More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3712 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3712  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 211 aa  395  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6764  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  56.04 
 
 		 211 aa  209  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406386  normal  0.273065 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5054  lysine exporter protein LysE/YggA  52.17 
 
 		 212 aa  204  9e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199833  normal  0.295211 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2779  amino acid efflux pump, RhtB family protein  55.21 
 
 		 211 aa  197  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000004006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5396  lysine exporter protein LysE/YggA  54.01 
 
 		 212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3556  lysine exporter protein LysE/YggA  53.48 
 
 		 212 aa  195  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.384892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1476  lysine exporter protein LysE/YggA  51.2 
 
 		 212 aa  187  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5706  lysine exporter protein LysE/YggA  61.61 
 
 		 213 aa  186  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.128668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5524  lysine exporter protein LysE/YggA  53.43 
 
 		 212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0728137  normal  0.0390592 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4194  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  56.1 
 
 		 210 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2460  lysine exporter protein LysE/YggA  53.48 
 
 		 212 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3869  lysine exporter protein LysE/YggA  53.48 
 
 		 212 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.61339 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3537  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.15 
 
 		 208 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.575737  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4711  lysine exporter protein LysE/YggA  53.48 
 
 		 212 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1218  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3652  lysine exporter protein LysE/YggA  53.48 
 
 		 212 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0468  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  52.68 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.521562  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0289  RhtB family transporter  52.72 
 
 		 209 aa  162  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4482  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  54.63 
 
 		 210 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003257  threonine efflux protein  38.21 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2542  lysine exporter protein LysE/YggA  40.29 
 
 		 206 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.671872  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  34.31 
 
 		 214 aa  117  9e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3097  lysine exporter protein LysE/YggA  36.36 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6400  lysine exporter protein LysE/YggA  35.1 
 
 		 215 aa  116  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0100  lysine exporter protein LysE/YggA  34.34 
 
 		 213 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 214 aa  112  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6693  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.82 
 
 		 190 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2963  lysine exporter protein LysE/YggA  35.1 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7118  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.5 
 
 		 205 aa  105  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3976  lysine exporter protein LysE/YggA  34 
 
 		 205 aa  99.4  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3293  threonine efflux protein, putative  32.86 
 
 		 217 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0246  LysE family translocator protein  32.86 
 
 		 217 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0428  LysE type translocator  32.86 
 
 		 217 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0377494  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2959  putative threonine efflux protein  32.86 
 
 		 217 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2129  putative threonine efflux protein  32.86 
 
 		 217 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3387  putative threonine efflux protein  32.86 
 
 		 217 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5142  lysine exporter protein LysE/YggA  33.51 
 
 		 204 aa  99.4  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0618  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.32 
 
 		 211 aa  98.6  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4978  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 		 207 aa  98.6  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2347  lysine exporter protein LysE/YggA  31.5 
 
 		 207 aa  97.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2239  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.83 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.678713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7469  lysine exporter protein LysE/YggA  34.95 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2617  lysine exporter protein LysE/YggA  33.87 
 
 		 204 aa  95.5  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1071  putative RhtB protein  31.46 
 
 		 212 aa  95.1  7e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1792  putative LysE type translocator  41.27 
 
 		 203 aa  94.7  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00860151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2431  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.47 
 
 		 209 aa  94  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1641  lysine exporter protein LysE/YggA  30.43 
 
 		 212 aa  94.7  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.950543  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  29.59 
 
 		 212 aa  94  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  32.64 
 
 		 208 aa  93.2  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  34.13 
 
 		 205 aa  92  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1050  lysine exporter protein LysE/YggA  33.68 
 
 		 204 aa  92  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0233  RhtB family transporter  27.75 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  29.84 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  29.84 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.613043 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  29.32 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  29.32 
 
 		 204 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  29.32 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  29.32 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  32.31 
 
 		 207 aa  89.7  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  29.32 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3113  lysine exporter protein LysE/YggA  38.04 
 
 		 209 aa  89.7  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.050755  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  29.32 
 
 		 204 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  29.32 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5270  lysine exporter protein LysE/YggA  32.95 
 
 		 204 aa  89  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27713  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3450  lysine exporter protein LysE/YggA  32.95 
 
 		 204 aa  88.6  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  29.84 
 
 		 206 aa  88.2  8e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1018  lysine exporter protein LysE/YggA  35.26 
 
 		 204 aa  88.2  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0776742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4239  threonine efflux system  28.27 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.890135 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2343  RhtB family threonine efflux protein  35.26 
 
 		 204 aa  87.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4188  threonine efflux system  28.27 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4346  threonine efflux system  28.27 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.459932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4286  threonine efflux system  28.27 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.492935 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5115  lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.1 
 
 		 203 aa  86.7  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5674  lysine exporter protein LysE/YggA  33.51 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4167  threonine efflux system  28.27 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6038  lysine exporter protein LysE/YggA  33.51 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00283  neutral amino-acid efflux system  31.37 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3278  homoserine/threonine efflux pump  31.37 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00287  hypothetical protein  31.37 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0394  putative homoserine/threonine efflux protein  31.37 
 
 		 222 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  32.35 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3296  homoserine/threonine efflux pump  31.37 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0352  putative homoserine/threonine efflux protein  31.37 
 
 		 215 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1227  lysine exporter protein LysE/YggA  34.69 
 
 		 207 aa  85.9  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0856  lysine exporter protein LysE/YggA  33.83 
 
 		 200 aa  85.9  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.985682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06605  putative threonine efflux protein  30.46 
 
 		 203 aa  85.5  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0399  putative homoserine/threonine efflux protein  30.88 
 
 		 223 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0359  putative homoserine/threonine efflux protein  30.88 
 
 		 210 aa  85.1  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.672304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0219  threonine efflux system  29.84 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3997  threonine efflux system  29.84 
 
 		 206 aa  84.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2768  lysine exporter protein LysE/YggA  28.08 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0556  threonine efflux system  29.84 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1814  lysine exporter protein LysE/YggA  32.51 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000397951  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  31.05 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  31.05 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0834  lysine exporter protein  27.23 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0107637  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0405  putative transport protein  28.24 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000145475 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1435  amino acid transporter LysE  28.23 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.410501  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5352  lysine exporter protein LysE/YggA  37.62 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0396  putative transport protein  29.44 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979225  hitchhiker  0.00000000000454708 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0459  putative transport protein  29.44 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321828 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>