More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003257 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003257  threonine efflux protein  100 
 
 		 211 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2542  lysine exporter protein LysE/YggA  47.87 
 
 		 206 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.671872  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0468  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.08 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.521562  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3712  lysine exporter protein LysE/YggA  38.21 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3537  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.77 
 
 		 208 aa  145  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.575737  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6764  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.45 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406386  normal  0.273065 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1476  lysine exporter protein LysE/YggA  37.63 
 
 		 212 aa  141  6e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2779  amino acid efflux pump, RhtB family protein  36.6 
 
 		 211 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000004006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5054  lysine exporter protein LysE/YggA  38.98 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199833  normal  0.295211 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5524  lysine exporter protein LysE/YggA  40.31 
 
 		 212 aa  128  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0728137  normal  0.0390592 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5396  lysine exporter protein LysE/YggA  37.21 
 
 		 212 aa  128  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3556  lysine exporter protein LysE/YggA  37.21 
 
 		 212 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.384892 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6400  lysine exporter protein LysE/YggA  35.58 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3097  lysine exporter protein LysE/YggA  34.13 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4711  lysine exporter protein LysE/YggA  38.95 
 
 		 212 aa  121  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1218  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3652  lysine exporter protein LysE/YggA  38.95 
 
 		 212 aa  121  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3869  lysine exporter protein LysE/YggA  38.95 
 
 		 212 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.61339 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4194  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.27 
 
 		 210 aa  117  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2460  lysine exporter protein LysE/YggA  38.37 
 
 		 212 aa  117  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2963  lysine exporter protein LysE/YggA  32.21 
 
 		 215 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4482  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.74 
 
 		 210 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  33.33 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3293  threonine efflux protein, putative  30.95 
 
 		 217 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3387  putative threonine efflux protein  30.95 
 
 		 217 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0428  LysE type translocator  30.95 
 
 		 217 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0377494  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0246  LysE family translocator protein  30.95 
 
 		 217 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2129  putative threonine efflux protein  30.95 
 
 		 217 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2959  putative threonine efflux protein  30.95 
 
 		 217 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0289  RhtB family transporter  38.71 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5706  lysine exporter protein LysE/YggA  35.71 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.128668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0556  threonine efflux system  30.85 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0219  threonine efflux system  30.85 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6693  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.85 
 
 		 190 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1050  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 204 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  31.72 
 
 		 214 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3997  threonine efflux system  30.35 
 
 		 206 aa  105  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  33.17 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  33.17 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.613043 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  33.17 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  33.17 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  32.16 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  33.17 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  33.17 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  33.17 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  33.17 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  32.18 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  32.68 
 
 		 204 aa  102  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0100  lysine exporter protein LysE/YggA  26.29 
 
 		 213 aa  102  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4718  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.2 
 
 		 206 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.721084 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3963  threonine efflux system  33.33 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245678  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  29.85 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4153  threonine efflux system  33.33 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000179823  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0233  RhtB family transporter  29.79 
 
 		 209 aa  99.8  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  28.43 
 
 		 214 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4239  threonine efflux system  28.86 
 
 		 206 aa  98.2  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.890135 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4188  threonine efflux system  29.44 
 
 		 206 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4346  threonine efflux system  28.86 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.459932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4167  threonine efflux system  28.86 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4286  threonine efflux system  28.86 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.492935 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3113  lysine exporter protein LysE/YggA  32.98 
 
 		 209 aa  96.7  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.050755  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1227  lysine exporter protein LysE/YggA  31.77 
 
 		 207 aa  96.3  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2239  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.82 
 
 		 204 aa  96.3  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.678713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0856  lysine exporter protein LysE/YggA  29.12 
 
 		 200 aa  91.7  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.985682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5142  lysine exporter protein LysE/YggA  30.16 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2343  RhtB family threonine efflux protein  32.11 
 
 		 204 aa  88.6  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2922  lysine exporter protein LysE/YggA  26.73 
 
 		 206 aa  88.6  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1018  lysine exporter protein LysE/YggA  32.11 
 
 		 204 aa  88.6  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0776742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  25.91 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1641  lysine exporter protein LysE/YggA  27.32 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.950543  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1792  putative LysE type translocator  31.44 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00860151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0009  lysine exporter protein LysE/YggA  28.51 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0108149 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2617  lysine exporter protein LysE/YggA  29.26 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0721  amino acid efflux pump, RhtB family protein  27.32 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.914234  normal  0.346615 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3987  hypothetical protein  30.21 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0493  lysine exporter protein LysE/YggA  25.13 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0418  lysine exporter protein LysE/YggA  29.27 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7118  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.8 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3404  lysine exporter protein LysE/YggA  28.26 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0234  LysE type translocator  26.96 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0377259  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5115  lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.83 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127177  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1435  amino acid transporter LysE  27.98 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.410501  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3336  hypothetical protein  34.27 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3653  hypothetical protein  25.25 
 
 		 213 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29100  hypothetical protein  28.65 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136638 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2482  lysine exporter protein LysE/YggA  25.5 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3142  amino acid transporter LysE  27.27 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142315  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0618  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.7 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3076  lysine exporter protein LysE/YggA  29.9 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2347  lysine exporter protein LysE/YggA  28.72 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0834  lysine exporter protein  27.46 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0107637  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43570  hypothetical protein  25 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.443465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0391  hypothetical protein  27.37 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2431  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.95 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1219  hypothetical protein  25 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0936  lysine exporter protein LysE/YggA  28.44 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.950459  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.21 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3328  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.27 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.740014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0890  lysine exporter protein LysE/YggA  26.77 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3132  lysine exporter protein LysE/YggA  26.77 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0792555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3224  lysine exporter protein LysE/YggA  26.77 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>