More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7469 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7469  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
205 aa  403  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  91.22 
 
 
205 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6038  lysine exporter protein LysE/YggA  91.22 
 
 
205 aa  350  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5674  lysine exporter protein LysE/YggA  91.22 
 
 
205 aa  350  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  85.85 
 
 
205 aa  349  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3976  lysine exporter protein LysE/YggA  71.78 
 
 
205 aa  288  5.0000000000000004e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1814  lysine exporter protein LysE/YggA  69.8 
 
 
205 aa  255  4e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000397951  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5352  lysine exporter protein LysE/YggA  64.68 
 
 
204 aa  238  4e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26160  hypothetical protein  62.31 
 
 
204 aa  224  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.519724  normal  0.19854 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3142  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  59.41 
 
 
208 aa  224  7e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0269907  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2230  hypothetical protein  60.8 
 
 
204 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5915  LysE family transporter  52.24 
 
 
204 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.723016 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50.5 
 
 
205 aa  194  7e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0699  amino acid transporter LysE  53.17 
 
 
204 aa  194  9e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0691811  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  51.94 
 
 
204 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  50.99 
 
 
203 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.955446 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1256  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50.25 
 
 
205 aa  187  8e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  47.55 
 
 
209 aa  187  9e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  47.06 
 
 
209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1147  transporter, LysE family  47.06 
 
 
210 aa  180  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  53.17 
 
 
204 aa  177  7e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.824462  normal  0.397861 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0989  lysine exporter protein LysE/YggA  46.57 
 
 
210 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2768  lysine exporter protein LysE/YggA  43.19 
 
 
221 aa  177  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3488  lysine exporter protein LysE/YggA  47.34 
 
 
223 aa  171  5.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  43.15 
 
 
212 aa  165  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3404  lysine exporter protein LysE/YggA  44.55 
 
 
211 aa  160  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325379  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0618  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.67 
 
 
211 aa  158  6e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3675  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.69 
 
 
212 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0111  hypothetical protein  39.9 
 
 
215 aa  154  8e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1435  amino acid transporter LysE  39.8 
 
 
210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.410501  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1641  lysine exporter protein LysE/YggA  39.5 
 
 
212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.950543  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0936  lysine exporter protein LysE/YggA  39.13 
 
 
212 aa  149  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.950459  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2939  lysine exporter protein LysE/YggA  40.48 
 
 
214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419308  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06605  putative threonine efflux protein  38 
 
 
203 aa  145  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0490  lysine exporter protein LysE/YggA  40.7 
 
 
203 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3778  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.7 
 
 
203 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3961  lysine exporter protein LysE/YggA  40.7 
 
 
203 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1920  amino acid transporter LysE  39.32 
 
 
212 aa  143  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1849  amino acid transporter LysE  39.32 
 
 
212 aa  143  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0078  amino acid efflux protein  36.76 
 
 
205 aa  142  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0921  putative threonine efflux protein  39.51 
 
 
205 aa  142  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0531  lysine exporter protein LysE/YggA  41.21 
 
 
203 aa  141  7e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0530  amino acid transporter LysE  40.7 
 
 
203 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4118  RhtB family transporter  37.98 
 
 
213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2059  lysine exporter protein LysE/YggA  37.37 
 
 
211 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1110  RhtB family transporter  35.32 
 
 
209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02071  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.76 
 
 
208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0424528  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2977  amino acid transporter LysE  33.97 
 
 
228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1213  hypothetical protein  39.8 
 
 
219 aa  128  6e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1219  hypothetical protein  39.09 
 
 
219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0009  lysine exporter protein LysE/YggA  33.76 
 
 
245 aa  126  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0108149 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0717  lysine exporter protein LysE/YggA  31.98 
 
 
204 aa  120  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3644  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.65 
 
 
204 aa  119  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  33.67 
 
 
209 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  40.4 
 
 
213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.63 
 
 
204 aa  115  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0782  LysE family translocator protein  33.7 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.492943  normal  0.203666 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3581  lysine exporter protein LysE/YggA  33.15 
 
 
222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0596  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31 
 
 
230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3987  hypothetical protein  33.15 
 
 
204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3452  LysE family translocator protein  33.15 
 
 
204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.49 
 
 
204 aa  111  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.19 
 
 
212 aa  111  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29100  hypothetical protein  33.15 
 
 
204 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136638 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2482  lysine exporter protein LysE/YggA  32.08 
 
 
224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2069  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40 
 
 
213 aa  108  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3653  hypothetical protein  37.68 
 
 
213 aa  108  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6693  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.65 
 
 
190 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  34.98 
 
 
206 aa  107  9.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6764  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.68 
 
 
211 aa  106  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406386  normal  0.273065 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0100  lysine exporter protein LysE/YggA  34.95 
 
 
213 aa  106  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  33.5 
 
 
207 aa  105  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  36.92 
 
 
211 aa  105  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1060  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.05 
 
 
209 aa  105  6e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.741251  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  34.65 
 
 
214 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  33.5 
 
 
206 aa  104  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6400  lysine exporter protein LysE/YggA  33.65 
 
 
215 aa  104  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  33.5 
 
 
206 aa  104  9e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  33.5 
 
 
206 aa  104  9e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  32.67 
 
 
206 aa  104  9e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  33 
 
 
206 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  33 
 
 
206 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  33 
 
 
206 aa  103  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  33.17 
 
 
208 aa  104  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  33.5 
 
 
204 aa  104  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.613043 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  33.5 
 
 
204 aa  104  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3097  lysine exporter protein LysE/YggA  33.18 
 
 
215 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4286  threonine efflux system  33.5 
 
 
206 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.492935 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  35.11 
 
 
214 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4978  lysine exporter protein LysE/YggA  36.65 
 
 
207 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4188  threonine efflux system  33.01 
 
 
206 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4239  threonine efflux system  33.5 
 
 
206 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.890135 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4346  threonine efflux system  33.5 
 
 
206 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.459932  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4167  threonine efflux system  33.5 
 
 
206 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43570  hypothetical protein  35.9 
 
 
213 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.443465  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2779  amino acid efflux pump, RhtB family protein  34.22 
 
 
211 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000004006  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  35.55 
 
 
214 aa  102  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  28.71 
 
 
209 aa  102  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  32.04 
 
 
210 aa  102  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  32.51 
 
 
204 aa  102  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>