More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0765 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0765  threonine efflux protein, putative  100 
 
 		 234 aa  462  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3366  lysine exporter protein LysE/YggA  81.55 
 
 		 234 aa  374  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0587  lysine exporter protein LysE/YggA  80.85 
 
 		 236 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3536  lysine exporter protein LysE/YggA  81.12 
 
 		 234 aa  371  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0668  lysine exporter protein LysE/YggA  70.17 
 
 		 235 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0699  lysine exporter protein LysE/YggA  69.75 
 
 		 235 aa  304  8.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0689  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  69.33 
 
 		 235 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3688  lysine exporter protein LysE/YggA  69.33 
 
 		 235 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0694  lysine exporter protein LysE/YggA  70.39 
 
 		 227 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1800  threonine efflux protein, putative  55.41 
 
 		 212 aa  249  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2363  lysine exporter protein LysE/YggA  54.92 
 
 		 249 aa  246  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2796  lysine exporter protein LysE/YggA  53.68 
 
 		 214 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2482  lysine exporter protein LysE/YggA  52.59 
 
 		 224 aa  229  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1757  lysine exporter protein LysE/YggA  50 
 
 		 214 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.290271  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1462  lysine exporter protein LysE/YggA  51.72 
 
 		 216 aa  209  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1550  threonine efflux protein, putative  49.15 
 
 		 227 aa  186  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.306225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  41.63 
 
 		 222 aa  161  8.000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3653  hypothetical protein  38.79 
 
 		 213 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43570  hypothetical protein  39.22 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.443465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2461  lysine exporter protein LysE/YggA  39.39 
 
 		 210 aa  152  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00347  threonine efflux system  41.67 
 
 		 234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002089  threonine efflux protein  41.33 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1219  hypothetical protein  34.4 
 
 		 219 aa  126  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1213  hypothetical protein  33.64 
 
 		 219 aa  125  5e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2977  amino acid transporter LysE  32.71 
 
 		 228 aa  125  6e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  32.89 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2059  lysine exporter protein LysE/YggA  32.13 
 
 		 211 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3488  lysine exporter protein LysE/YggA  32.55 
 
 		 223 aa  114  8.999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  30.67 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  29.91 
 
 		 207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0111  hypothetical protein  29.6 
 
 		 215 aa  111  8.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02071  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.48 
 
 		 208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0424528  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3404  lysine exporter protein LysE/YggA  29.91 
 
 		 211 aa  108  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0989  lysine exporter protein LysE/YggA  29.78 
 
 		 210 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4239  threonine efflux system  28.32 
 
 		 206 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.890135 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  27.43 
 
 		 208 aa  108  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4286  threonine efflux system  28.32 
 
 		 206 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.492935 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4167  threonine efflux system  28.32 
 
 		 206 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4346  threonine efflux system  28.32 
 
 		 206 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.459932  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1147  transporter, LysE family  29.78 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0556  threonine efflux system  28.63 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0219  threonine efflux system  28.63 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4188  threonine efflux system  28.12 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3997  threonine efflux system  28.19 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  29.68 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  26.55 
 
 		 206 aa  105  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06605  putative threonine efflux protein  29.91 
 
 		 203 aa  105  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  27.88 
 
 		 206 aa  105  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4153  threonine efflux system  29.82 
 
 		 207 aa  105  8e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000179823  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  27.43 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  27.43 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  27.88 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  27.68 
 
 		 204 aa  104  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.613043 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  27.43 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  27.88 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3963  threonine efflux system  29.82 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245678  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  27.68 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  27.63 
 
 		 206 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0596  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.77 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  27.23 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2768  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 		 221 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.57 
 
 		 204 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  30.3 
 
 		 214 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3644  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.57 
 
 		 204 aa  101  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  29.87 
 
 		 214 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3142  amino acid transporter LysE  29.24 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142315  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0493  lysine exporter protein LysE/YggA  31.17 
 
 		 219 aa  99.8  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0782  LysE family translocator protein  29.85 
 
 		 204 aa  99  6e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.492943  normal  0.203666 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3581  lysine exporter protein LysE/YggA  29.85 
 
 		 222 aa  97.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.52 
 
 		 204 aa  97.4  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3452  LysE family translocator protein  29.85 
 
 		 204 aa  96.3  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  28.91 
 
 		 212 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0009  lysine exporter protein LysE/YggA  26.29 
 
 		 245 aa  95.1  7e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0108149 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0699  amino acid transporter LysE  26.58 
 
 		 204 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0691811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1641  lysine exporter protein LysE/YggA  27.06 
 
 		 212 aa  94.7  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.950543  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0717  lysine exporter protein LysE/YggA  26.03 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2833  amino acid transporter LysE  28.57 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.318432  normal  0.661514 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  26.13 
 
 		 203 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.955446 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1060  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.55 
 
 		 209 aa  92  6e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.741251  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3142  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.83 
 
 		 208 aa  92  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0269907  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4118  RhtB family transporter  26.01 
 
 		 213 aa  91.3  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2939  lysine exporter protein LysE/YggA  26.34 
 
 		 214 aa  90.5  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  26.13 
 
 		 204 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1849  amino acid transporter LysE  26.01 
 
 		 212 aa  89.7  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1920  amino acid transporter LysE  26.01 
 
 		 212 aa  89.7  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0921  putative threonine efflux protein  27.31 
 
 		 205 aa  89.7  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3692  lysine exporter protein (LysE/YggA)  28.33 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0078  amino acid efflux protein  23.71 
 
 		 205 aa  89  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6400  lysine exporter protein LysE/YggA  27.65 
 
 		 215 aa  88.6  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0936  lysine exporter protein LysE/YggA  26.01 
 
 		 212 aa  88.6  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.950459  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000550  putative threonine efflux protein  28.51 
 
 		 204 aa  88.2  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05080  putative threonine efflux protein  28.9 
 
 		 224 aa  87.8  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3328  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.06 
 
 		 204 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.740014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1031  lysine exporter protein LysE/YggA  29.06 
 
 		 204 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0778058  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1064  lysine exporter protein LysE/YggA  29.06 
 
 		 204 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150207  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0100  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.15 
 
 		 234 aa  86.7  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5915  LysE family transporter  25.78 
 
 		 204 aa  87  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.723016 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2912  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.96 
 
 		 215 aa  86.7  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  29.06 
 
 		 204 aa  86.3  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.55802  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  27.57 
 
 		 205 aa  85.9  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.666323 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>