More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3404 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3404  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 211 aa  421  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  51.92 
 
 		 212 aa  215  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1641  lysine exporter protein LysE/YggA  50 
 
 		 212 aa  213  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.950543  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  47.8 
 
 		 209 aa  203  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0618  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  51.96 
 
 		 211 aa  198  3.9999999999999996e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  47.39 
 
 		 209 aa  195  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1147  transporter, LysE family  48.28 
 
 		 210 aa  192  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0989  lysine exporter protein LysE/YggA  48.28 
 
 		 210 aa  190  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3488  lysine exporter protein LysE/YggA  47.72 
 
 		 223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2059  lysine exporter protein LysE/YggA  44.62 
 
 		 211 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7469  lysine exporter protein LysE/YggA  44.55 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02071  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.17 
 
 		 208 aa  160  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0424528  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  43.22 
 
 		 205 aa  155  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2977  amino acid transporter LysE  37.56 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3976  lysine exporter protein LysE/YggA  42.93 
 
 		 205 aa  154  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  42.57 
 
 		 205 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5674  lysine exporter protein LysE/YggA  43.07 
 
 		 205 aa  153  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6038  lysine exporter protein LysE/YggA  43.07 
 
 		 205 aa  153  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4118  RhtB family transporter  40 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1814  lysine exporter protein LysE/YggA  41.87 
 
 		 205 aa  146  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000397951  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1256  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.27 
 
 		 205 aa  146  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5352  lysine exporter protein LysE/YggA  39.3 
 
 		 204 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_004310  BR1920  amino acid transporter LysE  40.2 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1849  amino acid transporter LysE  40.2 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0078  amino acid efflux protein  39.6 
 
 		 205 aa  142  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2939  lysine exporter protein LysE/YggA  39.52 
 
 		 214 aa  141  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419308  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0699  amino acid transporter LysE  40.31 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0691811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  33.82 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3675  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.83 
 
 		 212 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.75 
 
 		 205 aa  139  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0936  lysine exporter protein LysE/YggA  39.51 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.950459  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5915  LysE family transporter  36.1 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.723016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  38.22 
 
 		 203 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.955446 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1219  hypothetical protein  37.97 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3142  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.5 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0269907  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1213  hypothetical protein  37.84 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  38.22 
 
 		 204 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1435  amino acid transporter LysE  36.67 
 
 		 210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.410501  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0111  hypothetical protein  36.54 
 
 		 215 aa  131  7.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0009  lysine exporter protein LysE/YggA  31.2 
 
 		 245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0108149 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  39.79 
 
 		 204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.824462  normal  0.397861 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3644  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26160  hypothetical protein  36.27 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.519724  normal  0.19854 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.34 
 
 		 204 aa  122  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.84 
 
 		 204 aa  121  8e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1110  RhtB family transporter  35.92 
 
 		 209 aa  121  8e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06605  putative threonine efflux protein  33.82 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0596  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.94 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0717  lysine exporter protein LysE/YggA  33.85 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2768  lysine exporter protein LysE/YggA  32.84 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0921  putative threonine efflux protein  36.59 
 
 		 205 aa  118  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3987  hypothetical protein  36.69 
 
 		 204 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0782  LysE family translocator protein  35 
 
 		 204 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.492943  normal  0.203666 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2230  hypothetical protein  35.75 
 
 		 204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0490  lysine exporter protein LysE/YggA  31 
 
 		 203 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3961  lysine exporter protein LysE/YggA  31 
 
 		 203 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3778  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31 
 
 		 203 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0493  lysine exporter protein LysE/YggA  30.41 
 
 		 219 aa  115  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3581  lysine exporter protein LysE/YggA  33.89 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29100  hypothetical protein  37.28 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136638 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3142  amino acid transporter LysE  30.26 
 
 		 218 aa  112  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142315  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3452  LysE family translocator protein  33.89 
 
 		 204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0531  lysine exporter protein LysE/YggA  33 
 
 		 203 aa  111  9e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1800  threonine efflux protein, putative  32.29 
 
 		 212 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2482  lysine exporter protein LysE/YggA  33.49 
 
 		 224 aa  109  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1060  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.21 
 
 		 209 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.741251  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0765  threonine efflux protein, putative  29.91 
 
 		 234 aa  108  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2069  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.65 
 
 		 213 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1757  lysine exporter protein LysE/YggA  31.22 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.290271  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0530  amino acid transporter LysE  30.35 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3366  lysine exporter protein LysE/YggA  28.44 
 
 		 234 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0587  lysine exporter protein LysE/YggA  26.27 
 
 		 236 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2796  lysine exporter protein LysE/YggA  32.99 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3536  lysine exporter protein LysE/YggA  28.76 
 
 		 234 aa  102  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  28.79 
 
 		 222 aa  102  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.85 
 
 		 211 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  35.85 
 
 		 211 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  38.64 
 
 		 211 aa  101  7e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  38.64 
 
 		 211 aa  101  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  35.85 
 
 		 211 aa  101  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  38.64 
 
 		 211 aa  101  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  38.64 
 
 		 211 aa  101  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2239  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.74 
 
 		 204 aa  101  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.678713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  33.7 
 
 		 207 aa  101  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.66 
 
 		 218 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  32.63 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1841  lysine exporter protein LysE/YggA  31.37 
 
 		 216 aa  99.4  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000006365 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3688  lysine exporter protein LysE/YggA  28.12 
 
 		 235 aa  99.4  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0689  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.12 
 
 		 235 aa  99  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43570  hypothetical protein  29.95 
 
 		 213 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.443465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0699  lysine exporter protein LysE/YggA  28.11 
 
 		 235 aa  98.2  8e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  32.78 
 
 		 208 aa  97.4  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2461  lysine exporter protein LysE/YggA  30.61 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.57 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0668  lysine exporter protein LysE/YggA  27.65 
 
 		 235 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  35.29 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0399  putative transport protein  33.33 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0459  putative transport protein  33.33 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321828 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0396  putative transport protein  33.33 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979225  hitchhiker  0.00000000000454708 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3076  lysine exporter protein LysE/YggA  30.35 
 
 		 204 aa  96.3  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>