More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2461 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2461  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 210 aa  395  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3653  hypothetical protein  70.95 
 
 		 213 aa  264  7e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43570  hypothetical protein  70 
 
 		 213 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.443465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  46.83 
 
 		 222 aa  173  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1757  lysine exporter protein LysE/YggA  41.04 
 
 		 214 aa  155  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.290271  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1800  threonine efflux protein, putative  39.52 
 
 		 212 aa  154  7e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0765  threonine efflux protein, putative  39.39 
 
 		 234 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2796  lysine exporter protein LysE/YggA  37.74 
 
 		 214 aa  149  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3366  lysine exporter protein LysE/YggA  39.83 
 
 		 234 aa  149  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3536  lysine exporter protein LysE/YggA  39.83 
 
 		 234 aa  149  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00347  threonine efflux system  43.26 
 
 		 234 aa  148  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0587  lysine exporter protein LysE/YggA  39.91 
 
 		 236 aa  147  8e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2482  lysine exporter protein LysE/YggA  37.33 
 
 		 224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1462  lysine exporter protein LysE/YggA  44.98 
 
 		 216 aa  145  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002089  threonine efflux protein  44.02 
 
 		 223 aa  141  6e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0689  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.26 
 
 		 235 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3688  lysine exporter protein LysE/YggA  40.26 
 
 		 235 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0699  lysine exporter protein LysE/YggA  40.26 
 
 		 235 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0668  lysine exporter protein LysE/YggA  39.83 
 
 		 235 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0694  lysine exporter protein LysE/YggA  41.86 
 
 		 227 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2363  lysine exporter protein LysE/YggA  34.29 
 
 		 249 aa  124  9e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1550  threonine efflux protein, putative  37.33 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.306225  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1219  hypothetical protein  34.18 
 
 		 219 aa  114  7.999999999999999e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1213  hypothetical protein  34.36 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  35.75 
 
 		 207 aa  111  9e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.62 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0596  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.98 
 
 		 230 aa  108  7.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.13 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2939  lysine exporter protein LysE/YggA  30.69 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3987  hypothetical protein  34.54 
 
 		 204 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1256  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.32 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0717  lysine exporter protein LysE/YggA  31.73 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  34.2 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06605  putative threonine efflux protein  31.94 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  32.31 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  32.31 
 
 		 204 aa  102  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.613043 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  32.31 
 
 		 204 aa  102  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3644  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.13 
 
 		 204 aa  102  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  32.31 
 
 		 206 aa  102  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  32.31 
 
 		 206 aa  102  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0936  lysine exporter protein LysE/YggA  29.76 
 
 		 212 aa  101  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.950459  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  32.31 
 
 		 206 aa  101  8e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  32.29 
 
 		 204 aa  101  8e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  32.31 
 
 		 206 aa  101  8e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  32.31 
 
 		 206 aa  101  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7469  lysine exporter protein LysE/YggA  37.31 
 
 		 205 aa  101  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4239  threonine efflux system  31.77 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.890135 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  31.44 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4346  threonine efflux system  31.77 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.459932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4167  threonine efflux system  31.77 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4286  threonine efflux system  31.77 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.492935 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4188  threonine efflux system  31.77 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1920  amino acid transporter LysE  29.65 
 
 		 212 aa  99.8  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1849  amino acid transporter LysE  29.65 
 
 		 212 aa  99.8  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3997  threonine efflux system  29.9 
 
 		 206 aa  99.4  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  32.16 
 
 		 214 aa  99  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3581  lysine exporter protein LysE/YggA  32.12 
 
 		 222 aa  98.2  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29100  hypothetical protein  32.47 
 
 		 204 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136638 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3404  lysine exporter protein LysE/YggA  30.61 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  32.16 
 
 		 214 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3976  lysine exporter protein LysE/YggA  36.96 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3452  LysE family translocator protein  32.12 
 
 		 204 aa  97.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0782  LysE family translocator protein  32.12 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.492943  normal  0.203666 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  36.13 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0556  threonine efflux system  29.38 
 
 		 206 aa  97.1  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0219  threonine efflux system  29.38 
 
 		 206 aa  97.1  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.61 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  29.27 
 
 		 212 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1641  lysine exporter protein LysE/YggA  31.11 
 
 		 212 aa  96.3  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.950543  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4118  RhtB family transporter  29.5 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5674  lysine exporter protein LysE/YggA  36.65 
 
 		 205 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6038  lysine exporter protein LysE/YggA  36.65 
 
 		 205 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  30.77 
 
 		 206 aa  95.1  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2833  amino acid transporter LysE  34.83 
 
 		 208 aa  94.7  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.318432  normal  0.661514 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3963  threonine efflux system  32.29 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245678  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5915  LysE family transporter  32.02 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.723016 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2828  lysine exporter protein LysE/YggA  36.87 
 
 		 202 aa  93.6  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192947  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  36.67 
 
 		 205 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4153  threonine efflux system  31.77 
 
 		 207 aa  93.2  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000179823  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0618  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.31 
 
 		 211 aa  93.2  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2786  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.9 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.81 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6400  lysine exporter protein LysE/YggA  30.54 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2930  lysine exporter protein LysE/YggA  30.85 
 
 		 205 aa  90.5  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000123984  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000550  putative threonine efflux protein  32.34 
 
 		 204 aa  90.5  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0890  lysine exporter protein LysE/YggA  32.84 
 
 		 204 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3132  lysine exporter protein LysE/YggA  32.84 
 
 		 204 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0792555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2432  RhtB family transporter  39.44 
 
 		 207 aa  89.7  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.274649  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3224  lysine exporter protein LysE/YggA  32.84 
 
 		 204 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2768  lysine exporter protein LysE/YggA  29.21 
 
 		 221 aa  89  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1064  lysine exporter protein LysE/YggA  32.84 
 
 		 204 aa  89.4  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150207  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1031  lysine exporter protein LysE/YggA  32.84 
 
 		 204 aa  89.4  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0778058  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2239  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.9 
 
 		 204 aa  89  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.678713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  32.81 
 
 		 209 aa  89  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  32.84 
 
 		 204 aa  88.6  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.55802  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3692  lysine exporter protein (LysE/YggA)  33.18 
 
 		 218 aa  88.6  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3097  lysine exporter protein LysE/YggA  30.05 
 
 		 215 aa  88.6  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1071  putative RhtB protein  34 
 
 		 212 aa  88.6  6e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1814  lysine exporter protein LysE/YggA  32.07 
 
 		 205 aa  88.6  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000397951  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3657  amino acid transporter LysE  32 
 
 		 229 aa  87.8  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>