More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4189 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 212 aa  424  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1641  lysine exporter protein LysE/YggA  60.95 
 
 		 212 aa  260  8.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.950543  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0618  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  59.05 
 
 		 211 aa  248  6e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3404  lysine exporter protein LysE/YggA  51.92 
 
 		 211 aa  215  4e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  46.86 
 
 		 209 aa  193  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  45.41 
 
 		 209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1147  transporter, LysE family  44.93 
 
 		 210 aa  185  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0989  lysine exporter protein LysE/YggA  44.93 
 
 		 210 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3488  lysine exporter protein LysE/YggA  45.96 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3976  lysine exporter protein LysE/YggA  44.16 
 
 		 205 aa  169  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2059  lysine exporter protein LysE/YggA  40.1 
 
 		 211 aa  169  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7469  lysine exporter protein LysE/YggA  43.15 
 
 		 205 aa  165  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02071  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.75 
 
 		 208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0424528  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  42.93 
 
 		 205 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5674  lysine exporter protein LysE/YggA  41.62 
 
 		 205 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6038  lysine exporter protein LysE/YggA  41.62 
 
 		 205 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0936  lysine exporter protein LysE/YggA  41.41 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.950459  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  40.61 
 
 		 205 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  38.46 
 
 		 209 aa  159  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1814  lysine exporter protein LysE/YggA  41.18 
 
 		 205 aa  156  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000397951  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2939  lysine exporter protein LysE/YggA  40 
 
 		 214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3142  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.69 
 
 		 208 aa  149  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0269907  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2977  amino acid transporter LysE  36.36 
 
 		 228 aa  147  8e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1920  amino acid transporter LysE  39.39 
 
 		 212 aa  147  8e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1849  amino acid transporter LysE  39.39 
 
 		 212 aa  147  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0078  amino acid efflux protein  39.27 
 
 		 205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.38 
 
 		 205 aa  146  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5915  LysE family transporter  40.31 
 
 		 204 aa  145  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.723016 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1256  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.38 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5352  lysine exporter protein LysE/YggA  38.31 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4118  RhtB family transporter  38.05 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0699  amino acid transporter LysE  38.46 
 
 		 204 aa  141  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0691811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3675  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.57 
 
 		 212 aa  141  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06605  putative threonine efflux protein  36.95 
 
 		 203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  38.97 
 
 		 203 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.955446 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  38.46 
 
 		 204 aa  138  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2768  lysine exporter protein LysE/YggA  35.65 
 
 		 221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0009  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 245 aa  134  8e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0108149 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1219  hypothetical protein  35.87 
 
 		 219 aa  129  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3778  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.64 
 
 		 203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0490  lysine exporter protein LysE/YggA  35.64 
 
 		 203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3961  lysine exporter protein LysE/YggA  35.64 
 
 		 203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0531  lysine exporter protein LysE/YggA  36.63 
 
 		 203 aa  129  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  38.46 
 
 		 204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.824462  normal  0.397861 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.31 
 
 		 204 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1213  hypothetical protein  34.97 
 
 		 219 aa  126  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26160  hypothetical protein  38.58 
 
 		 204 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.519724  normal  0.19854 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.36 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3644  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.64 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0493  lysine exporter protein LysE/YggA  30.54 
 
 		 219 aa  122  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1435  amino acid transporter LysE  31.75 
 
 		 210 aa  122  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.410501  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1110  RhtB family transporter  34.54 
 
 		 209 aa  121  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0530  amino acid transporter LysE  34.34 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0717  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2230  hypothetical protein  36.55 
 
 		 204 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0596  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.18 
 
 		 230 aa  118  7.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1060  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.16 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.741251  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3581  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0111  hypothetical protein  29.06 
 
 		 215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0782  LysE family translocator protein  32.76 
 
 		 204 aa  112  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.492943  normal  0.203666 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29100  hypothetical protein  34.3 
 
 		 204 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136638 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3452  LysE family translocator protein  32.76 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00347  threonine efflux system  33.01 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3142  amino acid transporter LysE  28.43 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142315  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  28.92 
 
 		 222 aa  109  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3987  hypothetical protein  33.71 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0921  putative threonine efflux protein  30.92 
 
 		 205 aa  105  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002089  threonine efflux protein  32.83 
 
 		 223 aa  105  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1905  lysine exporter protein LysE/YggA  33 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2482  lysine exporter protein LysE/YggA  27.23 
 
 		 224 aa  103  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2069  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.82 
 
 		 213 aa  102  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  32.69 
 
 		 214 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  34.78 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  32.02 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43570  hypothetical protein  30.2 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.443465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  34.83 
 
 		 211 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  34.83 
 
 		 211 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  34.83 
 
 		 211 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3537  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.58 
 
 		 208 aa  99  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.575737  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  34.83 
 
 		 211 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  33.82 
 
 		 211 aa  98.6  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.82 
 
 		 211 aa  98.6  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3097  lysine exporter protein LysE/YggA  28.1 
 
 		 215 aa  98.6  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1757  lysine exporter protein LysE/YggA  26.73 
 
 		 214 aa  98.2  8e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.290271  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  34.83 
 
 		 211 aa  98.2  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2347  lysine exporter protein LysE/YggA  28.93 
 
 		 207 aa  97.1  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.83 
 
 		 218 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3536  lysine exporter protein LysE/YggA  29.6 
 
 		 234 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2461  lysine exporter protein LysE/YggA  29.27 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5396  lysine exporter protein LysE/YggA  32.46 
 
 		 212 aa  96.3  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.83 
 
 		 218 aa  96.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3556  lysine exporter protein LysE/YggA  31.94 
 
 		 212 aa  95.9  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.384892 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6693  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.21 
 
 		 190 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3653  hypothetical protein  30.2 
 
 		 213 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0765  threonine efflux protein, putative  28.91 
 
 		 234 aa  95.5  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5054  lysine exporter protein LysE/YggA  30.61 
 
 		 212 aa  95.5  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199833  normal  0.295211 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1550  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.88 
 
 		 225 aa  95.1  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  30.1 
 
 		 206 aa  94.7  9e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  30.58 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2658  lysine exporter protein LysE/YggA  29.8 
 
 		 204 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53678  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>