More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3452 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3452  LysE family translocator protein  100 
 
 		 204 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3581  lysine exporter protein LysE/YggA  98.53 
 
 		 222 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0782  LysE family translocator protein  96.08 
 
 		 204 aa  373  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.492943  normal  0.203666 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3644  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  79.41 
 
 		 204 aa  332  2e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0717  lysine exporter protein LysE/YggA  79.31 
 
 		 204 aa  330  7.000000000000001e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  78.92 
 
 		 204 aa  330  9e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0596  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  74.38 
 
 		 230 aa  306  9e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  74.88 
 
 		 204 aa  303  8.000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3987  hypothetical protein  74.88 
 
 		 204 aa  284  7e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29100  hypothetical protein  74.38 
 
 		 204 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136638 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0531  lysine exporter protein LysE/YggA  39.67 
 
 		 203 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0111  hypothetical protein  35.38 
 
 		 215 aa  132  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0530  amino acid transporter LysE  38.5 
 
 		 203 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  36.18 
 
 		 209 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3142  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.56 
 
 		 208 aa  129  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0269907  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.2 
 
 		 205 aa  128  6e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0699  amino acid transporter LysE  35.2 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0691811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0921  putative threonine efflux protein  35.98 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1147  transporter, LysE family  36.14 
 
 		 210 aa  125  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1435  amino acid transporter LysE  36.22 
 
 		 210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.410501  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06605  putative threonine efflux protein  35.26 
 
 		 203 aa  125  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3778  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.79 
 
 		 203 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3961  lysine exporter protein LysE/YggA  36.79 
 
 		 203 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0490  lysine exporter protein LysE/YggA  36.79 
 
 		 203 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  36.14 
 
 		 203 aa  124  9e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.955446 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0078  amino acid efflux protein  36.79 
 
 		 205 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7469  lysine exporter protein LysE/YggA  33.67 
 
 		 205 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  34.69 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  34.69 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1256  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.2 
 
 		 205 aa  122  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5352  lysine exporter protein LysE/YggA  36.04 
 
 		 204 aa  122  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 		 205 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0989  lysine exporter protein LysE/YggA  35.64 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3976  lysine exporter protein LysE/YggA  33.85 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5674  lysine exporter protein LysE/YggA  34.18 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6038  lysine exporter protein LysE/YggA  34.18 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3404  lysine exporter protein LysE/YggA  34.41 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02071  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.41 
 
 		 208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0424528  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 		 209 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5915  LysE family transporter  33.67 
 
 		 204 aa  117  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.723016 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26160  hypothetical protein  34.21 
 
 		 204 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.519724  normal  0.19854 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1213  hypothetical protein  32.42 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1219  hypothetical protein  31.49 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2768  lysine exporter protein LysE/YggA  31.4 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2230  hypothetical protein  34.74 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  34.69 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.824462  normal  0.397861 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1814  lysine exporter protein LysE/YggA  33.67 
 
 		 205 aa  112  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000397951  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  31.09 
 
 		 212 aa  112  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2771  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.53 
 
 		 203 aa  111  9e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0936  lysine exporter protein LysE/YggA  30.73 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.950459  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2059  lysine exporter protein LysE/YggA  34.02 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  31.94 
 
 		 209 aa  108  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2833  hypothetical protein  35.87 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1060  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.67 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.741251  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2939  lysine exporter protein LysE/YggA  30.46 
 
 		 214 aa  105  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1800  threonine efflux protein, putative  29.05 
 
 		 212 aa  105  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0286  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 		 211 aa  105  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2796  lysine exporter protein LysE/YggA  30.2 
 
 		 214 aa  104  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2977  amino acid transporter LysE  30.95 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4118  RhtB family transporter  28.5 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1731  lysine exporter protein LysE/YggA  33.85 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.820642  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  32.38 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  33.82 
 
 		 206 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  33.82 
 
 		 206 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  30.88 
 
 		 208 aa  102  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4153  threonine efflux system  34.31 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000179823  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  33.82 
 
 		 206 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  32.38 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3963  threonine efflux system  34.31 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245678  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  32.99 
 
 		 204 aa  102  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  32.38 
 
 		 210 aa  101  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3997  threonine efflux system  33.17 
 
 		 206 aa  101  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  32.38 
 
 		 210 aa  101  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0219  threonine efflux system  33.17 
 
 		 206 aa  101  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0556  threonine efflux system  33.17 
 
 		 206 aa  101  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.55 
 
 		 208 aa  101  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  32.38 
 
 		 210 aa  101  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  32.38 
 
 		 210 aa  101  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  31.9 
 
 		 210 aa  101  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  31.19 
 
 		 222 aa  101  8e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  31.19 
 
 		 206 aa  101  9e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1920  amino acid transporter LysE  28.65 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1849  amino acid transporter LysE  28.65 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  30.73 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  34.54 
 
 		 209 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  33.33 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0618  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.74 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  33.33 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  33.17 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3488  lysine exporter protein LysE/YggA  30.85 
 
 		 223 aa  99.4  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  32.84 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  29.44 
 
 		 211 aa  99.4  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0765  threonine efflux protein, putative  28.64 
 
 		 234 aa  99.4  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4167  threonine efflux system  33.84 
 
 		 206 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4286  threonine efflux system  33.84 
 
 		 206 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.492935 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4346  threonine efflux system  33.84 
 
 		 206 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.459932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4188  threonine efflux system  33.84 
 
 		 206 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  29.08 
 
 		 211 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  29.08 
 
 		 211 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  29.08 
 
 		 211 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>