  34.48 
 
 		 228 aa  121  9e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0989  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3488  lysine exporter protein LysE/YggA  32.99 
 
 		 223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  33.02 
 
 		 206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  32.56 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1147  transporter, LysE family  32.52 
 
 		 210 aa  115  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  31.94 
 
 		 206 aa  115  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  31.94 
 
 		 204 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.613043 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  31.48 
 
 		 206 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  31.94 
 
 		 206 aa  114  7.999999999999999e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  31.48 
 
 		 204 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  31.48 
 
 		 206 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  31.94 
 
 		 206 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  31.48 
 
 		 206 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  31.94 
 
 		 204 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  31.6 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.19 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1219  hypothetical protein  34.78 
 
 		 219 aa  112  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  31.13 
 
 		 214 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1213  hypothetical protein  34.47 
 
 		 219 aa  112  5e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3976  lysine exporter protein LysE/YggA  31.46 
 
 		 205 aa  112  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  31.03 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7469  lysine exporter protein LysE/YggA  32.08 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4188  threonine efflux system  30.63 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3404  lysine exporter protein LysE/YggA  33.49 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4239  threonine efflux system  30.56 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.890135 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0391  hypothetical protein  32.86 
 
 		 204 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1641  lysine exporter protein LysE/YggA  28.29 
 
 		 212 aa  109  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.950543  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2768  lysine exporter protein LysE/YggA  29.21 
 
 		 221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  29.63 
 
 		 206 aa  108  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4346  threonine efflux system  30.56 
 
 		 206 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.459932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4167  threonine efflux system  30.56 
 
 		 206 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4286  threonine efflux system  30.56 
 
 		 206 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.492935 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0936  lysine exporter protein LysE/YggA  29.38 
 
 		 212 aa  108  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.950459  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1920  amino acid transporter LysE  28.64 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0111  hypothetical protein  30.69 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1849  amino acid transporter LysE  28.64 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4153  threonine efflux system  31.03 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000179823  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1256  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.25 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0556  threonine efflux system  31.22 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0219  threonine efflux system  31.22 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3963  threonine efflux system  31.03 
 
 		 207 aa  105  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245678  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3692  lysine exporter protein (LysE/YggA)  33.18 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02071  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.55 
 
 		 208 aa  105  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0424528  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  27.83 
 
 		 204 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3991  lysine exporter protein LysE/YggA  33.02 
 
 		 204 aa  105  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1147  normal  0.39027 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3997  threonine efflux system  30.73 
 
 		 206 aa  104  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  29.25 
 
 		 203 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.955446 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2059  lysine exporter protein LysE/YggA  29.95 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2431  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.16 
 
 		 209 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5352  lysine exporter protein LysE/YggA  31.37 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0699  amino acid transporter LysE  28.77 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0691811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  27.23 
 
 		 212 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  28.91 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1814  lysine exporter protein LysE/YggA  31.6 
 
 		 205 aa  102  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000397951  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2930  lysine exporter protein LysE/YggA  32.56 
 
 		 205 aa  102  7e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000123984  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2939  lysine exporter protein LysE/YggA  27.7 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2833  amino acid transporter LysE  30.1 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.318432  normal  0.661514 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5915  LysE family transporter  27.44 
 
 		 204 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.723016 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5674  lysine exporter protein LysE/YggA  29.15 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6038  lysine exporter protein LysE/YggA  29.15 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3328  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.7 
 
 		 204 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.740014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6400  lysine exporter protein LysE/YggA  26.07 
 
 		 215 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3657  amino acid transporter LysE  31.16 
 
 		 229 aa  99.4  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000550  putative threonine efflux protein  29.77 
 
 		 204 aa  99.4  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0009  lysine exporter protein LysE/YggA  26.13 
 
 		 245 aa  99.4  4e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0108149 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0890  lysine exporter protein LysE/YggA  31.16 
 
 		 204 aa  99  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3132  lysine exporter protein LysE/YggA  31.16 
 
 		 204 aa  99  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0792555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3224  lysine exporter protein LysE/YggA  31.16 
 
 		 204 aa  99  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2912  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.34 
 
 		 215 aa  99  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26160  hypothetical protein  29.19 
 
 		 204 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.519724  normal  0.19854 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1064  lysine exporter protein LysE/YggA  30.23 
 
 		 204 aa  98.2  9e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150207  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1031  lysine exporter protein LysE/YggA  30.23 
 
 		 204 aa  98.2  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0778058  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1060  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.87 
 
 		 209 aa  97.4  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.741251  normal  0.078929 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>