More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0391 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0391  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  394  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000550  putative threonine efflux protein  77.94 
 
 		 204 aa  325  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05339  putative threonine efflux protein  79.89 
 
 		 187 aa  286  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3991  lysine exporter protein LysE/YggA  59.31 
 
 		 204 aa  248  4e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1147  normal  0.39027 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2833  amino acid transporter LysE  57.84 
 
 		 208 aa  246  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.318432  normal  0.661514 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3328  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  59.8 
 
 		 204 aa  246  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.740014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1031  lysine exporter protein LysE/YggA  59.31 
 
 		 204 aa  244  4e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0778058  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1064  lysine exporter protein LysE/YggA  59.31 
 
 		 204 aa  244  4e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150207  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  59.31 
 
 		 204 aa  244  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.55802  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3657  amino acid transporter LysE  58.82 
 
 		 229 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0890  lysine exporter protein LysE/YggA  58.82 
 
 		 204 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3132  lysine exporter protein LysE/YggA  58.82 
 
 		 204 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0792555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3224  lysine exporter protein LysE/YggA  58.82 
 
 		 204 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3076  lysine exporter protein LysE/YggA  59.31 
 
 		 204 aa  241  5e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0974  lysine exporter protein LysE/YggA  57.84 
 
 		 204 aa  239  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.253527  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3094  lysine exporter protein LysE/YggA  57.84 
 
 		 205 aa  239  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3692  lysine exporter protein (LysE/YggA)  55.05 
 
 		 218 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3318  lysine exporter protein LysE/YggA  60.29 
 
 		 204 aa  234  6e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.3253  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2930  lysine exporter protein LysE/YggA  57.21 
 
 		 205 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000123984  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3935  lysine exporter protein LysE/YggA  49.75 
 
 		 203 aa  206  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1150  amino acid transporter LysE  44.27 
 
 		 204 aa  176  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2828  lysine exporter protein LysE/YggA  46.53 
 
 		 202 aa  170  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192947  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2922  lysine exporter protein LysE/YggA  42.08 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0372  lysine exporter protein LysE/YggA  39.25 
 
 		 217 aa  127  8.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.83228  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0699  amino acid transporter LysE  39.41 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0691811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  39 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  31.71 
 
 		 209 aa  115  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1256  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.68 
 
 		 205 aa  114  7.999999999999999e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.79 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1435  amino acid transporter LysE  31.41 
 
 		 210 aa  111  9e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.410501  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2482  lysine exporter protein LysE/YggA  32.86 
 
 		 224 aa  109  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0078  amino acid efflux protein  30 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  38.31 
 
 		 203 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.955446 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  39.41 
 
 		 204 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.824462  normal  0.397861 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3644  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.52 
 
 		 204 aa  104  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.83 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.18 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.03 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3488  lysine exporter protein LysE/YggA  30.16 
 
 		 223 aa  102  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1757  lysine exporter protein LysE/YggA  31.28 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.290271  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.18 
 
 		 204 aa  99.8  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  31.63 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0717  lysine exporter protein LysE/YggA  34.52 
 
 		 204 aa  99  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1060  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.44 
 
 		 209 aa  98.6  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.741251  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.35 
 
 		 212 aa  98.6  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6038  lysine exporter protein LysE/YggA  30.61 
 
 		 205 aa  98.2  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5674  lysine exporter protein LysE/YggA  30.61 
 
 		 205 aa  98.2  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2796  lysine exporter protein LysE/YggA  30.77 
 
 		 214 aa  98.2  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06605  putative threonine efflux protein  32.57 
 
 		 203 aa  96.7  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  30.61 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0921  putative threonine efflux protein  30.65 
 
 		 205 aa  95.9  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  28.86 
 
 		 217 aa  95.5  5e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1800  threonine efflux protein, putative  30.39 
 
 		 212 aa  95.5  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5352  lysine exporter protein LysE/YggA  35.94 
 
 		 204 aa  94.7  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3976  lysine exporter protein LysE/YggA  31.63 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7469  lysine exporter protein LysE/YggA  31.12 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3404  lysine exporter protein LysE/YggA  28.16 
 
 		 211 aa  92  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2939  lysine exporter protein LysE/YggA  32.02 
 
 		 214 aa  92  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26160  hypothetical protein  31.84 
 
 		 204 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.519724  normal  0.19854 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  30.81 
 
 		 209 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1641  lysine exporter protein LysE/YggA  28.86 
 
 		 212 aa  91.3  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.950543  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1219  hypothetical protein  31.09 
 
 		 219 aa  91.3  9e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1343  LysE family translocator protein  37.75 
 
 		 210 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0111  hypothetical protein  30.81 
 
 		 215 aa  91.3  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1147  transporter, LysE family  31.68 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2833  hypothetical protein  35.26 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0596  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.83 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2230  hypothetical protein  31.84 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2768  lysine exporter protein LysE/YggA  30.24 
 
 		 221 aa  89.4  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1213  hypothetical protein  30.73 
 
 		 219 aa  89.4  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2771  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.59 
 
 		 203 aa  89.7  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1731  lysine exporter protein LysE/YggA  28.21 
 
 		 209 aa  88.6  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.820642  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3987  hypothetical protein  32.16 
 
 		 204 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3097  lysine exporter protein LysE/YggA  30.29 
 
 		 215 aa  88.2  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  29.29 
 
 		 210 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43570  hypothetical protein  32.02 
 
 		 213 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.443465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  30.96 
 
 		 217 aa  87.8  9e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2043  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.04 
 
 		 208 aa  87.8  9e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000125036  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0989  lysine exporter protein LysE/YggA  32.7 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02476  hypothetical protein  31.82 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  33.85 
 
 		 203 aa  87.4  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  32.35 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2495  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.16 
 
 		 211 aa  86.7  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000331121  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  28.72 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2383  homoserine/threonine efflux protein, putative  30.11 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  26.79 
 
 		 217 aa  86.7  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00347  threonine efflux system  31.4 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3653  hypothetical protein  32.84 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003627  putative threonine efflux protein  30.16 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  28.72 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  28.21 
 
 		 210 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  28.72 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  28.21 
 
 		 210 aa  85.5  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  28.21 
 
 		 210 aa  85.5  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29100  hypothetical protein  31.38 
 
 		 204 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136638 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1814  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 		 205 aa  85.1  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000397951  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0356  lysine exporter protein LysE/YggA  29.01 
 
 		 203 aa  85.1  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.404606 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0233  RhtB family transporter  32.81 
 
 		 209 aa  84.7  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02071  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.53 
 
 		 208 aa  84.7  8e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0424528  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2461  lysine exporter protein LysE/YggA  31.5 
 
 		 210 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283309  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>