More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_29100 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_29100  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136638 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3987  hypothetical protein  94.61 
 
 		 204 aa  364  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  77.45 
 
 		 204 aa  322  3e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0717  lysine exporter protein LysE/YggA  75 
 
 		 204 aa  312  1.9999999999999998e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0596  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  75.98 
 
 		 230 aa  310  6.999999999999999e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3644  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  74.38 
 
 		 204 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  74.88 
 
 		 204 aa  301  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0782  LysE family translocator protein  75.37 
 
 		 204 aa  288  4e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.492943  normal  0.203666 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3581  lysine exporter protein LysE/YggA  74.88 
 
 		 222 aa  288  4e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3452  LysE family translocator protein  74.38 
 
 		 204 aa  285  4e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  41.18 
 
 		 209 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1435  amino acid transporter LysE  36.73 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.410501  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  34.67 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5674  lysine exporter protein LysE/YggA  34.67 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6038  lysine exporter protein LysE/YggA  34.67 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1147  transporter, LysE family  37.62 
 
 		 210 aa  125  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0921  putative threonine efflux protein  33.16 
 
 		 205 aa  125  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1256  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.35 
 
 		 205 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0989  lysine exporter protein LysE/YggA  37.62 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0530  amino acid transporter LysE  38.38 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3404  lysine exporter protein LysE/YggA  35.45 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.86 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0111  hypothetical protein  34.87 
 
 		 215 aa  122  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2833  hypothetical protein  38.95 
 
 		 212 aa  122  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  38.12 
 
 		 209 aa  122  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0078  amino acid efflux protein  35.6 
 
 		 205 aa  121  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3142  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.83 
 
 		 208 aa  121  7e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0269907  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0531  lysine exporter protein LysE/YggA  38.04 
 
 		 203 aa  121  8e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7469  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3976  lysine exporter protein LysE/YggA  34.36 
 
 		 205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3961  lysine exporter protein LysE/YggA  36.79 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3778  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.79 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0490  lysine exporter protein LysE/YggA  36.79 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5915  LysE family transporter  35.57 
 
 		 204 aa  118  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.723016 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06605  putative threonine efflux protein  32.5 
 
 		 203 aa  118  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5352  lysine exporter protein LysE/YggA  36.04 
 
 		 204 aa  115  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3488  lysine exporter protein LysE/YggA  37.04 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26160  hypothetical protein  35.26 
 
 		 204 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.519724  normal  0.19854 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  33 
 
 		 205 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  37.13 
 
 		 203 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.955446 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02071  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40 
 
 		 208 aa  114  6.9999999999999995e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0424528  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2230  hypothetical protein  35.79 
 
 		 204 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  31.79 
 
 		 209 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  32.5 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0699  amino acid transporter LysE  35.53 
 
 		 204 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0691811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  34.01 
 
 		 204 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1814  lysine exporter protein LysE/YggA  34.34 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000397951  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0618  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.51 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1213  hypothetical protein  30.39 
 
 		 219 aa  109  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1219  hypothetical protein  30.39 
 
 		 219 aa  109  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2939  lysine exporter protein LysE/YggA  31.98 
 
 		 214 aa  108  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419308  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2977  amino acid transporter LysE  30 
 
 		 228 aa  107  9.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1060  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.43 
 
 		 209 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.741251  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4118  RhtB family transporter  29.74 
 
 		 213 aa  106  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2768  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1920  amino acid transporter LysE  33.33 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1849  amino acid transporter LysE  33.33 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2771  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.43 
 
 		 203 aa  105  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2500  lysine exporter protein LysE/YggA  36 
 
 		 213 aa  105  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106725  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0936  lysine exporter protein LysE/YggA  34.2 
 
 		 212 aa  105  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.950459  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0286  lysine exporter protein LysE/YggA  34.83 
 
 		 211 aa  104  9e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2059  lysine exporter protein LysE/YggA  32.28 
 
 		 211 aa  104  9e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  32.98 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.55802  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1641  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.950543  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31 
 
 		 212 aa  102  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1150  amino acid transporter LysE  32.11 
 
 		 204 aa  102  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  31.22 
 
 		 222 aa  101  7e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3657  amino acid transporter LysE  32.98 
 
 		 229 aa  101  8e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1031  lysine exporter protein LysE/YggA  32.46 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0778058  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1064  lysine exporter protein LysE/YggA  32.46 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150207  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1343  LysE family translocator protein  39.18 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  35.53 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.824462  normal  0.397861 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0493  lysine exporter protein LysE/YggA  29.03 
 
 		 219 aa  99.4  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2796  lysine exporter protein LysE/YggA  26.63 
 
 		 214 aa  99.4  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  32.06 
 
 		 210 aa  99  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2461  lysine exporter protein LysE/YggA  32.69 
 
 		 210 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  31.73 
 
 		 213 aa  98.6  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0890  lysine exporter protein LysE/YggA  34.38 
 
 		 204 aa  98.6  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3132  lysine exporter protein LysE/YggA  34.38 
 
 		 204 aa  98.6  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0792555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3224  lysine exporter protein LysE/YggA  34.38 
 
 		 204 aa  98.6  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3328  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.94 
 
 		 204 aa  98.2  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.740014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0219  threonine efflux system  33.01 
 
 		 206 aa  98.2  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0556  threonine efflux system  33.01 
 
 		 206 aa  98.2  7e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3076  lysine exporter protein LysE/YggA  34.18 
 
 		 204 aa  98.2  7e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3997  threonine efflux system  33.01 
 
 		 206 aa  98.2  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0009  lysine exporter protein LysE/YggA  29.36 
 
 		 245 aa  97.8  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0108149 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.5 
 
 		 211 aa  96.3  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0974  lysine exporter protein LysE/YggA  33.85 
 
 		 204 aa  95.9  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.253527  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  31.1 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2495  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.68 
 
 		 211 aa  95.5  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000331121  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  30.62 
 
 		 210 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1462  lysine exporter protein LysE/YggA  30.57 
 
 		 216 aa  95.9  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3142  amino acid transporter LysE  30.84 
 
 		 218 aa  95.5  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142315  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1701  amino acid transporter LysE  28.43 
 
 		 208 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0912104  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3991  lysine exporter protein LysE/YggA  32.29 
 
 		 204 aa  95.1  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1147  normal  0.39027 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2383  homoserine/threonine efflux protein, putative  30.62 
 
 		 210 aa  95.1  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  30.62 
 
 		 210 aa  95.1  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  30.62 
 
 		 210 aa  95.1  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  30.62 
 
 		 210 aa  95.1  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0391  hypothetical protein  32.84 
 
 		 204 aa  95.1  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>