More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3653 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3653  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43570  hypothetical protein  93.9 
 
 		 213 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.443465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2461  lysine exporter protein LysE/YggA  70.95 
 
 		 210 aa  264  7e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  46.08 
 
 		 222 aa  167  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0765  threonine efflux protein, putative  38.79 
 
 		 234 aa  159  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1800  threonine efflux protein, putative  39.9 
 
 		 212 aa  158  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3536  lysine exporter protein LysE/YggA  41.3 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1757  lysine exporter protein LysE/YggA  40.85 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.290271  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3366  lysine exporter protein LysE/YggA  40.43 
 
 		 234 aa  156  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2482  lysine exporter protein LysE/YggA  38.81 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002089  threonine efflux protein  45.16 
 
 		 223 aa  155  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00347  threonine efflux system  43.06 
 
 		 234 aa  155  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2796  lysine exporter protein LysE/YggA  37.74 
 
 		 214 aa  155  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0587  lysine exporter protein LysE/YggA  40.52 
 
 		 236 aa  154  9e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1462  lysine exporter protein LysE/YggA  44.71 
 
 		 216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0668  lysine exporter protein LysE/YggA  40.6 
 
 		 235 aa  151  8e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3688  lysine exporter protein LysE/YggA  40.17 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0699  lysine exporter protein LysE/YggA  40.6 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0689  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.17 
 
 		 235 aa  148  6e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0694  lysine exporter protein LysE/YggA  42.13 
 
 		 227 aa  139  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2363  lysine exporter protein LysE/YggA  35.27 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1219  hypothetical protein  33.67 
 
 		 219 aa  124  7e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1213  hypothetical protein  33.33 
 
 		 219 aa  122  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1550  threonine efflux protein, putative  37.27 
 
 		 227 aa  122  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.306225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  38.14 
 
 		 209 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1849  amino acid transporter LysE  31.66 
 
 		 212 aa  111  8.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1920  amino acid transporter LysE  31.66 
 
 		 212 aa  111  8.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0936  lysine exporter protein LysE/YggA  32.12 
 
 		 212 aa  111  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.950459  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2939  lysine exporter protein LysE/YggA  31.53 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7469  lysine exporter protein LysE/YggA  37.68 
 
 		 205 aa  108  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4118  RhtB family transporter  30 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06605  putative threonine efflux protein  33.16 
 
 		 203 aa  105  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5352  lysine exporter protein LysE/YggA  38.14 
 
 		 204 aa  106  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.44 
 
 		 205 aa  105  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0596  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.71 
 
 		 230 aa  105  7e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0989  lysine exporter protein LysE/YggA  36.76 
 
 		 210 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  35.78 
 
 		 209 aa  105  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1814  lysine exporter protein LysE/YggA  35.38 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000397951  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  35.55 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1147  transporter, LysE family  36.68 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3987  hypothetical protein  35.42 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5446  lysine exporter protein LysE/YggA  42.6 
 
 		 214 aa  102  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  34.78 
 
 		 205 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.02 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0111  hypothetical protein  30 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.04 
 
 		 204 aa  99.8  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  32.64 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2828  lysine exporter protein LysE/YggA  37.5 
 
 		 202 aa  99.8  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192947  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  29.44 
 
 		 209 aa  99.4  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  30.26 
 
 		 213 aa  99.8  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3976  lysine exporter protein LysE/YggA  35.75 
 
 		 205 aa  99.4  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5674  lysine exporter protein LysE/YggA  35.75 
 
 		 205 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6038  lysine exporter protein LysE/YggA  35.75 
 
 		 205 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  35.71 
 
 		 204 aa  98.6  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1256  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.53 
 
 		 205 aa  98.2  8e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2833  amino acid transporter LysE  33.17 
 
 		 208 aa  98.2  8e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.318432  normal  0.661514 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  33.5 
 
 		 214 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  32.54 
 
 		 203 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.955446 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  34.29 
 
 		 204 aa  97.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  31.79 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  35.24 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0890  lysine exporter protein LysE/YggA  31.25 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3132  lysine exporter protein LysE/YggA  31.25 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0792555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  35.24 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3224  lysine exporter protein LysE/YggA  31.25 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.53 
 
 		 204 aa  96.3  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02071  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.1 
 
 		 208 aa  96.3  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0424528  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  30.61 
 
 		 208 aa  96.3  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1641  lysine exporter protein LysE/YggA  28.64 
 
 		 212 aa  96.3  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.950543  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2043  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.38 
 
 		 208 aa  96.7  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000125036  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2768  lysine exporter protein LysE/YggA  30.39 
 
 		 221 aa  95.9  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3963  threonine efflux system  31.79 
 
 		 207 aa  95.9  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245678  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  30.2 
 
 		 212 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1031  lysine exporter protein LysE/YggA  31.73 
 
 		 204 aa  95.5  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0778058  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1064  lysine exporter protein LysE/YggA  31.73 
 
 		 204 aa  95.5  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150207  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4153  threonine efflux system  31.79 
 
 		 207 aa  95.5  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000179823  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0618  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.98 
 
 		 211 aa  95.1  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2930  lysine exporter protein LysE/YggA  31 
 
 		 205 aa  95.1  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000123984  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3488  lysine exporter protein LysE/YggA  32.12 
 
 		 223 aa  95.1  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3142  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.5 
 
 		 208 aa  94.7  9e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0269907  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  32.5 
 
 		 214 aa  94  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  31.73 
 
 		 204 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.55802  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29100  hypothetical protein  32.98 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136638 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3657  amino acid transporter LysE  29.81 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2922  lysine exporter protein LysE/YggA  30.88 
 
 		 206 aa  94  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3404  lysine exporter protein LysE/YggA  29.41 
 
 		 211 aa  94  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3991  lysine exporter protein LysE/YggA  31.82 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1147  normal  0.39027 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  33.81 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  38.89 
 
 		 211 aa  94  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2977  amino acid transporter LysE  28.5 
 
 		 228 aa  92.8  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3581  lysine exporter protein LysE/YggA  32.16 
 
 		 222 aa  93.2  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4239  threonine efflux system  28.21 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.890135 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5915  LysE family transporter  32.46 
 
 		 204 aa  93.2  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.723016 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3644  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.02 
 
 		 204 aa  92.8  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0782  LysE family translocator protein  32.74 
 
 		 204 aa  92.4  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.492943  normal  0.203666 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3452  LysE family translocator protein  33.33 
 
 		 204 aa  92.8  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  28.64 
 
 		 206 aa  92.4  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3328  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.25 
 
 		 204 aa  92  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.740014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  28.64 
 
 		 206 aa  92  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  28.64 
 
 		 206 aa  92  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>