More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5396 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3556  lysine exporter protein LysE/YggA  99.53 
 
 		 212 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.384892 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5396  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 212 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5054  lysine exporter protein LysE/YggA  94.81 
 
 		 212 aa  393  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199833  normal  0.295211 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2460  lysine exporter protein LysE/YggA  94.33 
 
 		 212 aa  342  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4711  lysine exporter protein LysE/YggA  92.78 
 
 		 212 aa  339  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1218  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3652  lysine exporter protein LysE/YggA  92.78 
 
 		 212 aa  339  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3869  lysine exporter protein LysE/YggA  92.27 
 
 		 212 aa  337  9e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.61339 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6764  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  76.89 
 
 		 211 aa  328  4e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406386  normal  0.273065 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5524  lysine exporter protein LysE/YggA  78.77 
 
 		 212 aa  310  9e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0728137  normal  0.0390592 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2779  amino acid efflux pump, RhtB family protein  75.47 
 
 		 211 aa  310  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000004006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3712  lysine exporter protein LysE/YggA  52.66 
 
 		 211 aa  206  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1476  lysine exporter protein LysE/YggA  48.02 
 
 		 212 aa  187  7e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3537  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.73 
 
 		 208 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.575737  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4194  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  57.28 
 
 		 210 aa  181  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0468  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  52.74 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.521562  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4482  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  57.21 
 
 		 210 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5706  lysine exporter protein LysE/YggA  55.88 
 
 		 213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.128668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2542  lysine exporter protein LysE/YggA  45.03 
 
 		 206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.671872  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0289  RhtB family transporter  52.36 
 
 		 209 aa  162  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003257  threonine efflux protein  37.5 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6693  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.23 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0100  lysine exporter protein LysE/YggA  34.48 
 
 		 213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2239  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.39 
 
 		 204 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.678713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3976  lysine exporter protein LysE/YggA  35.71 
 
 		 205 aa  115  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0856  lysine exporter protein LysE/YggA  36.5 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.985682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6400  lysine exporter protein LysE/YggA  34.6 
 
 		 215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3097  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4239  threonine efflux system  33.16 
 
 		 206 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.890135 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4346  threonine efflux system  34.2 
 
 		 206 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.459932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4286  threonine efflux system  34.2 
 
 		 206 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.492935 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4167  threonine efflux system  34.2 
 
 		 206 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4188  threonine efflux system  34.2 
 
 		 206 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  32.11 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1050  lysine exporter protein LysE/YggA  37.23 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  32.11 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.613043 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  32.11 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  32.11 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  32.11 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  32.11 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  32.11 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  32.11 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  32.11 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2963  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 		 215 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7118  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.92 
 
 		 205 aa  105  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4978  lysine exporter protein LysE/YggA  36.26 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1792  putative LysE type translocator  39.27 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00860151  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  35.79 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  34.03 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2347  lysine exporter protein LysE/YggA  33.52 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  32.98 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  34.21 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3450  lysine exporter protein LysE/YggA  32.56 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5270  lysine exporter protein LysE/YggA  32.56 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27713  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3997  threonine efflux system  33.16 
 
 		 206 aa  99.4  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0556  threonine efflux system  33.16 
 
 		 206 aa  99.4  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7469  lysine exporter protein LysE/YggA  33.71 
 
 		 205 aa  99.8  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0219  threonine efflux system  33.16 
 
 		 206 aa  99.4  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5142  lysine exporter protein LysE/YggA  32.97 
 
 		 204 aa  99  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2343  RhtB family threonine efflux protein  38.62 
 
 		 204 aa  98.2  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  31.86 
 
 		 212 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2617  lysine exporter protein LysE/YggA  36.63 
 
 		 204 aa  97.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1018  lysine exporter protein LysE/YggA  38.62 
 
 		 204 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0776742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  30.6 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4153  threonine efflux system  34.74 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000179823  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3963  threonine efflux system  34.74 
 
 		 207 aa  97.1  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245678  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  34.66 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5674  lysine exporter protein LysE/YggA  32.57 
 
 		 205 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6038  lysine exporter protein LysE/YggA  32.57 
 
 		 205 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  31.89 
 
 		 214 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5115  lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.32 
 
 		 203 aa  94.7  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0721  amino acid efflux pump, RhtB family protein  30.2 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.914234  normal  0.346615 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2129  putative threonine efflux protein  29.81 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0246  LysE family translocator protein  29.81 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3387  putative threonine efflux protein  29.81 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3293  threonine efflux protein, putative  29.81 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0428  LysE type translocator  29.81 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0377494  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2959  putative threonine efflux protein  29.81 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  30.21 
 
 		 214 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0233  RhtB family transporter  30.2 
 
 		 209 aa  92.8  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  27.72 
 
 		 209 aa  91.7  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1071  putative RhtB protein  29.78 
 
 		 212 aa  90.5  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1435  amino acid transporter LysE  29.9 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.410501  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  30.98 
 
 		 209 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5915  LysE family transporter  31.37 
 
 		 204 aa  88.6  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.723016 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1147  transporter, LysE family  33.17 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1814  lysine exporter protein LysE/YggA  32.47 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000397951  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3113  lysine exporter protein LysE/YggA  29.24 
 
 		 209 aa  85.9  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.050755  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2431  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.27 
 
 		 209 aa  85.5  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5352  lysine exporter protein LysE/YggA  36.84 
 
 		 204 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  30.81 
 
 		 209 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0405  putative transport protein  30.39 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000145475 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2922  lysine exporter protein LysE/YggA  30.69 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3404  lysine exporter protein LysE/YggA  28.79 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0399  putative transport protein  31.52 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0459  putative transport protein  31.52 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321828 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2939  lysine exporter protein LysE/YggA  29.35 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0396  putative transport protein  31.52 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979225  hitchhiker  0.00000000000454708 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0417  putative transport protein  31.52 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1060  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.35 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.741251  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1227  lysine exporter protein LysE/YggA  31.58 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>