More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3644 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3644  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 204 aa  407  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  94.61 
 
 		 204 aa  389  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0717  lysine exporter protein LysE/YggA  82.27 
 
 		 204 aa  345  3e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  79.31 
 
 		 204 aa  329  2e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0596  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  77.34 
 
 		 230 aa  322  2e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3581  lysine exporter protein LysE/YggA  79.9 
 
 		 222 aa  321  6e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3452  LysE family translocator protein  79.41 
 
 		 204 aa  318  3.9999999999999996e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0782  LysE family translocator protein  78.92 
 
 		 204 aa  317  9e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.492943  normal  0.203666 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3987  hypothetical protein  74.88 
 
 		 204 aa  286  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29100  hypothetical protein  74.38 
 
 		 204 aa  285  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136638 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  41.71 
 
 		 209 aa  152  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.8 
 
 		 205 aa  142  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1147  transporter, LysE family  39 
 
 		 210 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  38.5 
 
 		 209 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1256  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.58 
 
 		 205 aa  136  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0989  lysine exporter protein LysE/YggA  38.5 
 
 		 210 aa  135  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5915  LysE family transporter  39.2 
 
 		 204 aa  134  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.723016 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1435  amino acid transporter LysE  38.78 
 
 		 210 aa  134  9e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.410501  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06605  putative threonine efflux protein  33.5 
 
 		 203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0111  hypothetical protein  36.84 
 
 		 215 aa  132  5e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3142  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.73 
 
 		 208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0269907  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  34.18 
 
 		 205 aa  129  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0936  lysine exporter protein LysE/YggA  37.24 
 
 		 212 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.950459  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0531  lysine exporter protein LysE/YggA  36.41 
 
 		 203 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0699  amino acid transporter LysE  37.24 
 
 		 204 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0691811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0078  amino acid efflux protein  35.42 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5352  lysine exporter protein LysE/YggA  38.58 
 
 		 204 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3404  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  36.22 
 
 		 204 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5674  lysine exporter protein LysE/YggA  34.34 
 
 		 205 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6038  lysine exporter protein LysE/YggA  34.34 
 
 		 205 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0530  amino acid transporter LysE  34.59 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  32.64 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4118  RhtB family transporter  32.65 
 
 		 213 aa  122  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  37.31 
 
 		 203 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.955446 
 
 
-
 
NC_004310  BR1920  amino acid transporter LysE  34.69 
 
 		 212 aa  122  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  34.69 
 
 		 205 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1219  hypothetical protein  31.67 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1849  amino acid transporter LysE  34.69 
 
 		 212 aa  122  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1814  lysine exporter protein LysE/YggA  36.73 
 
 		 205 aa  122  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000397951  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1213  hypothetical protein  32.02 
 
 		 219 aa  121  8e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0490  lysine exporter protein LysE/YggA  35.48 
 
 		 203 aa  121  8e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3778  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.48 
 
 		 203 aa  121  8e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3961  lysine exporter protein LysE/YggA  35.48 
 
 		 203 aa  121  8e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2939  lysine exporter protein LysE/YggA  35.5 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3976  lysine exporter protein LysE/YggA  34.36 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02071  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.82 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0424528  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0921  putative threonine efflux protein  32.8 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7469  lysine exporter protein LysE/YggA  32.65 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26160  hypothetical protein  35.79 
 
 		 204 aa  118  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.519724  normal  0.19854 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2230  hypothetical protein  36.32 
 
 		 204 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2833  hypothetical protein  38.59 
 
 		 212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  37.24 
 
 		 204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.824462  normal  0.397861 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  30.41 
 
 		 209 aa  115  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2768  lysine exporter protein LysE/YggA  30.92 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2059  lysine exporter protein LysE/YggA  32.45 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2977  amino acid transporter LysE  30.48 
 
 		 228 aa  112  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3488  lysine exporter protein LysE/YggA  34.57 
 
 		 223 aa  112  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0618  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.66 
 
 		 211 aa  112  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1060  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.12 
 
 		 209 aa  111  9e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.741251  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  33.66 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2771  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.98 
 
 		 203 aa  109  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  32.52 
 
 		 210 aa  108  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.5 
 
 		 212 aa  108  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  32.52 
 
 		 210 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  32.52 
 
 		 210 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  31.86 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  32.68 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  29.1 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  32.68 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  31.86 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  31.86 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  33.17 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2796  lysine exporter protein LysE/YggA  30.2 
 
 		 214 aa  106  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  31.66 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  34.13 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  30.39 
 
 		 208 aa  105  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  33.17 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2383  homoserine/threonine efflux protein, putative  33.97 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02476  hypothetical protein  35.64 
 
 		 211 aa  105  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  32.28 
 
 		 213 aa  105  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  32.84 
 
 		 211 aa  104  7e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  32.84 
 
 		 211 aa  104  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  32.84 
 
 		 211 aa  104  7e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  32.84 
 
 		 211 aa  104  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0391  hypothetical protein  34.52 
 
 		 204 aa  104  8e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1731  lysine exporter protein LysE/YggA  32.46 
 
 		 209 aa  104  9e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.820642  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  31.37 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  30.88 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.84 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1800  threonine efflux protein, putative  27.49 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1333  lysine exporter protein LysE/YggA  34.16 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  32.84 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  30.88 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  30.65 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  30.88 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1757  lysine exporter protein LysE/YggA  29.29 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.290271  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  31.16 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.613043 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1031  hypothetical protein  33.33 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.332162  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0219  threonine efflux system  31.22 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>