More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1227 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1227  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 207 aa  392  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3336  hypothetical protein  61.59 
 
 		 164 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0100  lysine exporter protein LysE/YggA  37.32 
 
 		 213 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3293  threonine efflux protein, putative  38.16 
 
 		 217 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0428  LysE type translocator  38.16 
 
 		 217 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0377494  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2959  putative threonine efflux protein  38.16 
 
 		 217 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0246  LysE family translocator protein  38.16 
 
 		 217 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2129  putative threonine efflux protein  38.16 
 
 		 217 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3097  lysine exporter protein LysE/YggA  36.59 
 
 		 215 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3387  putative threonine efflux protein  38.16 
 
 		 217 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6400  lysine exporter protein LysE/YggA  36.59 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0233  RhtB family transporter  40.1 
 
 		 209 aa  122  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2347  lysine exporter protein LysE/YggA  40.66 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003257  threonine efflux protein  32.52 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4978  lysine exporter protein LysE/YggA  39.49 
 
 		 207 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  34.65 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2542  lysine exporter protein LysE/YggA  34.03 
 
 		 206 aa  116  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.671872  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2963  lysine exporter protein LysE/YggA  34.15 
 
 		 215 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2239  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.45 
 
 		 204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.678713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  34.67 
 
 		 209 aa  108  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1147  transporter, LysE family  32.65 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  34.67 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  34.67 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2779  amino acid efflux pump, RhtB family protein  31.91 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000004006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6764  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.8 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406386  normal  0.273065 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5054  lysine exporter protein LysE/YggA  34.9 
 
 		 212 aa  105  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199833  normal  0.295211 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0989  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1920  amino acid transporter LysE  30.58 
 
 		 212 aa  104  9e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1849  amino acid transporter LysE  30.58 
 
 		 212 aa  104  9e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  31 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0721  amino acid efflux pump, RhtB family protein  35.83 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.914234  normal  0.346615 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7118  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.39 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0936  lysine exporter protein LysE/YggA  30.58 
 
 		 212 aa  102  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.950459  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6693  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.65 
 
 		 190 aa  102  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3712  lysine exporter protein LysE/YggA  34.69 
 
 		 211 aa  101  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4239  threonine efflux system  29.8 
 
 		 206 aa  101  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.890135 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  30.35 
 
 		 207 aa  101  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  29.7 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  29.7 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4346  threonine efflux system  29.8 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.459932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4286  threonine efflux system  29.8 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.492935 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4167  threonine efflux system  29.8 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  29.7 
 
 		 204 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  29.7 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  29.7 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  29.7 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4188  threonine efflux system  29.8 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  29.7 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  29.7 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  29.7 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  29.7 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.613043 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  30.2 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5270  lysine exporter protein LysE/YggA  37.74 
 
 		 204 aa  99.8  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27713  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0468  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.13 
 
 		 215 aa  99  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.521562  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1641  lysine exporter protein LysE/YggA  27.54 
 
 		 212 aa  99  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.950543  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5524  lysine exporter protein LysE/YggA  33.67 
 
 		 212 aa  98.6  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0728137  normal  0.0390592 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4153  threonine efflux system  30.35 
 
 		 207 aa  98.2  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000179823  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5115  lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.68 
 
 		 203 aa  98.2  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4711  lysine exporter protein LysE/YggA  33.7 
 
 		 212 aa  98.2  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1218  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5396  lysine exporter protein LysE/YggA  32.07 
 
 		 212 aa  98.2  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3652  lysine exporter protein LysE/YggA  33.7 
 
 		 212 aa  98.2  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3556  lysine exporter protein LysE/YggA  31.52 
 
 		 212 aa  97.8  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.384892 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3869  lysine exporter protein LysE/YggA  33.7 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.61339 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3450  lysine exporter protein LysE/YggA  37.11 
 
 		 204 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0234  LysE type translocator  32.82 
 
 		 173 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0377259  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  27.05 
 
 		 209 aa  96.7  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3963  threonine efflux system  30.35 
 
 		 207 aa  97.1  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245678  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1476  lysine exporter protein LysE/YggA  31.25 
 
 		 212 aa  96.7  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5142  lysine exporter protein LysE/YggA  34.59 
 
 		 204 aa  96.3  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2617  lysine exporter protein LysE/YggA  35.52 
 
 		 204 aa  95.9  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3997  threonine efflux system  30.24 
 
 		 206 aa  95.5  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2460  lysine exporter protein LysE/YggA  33.15 
 
 		 212 aa  95.1  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3976  lysine exporter protein LysE/YggA  29.19 
 
 		 205 aa  94.7  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2922  lysine exporter protein LysE/YggA  27.27 
 
 		 206 aa  94.7  9e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0556  threonine efflux system  30.24 
 
 		 206 aa  94.7  9e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0219  threonine efflux system  30.24 
 
 		 206 aa  94.7  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  28.85 
 
 		 212 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2431  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.72 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2768  lysine exporter protein LysE/YggA  28.77 
 
 		 221 aa  94  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3404  lysine exporter protein LysE/YggA  28.91 
 
 		 211 aa  93.2  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0289  RhtB family transporter  39.36 
 
 		 209 aa  92.4  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2939  lysine exporter protein LysE/YggA  29.67 
 
 		 214 aa  92  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1050  lysine exporter protein LysE/YggA  33.7 
 
 		 204 aa  90.5  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4194  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.11 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3488  lysine exporter protein LysE/YggA  28.28 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3644  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.81 
 
 		 204 aa  89  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4482  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.64 
 
 		 210 aa  89  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3142  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.44 
 
 		 208 aa  89  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0269907  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  33 
 
 		 222 aa  86.7  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7469  lysine exporter protein LysE/YggA  29.19 
 
 		 205 aa  87  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43570  hypothetical protein  33.33 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.443465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 204 aa  87  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30 
 
 		 213 aa  86.3  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295219  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3076  lysine exporter protein LysE/YggA  29.95 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0009  lysine exporter protein LysE/YggA  28.38 
 
 		 245 aa  85.5  5e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0108149 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5352  lysine exporter protein LysE/YggA  33.7 
 
 		 204 aa  85.1  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0618  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.44 
 
 		 211 aa  84.7  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4118  RhtB family transporter  26.44 
 
 		 213 aa  84.7  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3113  lysine exporter protein LysE/YggA  38.04 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.050755  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2833  amino acid transporter LysE  30.48 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.318432  normal  0.661514 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>