More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1435 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1435  amino acid transporter LysE  100 
 
 		 210 aa  424  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.410501  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1814  lysine exporter protein LysE/YggA  44.04 
 
 		 205 aa  161  8.000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000397951  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3976  lysine exporter protein LysE/YggA  41.26 
 
 		 205 aa  155  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1256  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.5 
 
 		 205 aa  153  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7469  lysine exporter protein LysE/YggA  39.8 
 
 		 205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.8 
 
 		 205 aa  150  8.999999999999999e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  38.81 
 
 		 205 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  39.22 
 
 		 205 aa  148  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  40.39 
 
 		 203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.955446 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0699  amino acid transporter LysE  38.31 
 
 		 204 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0691811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06605  putative threonine efflux protein  36.5 
 
 		 203 aa  145  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  38.31 
 
 		 204 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0111  hypothetical protein  37.31 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6038  lysine exporter protein LysE/YggA  38.81 
 
 		 205 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5674  lysine exporter protein LysE/YggA  38.81 
 
 		 205 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2939  lysine exporter protein LysE/YggA  36.23 
 
 		 214 aa  142  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5915  LysE family transporter  36.95 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.723016 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26160  hypothetical protein  38 
 
 		 204 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.519724  normal  0.19854 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3142  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.31 
 
 		 208 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0269907  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.24 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0936  lysine exporter protein LysE/YggA  33.82 
 
 		 212 aa  136  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.950459  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  36.76 
 
 		 209 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1920  amino acid transporter LysE  32.85 
 
 		 212 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1849  amino acid transporter LysE  32.85 
 
 		 212 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2230  hypothetical protein  38 
 
 		 204 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4118  RhtB family transporter  35.38 
 
 		 213 aa  135  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3644  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.78 
 
 		 204 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  38.81 
 
 		 204 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.824462  normal  0.397861 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  33.82 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3488  lysine exporter protein LysE/YggA  31.61 
 
 		 223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2768  lysine exporter protein LysE/YggA  33.03 
 
 		 221 aa  132  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3404  lysine exporter protein LysE/YggA  36.67 
 
 		 211 aa  132  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1147  transporter, LysE family  35.12 
 
 		 210 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3987  hypothetical protein  38.27 
 
 		 204 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5352  lysine exporter protein LysE/YggA  39.9 
 
 		 204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.76 
 
 		 204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0717  lysine exporter protein LysE/YggA  36.22 
 
 		 204 aa  129  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0009  lysine exporter protein LysE/YggA  32.19 
 
 		 245 aa  129  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0108149 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0989  lysine exporter protein LysE/YggA  34.62 
 
 		 210 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  34.17 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0531  lysine exporter protein LysE/YggA  36.95 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29100  hypothetical protein  36.73 
 
 		 204 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136638 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0530  amino acid transporter LysE  36.45 
 
 		 203 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3778  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.33 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3961  lysine exporter protein LysE/YggA  34.33 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0596  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.22 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0490  lysine exporter protein LysE/YggA  34.33 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02071  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.12 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0424528  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3581  lysine exporter protein LysE/YggA  37.24 
 
 		 222 aa  122  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0782  LysE family translocator protein  36.73 
 
 		 204 aa  122  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.492943  normal  0.203666 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  31.75 
 
 		 212 aa  122  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3675  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.82 
 
 		 212 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0921  putative threonine efflux protein  27.86 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0618  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.53 
 
 		 211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3452  LysE family translocator protein  36.22 
 
 		 204 aa  118  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1110  RhtB family transporter  35.57 
 
 		 209 aa  118  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3935  lysine exporter protein LysE/YggA  35.56 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0391  hypothetical protein  31.41 
 
 		 204 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1641  lysine exporter protein LysE/YggA  29.9 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.950543  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3991  lysine exporter protein LysE/YggA  31.89 
 
 		 204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1147  normal  0.39027 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2069  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.52 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2833  amino acid transporter LysE  30.41 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.318432  normal  0.661514 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3657  amino acid transporter LysE  30.99 
 
 		 229 aa  106  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0078  amino acid efflux protein  32.09 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3224  lysine exporter protein LysE/YggA  32.61 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0890  lysine exporter protein LysE/YggA  32.61 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3132  lysine exporter protein LysE/YggA  32.61 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0792555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3076  lysine exporter protein LysE/YggA  31.52 
 
 		 204 aa  106  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3692  lysine exporter protein (LysE/YggA)  30.81 
 
 		 218 aa  105  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  31.35 
 
 		 204 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.55802  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2059  lysine exporter protein LysE/YggA  31 
 
 		 211 aa  105  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1064  lysine exporter protein LysE/YggA  31.35 
 
 		 204 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150207  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1031  lysine exporter protein LysE/YggA  31.35 
 
 		 204 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0778058  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0974  lysine exporter protein LysE/YggA  32.61 
 
 		 204 aa  104  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.253527  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000550  putative threonine efflux protein  32.14 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1219  hypothetical protein  32.26 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1213  hypothetical protein  31.32 
 
 		 219 aa  101  7e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3328  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.27 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.740014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3318  lysine exporter protein LysE/YggA  31.35 
 
 		 204 aa  101  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.3253  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3094  lysine exporter protein LysE/YggA  29.95 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1060  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.1 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.741251  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  29.67 
 
 		 210 aa  98.2  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2977  amino acid transporter LysE  28.12 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  34.36 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2930  lysine exporter protein LysE/YggA  31.19 
 
 		 205 aa  97.4  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000123984  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  29.23 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  30.26 
 
 		 209 aa  96.7  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  28.64 
 
 		 217 aa  95.9  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  29.74 
 
 		 210 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  29.23 
 
 		 210 aa  95.5  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  29.23 
 
 		 210 aa  95.5  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  29.23 
 
 		 210 aa  95.1  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  29.23 
 
 		 210 aa  95.1  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2828  lysine exporter protein LysE/YggA  29.95 
 
 		 202 aa  95.1  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192947  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0493  lysine exporter protein LysE/YggA  28.71 
 
 		 219 aa  95.1  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2771  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30 
 
 		 203 aa  94  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.6 
 
 		 212 aa  94  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2617  lysine exporter protein LysE/YggA  30.22 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2383  homoserine/threonine efflux protein, putative  29.95 
 
 		 210 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  28.23 
 
 		 210 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.132575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>