More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3142 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3142  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 208 aa  409  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0269907  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3976  lysine exporter protein LysE/YggA  60.98 
 
 		 205 aa  239  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  59.41 
 
 		 205 aa  224  6e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7469  lysine exporter protein LysE/YggA  59.41 
 
 		 205 aa  224  8e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  58.71 
 
 		 205 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1814  lysine exporter protein LysE/YggA  55.61 
 
 		 205 aa  213  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000397951  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5674  lysine exporter protein LysE/YggA  59.2 
 
 		 205 aa  211  7e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6038  lysine exporter protein LysE/YggA  59.2 
 
 		 205 aa  211  7e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5352  lysine exporter protein LysE/YggA  56.86 
 
 		 204 aa  204  7e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26160  hypothetical protein  55.83 
 
 		 204 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.519724  normal  0.19854 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2230  hypothetical protein  55.67 
 
 		 204 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  51.72 
 
 		 203 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.955446 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  52.2 
 
 		 209 aa  194  7e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0699  amino acid transporter LysE  53.17 
 
 		 204 aa  190  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0691811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5915  LysE family transporter  52.02 
 
 		 204 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.723016 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1147  transporter, LysE family  49.03 
 
 		 210 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  51.22 
 
 		 204 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0989  lysine exporter protein LysE/YggA  49.03 
 
 		 210 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  46.83 
 
 		 209 aa  177  9e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.6 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2768  lysine exporter protein LysE/YggA  45.5 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  52.68 
 
 		 204 aa  171  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.824462  normal  0.397861 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1256  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.08 
 
 		 205 aa  171  6.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3488  lysine exporter protein LysE/YggA  45.79 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06605  putative threonine efflux protein  44.12 
 
 		 203 aa  159  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0530  amino acid transporter LysE  39.5 
 
 		 203 aa  151  7e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0936  lysine exporter protein LysE/YggA  40.69 
 
 		 212 aa  151  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.950459  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0531  lysine exporter protein LysE/YggA  40 
 
 		 203 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0111  hypothetical protein  36.54 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1641  lysine exporter protein LysE/YggA  39.11 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.950543  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  40.69 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3778  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.81 
 
 		 203 aa  147  8e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3961  lysine exporter protein LysE/YggA  38.81 
 
 		 203 aa  147  8e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0490  lysine exporter protein LysE/YggA  38.81 
 
 		 203 aa  147  8e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1920  amino acid transporter LysE  41.18 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1849  amino acid transporter LysE  41.18 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2939  lysine exporter protein LysE/YggA  41.23 
 
 		 214 aa  143  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4118  RhtB family transporter  39.61 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0618  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.02 
 
 		 211 aa  142  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0078  amino acid efflux protein  38.46 
 
 		 205 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1110  RhtB family transporter  42.21 
 
 		 209 aa  141  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1435  amino acid transporter LysE  38.31 
 
 		 210 aa  139  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.410501  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2059  lysine exporter protein LysE/YggA  36.46 
 
 		 211 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3404  lysine exporter protein LysE/YggA  39.5 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0596  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.83 
 
 		 230 aa  132  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0921  putative threonine efflux protein  37.44 
 
 		 205 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1213  hypothetical protein  37.43 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3644  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.73 
 
 		 204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1219  hypothetical protein  37.37 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3675  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.83 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.86 
 
 		 204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.25 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02071  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.22 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0424528  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0009  lysine exporter protein LysE/YggA  31.91 
 
 		 245 aa  122  5e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0108149 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0717  lysine exporter protein LysE/YggA  36.89 
 
 		 204 aa  121  8e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0782  LysE family translocator protein  37.89 
 
 		 204 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.492943  normal  0.203666 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3581  lysine exporter protein LysE/YggA  36.84 
 
 		 222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  32.31 
 
 		 209 aa  118  7e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3452  LysE family translocator protein  36.84 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2977  amino acid transporter LysE  32.74 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3987  hypothetical protein  39.06 
 
 		 204 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29100  hypothetical protein  38.42 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136638 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1031  hypothetical protein  38.57 
 
 		 212 aa  108  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.332162  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02476  hypothetical protein  36.63 
 
 		 211 aa  108  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003627  putative threonine efflux protein  34.65 
 
 		 231 aa  105  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4188  threonine efflux system  31.37 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4239  threonine efflux system  31.34 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.890135 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0100  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.34 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1060  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.78 
 
 		 209 aa  99.8  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.741251  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4286  threonine efflux system  30.88 
 
 		 206 aa  99.4  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.492935 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4167  threonine efflux system  30.88 
 
 		 206 aa  99.4  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4346  threonine efflux system  30.88 
 
 		 206 aa  99.4  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.459932  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  32.68 
 
 		 206 aa  98.6  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  32.68 
 
 		 206 aa  98.6  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  32.68 
 
 		 206 aa  98.6  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  32.68 
 
 		 206 aa  98.6  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  32.68 
 
 		 206 aa  98.6  7e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  32.68 
 
 		 206 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1333  lysine exporter protein LysE/YggA  35.92 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2069  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.69 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  31.66 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  31.66 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.613043 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2796  lysine exporter protein LysE/YggA  30.52 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  29.29 
 
 		 222 aa  96.3  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1483  lysine exporter protein LysE/YggA  35.98 
 
 		 215 aa  96.3  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  31.16 
 
 		 204 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1238  lysine exporter protein LysE/YggA  34.93 
 
 		 212 aa  94.7  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0801686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34 
 
 		 212 aa  94.7  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3653  hypothetical protein  37.5 
 
 		 213 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4978  lysine exporter protein LysE/YggA  37.04 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2482  lysine exporter protein LysE/YggA  26.21 
 
 		 224 aa  93.2  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2771  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.9 
 
 		 203 aa  93.2  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  30.73 
 
 		 206 aa  93.2  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3935  lysine exporter protein LysE/YggA  30.73 
 
 		 203 aa  92.4  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  29.11 
 
 		 210 aa  92  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0765  threonine efflux protein, putative  28.83 
 
 		 234 aa  92  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2562  lysine exporter protein LysE/YggA  34.01 
 
 		 211 aa  92  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  40.2 
 
 		 213 aa  91.7  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  37 
 
 		 211 aa  91.3  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  37 
 
 		 211 aa  91.3  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>