252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_0234 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_0234  LysE type translocator  100 
 
 
173 aa  341  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0377259  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0246  LysE family translocator protein  77.42 
 
 
217 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3293  threonine efflux protein, putative  77.42 
 
 
217 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0428  LysE type translocator  77.42 
 
 
217 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0377494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3387  putative threonine efflux protein  77.42 
 
 
217 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2959  putative threonine efflux protein  77.42 
 
 
217 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2129  putative threonine efflux protein  77.42 
 
 
217 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6400  lysine exporter protein LysE/YggA  64.35 
 
 
215 aa  257  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3097  lysine exporter protein LysE/YggA  64.19 
 
 
215 aa  256  9e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2963  lysine exporter protein LysE/YggA  62.79 
 
 
215 aa  249  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0100  lysine exporter protein LysE/YggA  55.71 
 
 
213 aa  209  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0212  threonine efflux protein, putative  94.9 
 
 
99 aa  169  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2347  lysine exporter protein LysE/YggA  37.32 
 
 
207 aa  114  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4978  lysine exporter protein LysE/YggA  37.98 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2239  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.81 
 
 
204 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.678713  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  31.03 
 
 
214 aa  100  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  31.03 
 
 
214 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5142  lysine exporter protein LysE/YggA  32.28 
 
 
204 aa  87.8  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5115  lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.24 
 
 
203 aa  85.9  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127177  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1227  lysine exporter protein LysE/YggA  40.59 
 
 
207 aa  84.7  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3113  lysine exporter protein LysE/YggA  32.24 
 
 
209 aa  82  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.050755  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0721  amino acid efflux pump, RhtB family protein  30.05 
 
 
205 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.914234  normal  0.346615 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  29.13 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  27.18 
 
 
206 aa  80.9  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4239  threonine efflux system  27.96 
 
 
206 aa  80.9  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.890135 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  27.18 
 
 
206 aa  80.9  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  27.18 
 
 
206 aa  80.9  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4167  threonine efflux system  27.96 
 
 
206 aa  80.9  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  27.18 
 
 
206 aa  80.9  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4346  threonine efflux system  27.96 
 
 
206 aa  80.9  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.459932  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4286  threonine efflux system  27.96 
 
 
206 aa  80.9  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.492935 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  29.13 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  29.13 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  27.09 
 
 
204 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.613043 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  27.09 
 
 
204 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4188  threonine efflux system  27.49 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0556  threonine efflux system  27.7 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0219  threonine efflux system  27.7 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1476  lysine exporter protein LysE/YggA  28.16 
 
 
212 aa  79  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3997  threonine efflux system  26.48 
 
 
206 aa  79  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  29.15 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003257  threonine efflux protein  26.96 
 
 
211 aa  79  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  26.19 
 
 
206 aa  79  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  29.06 
 
 
204 aa  79.3  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2617  lysine exporter protein LysE/YggA  29.1 
 
 
204 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1147  transporter, LysE family  28.5 
 
 
210 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0989  lysine exporter protein LysE/YggA  28 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3537  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.72 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.575737  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  26.42 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  26.09 
 
 
207 aa  73.9  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2542  lysine exporter protein LysE/YggA  27.72 
 
 
206 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.671872  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  27.72 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3336  hypothetical protein  41.12 
 
 
164 aa  73.9  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5270  lysine exporter protein LysE/YggA  30.99 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27713  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3450  lysine exporter protein LysE/YggA  30.99 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270784  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3712  lysine exporter protein LysE/YggA  27.5 
 
 
211 aa  71.6  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6764  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.04 
 
 
211 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406386  normal  0.273065 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4718  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.09 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.721084 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6693  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.47 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5054  lysine exporter protein LysE/YggA  27.27 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199833  normal  0.295211 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4153  threonine efflux system  26.89 
 
 
207 aa  68.2  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000179823  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3963  threonine efflux system  26.89 
 
 
207 aa  67.8  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245678  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2779  amino acid efflux pump, RhtB family protein  27.81 
 
 
211 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000004006  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  23.88 
 
 
222 aa  67.8  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1050  lysine exporter protein LysE/YggA  28.8 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0531  lysine exporter protein LysE/YggA  27 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1641  lysine exporter protein LysE/YggA  22.89 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.950543  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7118  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.91 
 
 
205 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1920  amino acid transporter LysE  21.63 
 
 
212 aa  64.3  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0530  amino acid transporter LysE  25.5 
 
 
203 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1849  amino acid transporter LysE  21.63 
 
 
212 aa  64.3  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0936  lysine exporter protein LysE/YggA  21.63 
 
 
212 aa  63.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.950459  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4711  lysine exporter protein LysE/YggA  36.67 
 
 
212 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1218  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3869  lysine exporter protein LysE/YggA  36.67 
 
 
212 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.61339 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3652  lysine exporter protein LysE/YggA  36.67 
 
 
212 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1018  lysine exporter protein LysE/YggA  37.38 
 
 
204 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0776742  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2343  RhtB family threonine efflux protein  37.38 
 
 
204 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3521  lysine exporter family protein (LysE/YggA)  36.17 
 
 
118 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.561475  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00347  threonine efflux system  22.49 
 
 
234 aa  62.4  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0289  RhtB family transporter  26.9 
 
 
209 aa  62  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2460  lysine exporter protein LysE/YggA  35.56 
 
 
212 aa  62  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1071  putative RhtB protein  25.52 
 
 
212 aa  62  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.96 
 
 
212 aa  61.6  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2381  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.68 
 
 
210 aa  61.6  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000868866  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5524  lysine exporter protein LysE/YggA  31.67 
 
 
212 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0728137  normal  0.0390592 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3556  lysine exporter protein LysE/YggA  25.41 
 
 
212 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.384892 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5915  LysE family transporter  28.43 
 
 
204 aa  61.2  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.723016 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5396  lysine exporter protein LysE/YggA  25.41 
 
 
212 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7385  putative threonine efflux protein  26.11 
 
 
216 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0325259  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2059  lysine exporter protein LysE/YggA  24.87 
 
 
211 aa  60.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4194  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.78 
 
 
210 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3976  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 
205 aa  59.7  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2482  lysine exporter protein LysE/YggA  20.67 
 
 
224 aa  59.3  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0233  RhtB family transporter  26.67 
 
 
209 aa  59.7  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0468  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29 
 
 
215 aa  58.9  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.521562  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4118  RhtB family transporter  21.53 
 
 
213 aa  58.9  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2939  lysine exporter protein LysE/YggA  20.38 
 
 
214 aa  58.2  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419308  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2431  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.98 
 
 
209 aa  58.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002089  threonine efflux protein  22.01 
 
 
223 aa  58.2  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1800  threonine efflux protein, putative  23.27 
 
 
212 aa  58.2  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>