More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3488 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3488  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
223 aa  444  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  57.28 
 
 
209 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0989  lysine exporter protein LysE/YggA  56.94 
 
 
210 aa  237  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1147  transporter, LysE family  56.46 
 
 
210 aa  235  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  57.21 
 
 
209 aa  234  9e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1641  lysine exporter protein LysE/YggA  43.48 
 
 
212 aa  192  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.950543  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  46.89 
 
 
212 aa  189  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3404  lysine exporter protein LysE/YggA  47.8 
 
 
211 aa  188  4e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325379  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2059  lysine exporter protein LysE/YggA  47.42 
 
 
211 aa  185  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2977  amino acid transporter LysE  46.38 
 
 
228 aa  177  9e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02071  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.54 
 
 
208 aa  176  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0424528  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  48.96 
 
 
205 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7469  lysine exporter protein LysE/YggA  47.4 
 
 
205 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0618  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.58 
 
 
211 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2939  lysine exporter protein LysE/YggA  43.87 
 
 
214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419308  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3142  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.1 
 
 
208 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0269907  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1814  lysine exporter protein LysE/YggA  47.64 
 
 
205 aa  172  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000397951  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  46.94 
 
 
205 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3976  lysine exporter protein LysE/YggA  48.17 
 
 
205 aa  171  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5674  lysine exporter protein LysE/YggA  47.12 
 
 
205 aa  170  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6038  lysine exporter protein LysE/YggA  47.12 
 
 
205 aa  170  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0936  lysine exporter protein LysE/YggA  40.78 
 
 
212 aa  166  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.950459  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4118  RhtB family transporter  38.5 
 
 
213 aa  165  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1920  amino acid transporter LysE  40.87 
 
 
212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1849  amino acid transporter LysE  40.87 
 
 
212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26160  hypothetical protein  46.6 
 
 
204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.519724  normal  0.19854 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5352  lysine exporter protein LysE/YggA  46.6 
 
 
204 aa  162  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3675  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.31 
 
 
212 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.9 
 
 
205 aa  156  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5915  LysE family transporter  43.16 
 
 
204 aa  155  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.723016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0699  amino acid transporter LysE  44.39 
 
 
204 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0691811  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2230  hypothetical protein  44.5 
 
 
204 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0078  amino acid efflux protein  42.71 
 
 
205 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 
209 aa  148  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  42.78 
 
 
204 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1256  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.93 
 
 
205 aa  148  8e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06605  putative threonine efflux protein  41.62 
 
 
203 aa  144  7.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0009  lysine exporter protein LysE/YggA  31.69 
 
 
245 aa  144  1e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0108149 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  40.62 
 
 
203 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.955446 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0111  hypothetical protein  35.42 
 
 
215 aa  143  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  44.39 
 
 
204 aa  141  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.824462  normal  0.397861 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1435  amino acid transporter LysE  32.2 
 
 
210 aa  139  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.410501  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2768  lysine exporter protein LysE/YggA  36.45 
 
 
221 aa  135  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1213  hypothetical protein  39.66 
 
 
219 aa  131  7.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1219  hypothetical protein  39.23 
 
 
219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0921  putative threonine efflux protein  35.08 
 
 
205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0493  lysine exporter protein LysE/YggA  32.99 
 
 
219 aa  126  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3961  lysine exporter protein LysE/YggA  35.79 
 
 
203 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3142  amino acid transporter LysE  33.33 
 
 
218 aa  123  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142315  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0490  lysine exporter protein LysE/YggA  35.79 
 
 
203 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3778  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.79 
 
 
203 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  37.23 
 
 
208 aa  123  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0530  amino acid transporter LysE  33.86 
 
 
203 aa  122  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1060  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40 
 
 
209 aa  121  7e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.741251  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4188  threonine efflux system  36.23 
 
 
206 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4239  threonine efflux system  36.23 
 
 
206 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.890135 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  34.95 
 
 
207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4346  threonine efflux system  36.23 
 
 
206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.459932  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4286  threonine efflux system  36.23 
 
 
206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.492935 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2482  lysine exporter protein LysE/YggA  32.67 
 
 
224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0531  lysine exporter protein LysE/YggA  33.86 
 
 
203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4167  threonine efflux system  36.23 
 
 
206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  35.47 
 
 
204 aa  119  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.613043 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  36.27 
 
 
204 aa  119  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  35.47 
 
 
206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  36.27 
 
 
206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  36.27 
 
 
206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  33.83 
 
 
206 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  33.83 
 
 
206 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  33.83 
 
 
206 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  34.65 
 
 
204 aa  118  7e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  34.48 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  37.69 
 
 
206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1757  lysine exporter protein LysE/YggA  32.34 
 
 
214 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.290271  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0219  threonine efflux system  37.07 
 
 
206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0556  threonine efflux system  37.07 
 
 
206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0765  threonine efflux protein, putative  32.26 
 
 
234 aa  115  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3997  threonine efflux system  37.07 
 
 
206 aa  115  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3644  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.9 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0596  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.17 
 
 
230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.5 
 
 
204 aa  112  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2069  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.21 
 
 
213 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4153  threonine efflux system  36.46 
 
 
207 aa  112  7.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000179823  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3963  threonine efflux system  36.46 
 
 
207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245678  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29100  hypothetical protein  36.96 
 
 
204 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136638 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2796  lysine exporter protein LysE/YggA  34.63 
 
 
214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3987  hypothetical protein  36.96 
 
 
204 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3536  lysine exporter protein LysE/YggA  33.64 
 
 
234 aa  109  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0587  lysine exporter protein LysE/YggA  31.11 
 
 
236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3366  lysine exporter protein LysE/YggA  30.73 
 
 
234 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.85 
 
 
204 aa  107  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0699  lysine exporter protein LysE/YggA  31.51 
 
 
235 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0717  lysine exporter protein LysE/YggA  34.5 
 
 
204 aa  106  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0391  hypothetical protein  30.5 
 
 
204 aa  106  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1800  threonine efflux protein, putative  33.15 
 
 
212 aa  106  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0689  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.05 
 
 
235 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3688  lysine exporter protein LysE/YggA  31.51 
 
 
235 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00347  threonine efflux system  35.38 
 
 
234 aa  104  9e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0668  lysine exporter protein LysE/YggA  31.05 
 
 
235 aa  104  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2724  lysine exporter protein LysE/YggA  36.89 
 
 
204 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.138868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>