More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0782 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0782  LysE family translocator protein  100 
 
 
204 aa  407  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.492943  normal  0.203666 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3581  lysine exporter protein LysE/YggA  96.57 
 
 
222 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3452  LysE family translocator protein  96.08 
 
 
204 aa  373  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0717  lysine exporter protein LysE/YggA  79.8 
 
 
204 aa  333  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3644  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  78.92 
 
 
204 aa  331  4e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  78.43 
 
 
204 aa  330  8e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0596  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  75.37 
 
 
230 aa  310  1e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  75.86 
 
 
204 aa  308  5e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3987  hypothetical protein  75.86 
 
 
204 aa  287  9e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29100  hypothetical protein  75.37 
 
 
204 aa  286  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136638 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0111  hypothetical protein  35.9 
 
 
215 aa  134  9e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  37.69 
 
 
209 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0531  lysine exporter protein LysE/YggA  39.13 
 
 
203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0699  amino acid transporter LysE  36.73 
 
 
204 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0691811  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.73 
 
 
205 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3142  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.54 
 
 
208 aa  131  6.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0269907  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0530  amino acid transporter LysE  38.5 
 
 
203 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1435  amino acid transporter LysE  36.73 
 
 
210 aa  129  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.410501  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0921  putative threonine efflux protein  36.51 
 
 
205 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  37.62 
 
 
203 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.955446 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06605  putative threonine efflux protein  35.26 
 
 
203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0078  amino acid efflux protein  35.23 
 
 
205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  35.71 
 
 
204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  35.71 
 
 
205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1256  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.73 
 
 
205 aa  126  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1147  transporter, LysE family  36.14 
 
 
210 aa  125  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7469  lysine exporter protein LysE/YggA  34.18 
 
 
205 aa  125  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  34.18 
 
 
205 aa  124  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0490  lysine exporter protein LysE/YggA  36.27 
 
 
203 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3961  lysine exporter protein LysE/YggA  36.27 
 
 
203 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3778  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.27 
 
 
203 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3404  lysine exporter protein LysE/YggA  35.48 
 
 
211 aa  124  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325379  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5674  lysine exporter protein LysE/YggA  35.2 
 
 
205 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6038  lysine exporter protein LysE/YggA  35.2 
 
 
205 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3976  lysine exporter protein LysE/YggA  34.34 
 
 
205 aa  122  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02071  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.39 
 
 
208 aa  122  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0424528  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5352  lysine exporter protein LysE/YggA  36.55 
 
 
204 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0989  lysine exporter protein LysE/YggA  35.64 
 
 
210 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  32.84 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5915  LysE family transporter  33.67 
 
 
204 aa  117  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.723016 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1219  hypothetical protein  30.94 
 
 
219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2768  lysine exporter protein LysE/YggA  31.88 
 
 
221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  35.71 
 
 
204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.824462  normal  0.397861 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1213  hypothetical protein  30.39 
 
 
219 aa  114  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2059  lysine exporter protein LysE/YggA  35.05 
 
 
211 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  31.09 
 
 
212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1814  lysine exporter protein LysE/YggA  34.18 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000397951  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0936  lysine exporter protein LysE/YggA  33.68 
 
 
212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.950459  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26160  hypothetical protein  33.68 
 
 
204 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.519724  normal  0.19854 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  31.94 
 
 
209 aa  112  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2771  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.53 
 
 
203 aa  112  5e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2230  hypothetical protein  34.21 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1800  threonine efflux protein, putative  29.05 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2833  hypothetical protein  36.41 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1060  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.26 
 
 
209 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.741251  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2977  amino acid transporter LysE  31.43 
 
 
228 aa  107  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1731  lysine exporter protein LysE/YggA  33.85 
 
 
209 aa  106  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.820642  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2939  lysine exporter protein LysE/YggA  32.32 
 
 
214 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419308  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  32.38 
 
 
210 aa  106  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0286  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 
211 aa  105  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  32.38 
 
 
210 aa  104  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.49 
 
 
208 aa  104  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4118  RhtB family transporter  27.98 
 
 
213 aa  104  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  32.38 
 
 
210 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  32.38 
 
 
210 aa  103  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  32.38 
 
 
210 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  32.38 
 
 
210 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  31.9 
 
 
210 aa  103  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2796  lysine exporter protein LysE/YggA  29.21 
 
 
214 aa  103  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1920  amino acid transporter LysE  29.17 
 
 
212 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1849  amino acid transporter LysE  29.17 
 
 
212 aa  103  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02476  hypothetical protein  32.98 
 
 
211 aa  102  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0765  threonine efflux protein, putative  28.64 
 
 
234 aa  102  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2383  homoserine/threonine efflux protein, putative  31.9 
 
 
210 aa  101  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  31.84 
 
 
213 aa  101  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
209 aa  101  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0618  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.74 
 
 
211 aa  100  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  30.39 
 
 
208 aa  100  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  31.43 
 
 
210 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  34.33 
 
 
203 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  30.69 
 
 
222 aa  99.8  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3488  lysine exporter protein LysE/YggA  31.91 
 
 
223 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0493  lysine exporter protein LysE/YggA  30.53 
 
 
219 aa  99.8  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1550  threonine efflux protein, putative  31.36 
 
 
227 aa  99.8  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.306225  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  30.69 
 
 
206 aa  99.4  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  32.2 
 
 
206 aa  99  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3997  threonine efflux system  32.2 
 
 
206 aa  98.2  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2461  lysine exporter protein LysE/YggA  32.31 
 
 
210 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283309  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  33.51 
 
 
211 aa  98.2  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3366  lysine exporter protein LysE/YggA  29.69 
 
 
234 aa  98.2  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  32.35 
 
 
206 aa  97.8  8e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  32.35 
 
 
206 aa  97.8  8e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  32.35 
 
 
206 aa  97.8  8e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0556  threonine efflux system  32.2 
 
 
206 aa  98.2  8e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0219  threonine efflux system  32.2 
 
 
206 aa  98.2  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1150  amino acid transporter LysE  29.47 
 
 
204 aa  97.8  9e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1641  lysine exporter protein LysE/YggA  29.02 
 
 
212 aa  97.8  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.950543  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3142  amino acid transporter LysE  32.86 
 
 
218 aa  96.7  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142315  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4153  threonine efflux system  32.84 
 
 
207 aa  96.7  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000179823  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  29.9 
 
 
214 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>