More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2617 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2617  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
204 aa  388  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5270  lysine exporter protein LysE/YggA  85.71 
 
 
204 aa  297  6e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27713  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3450  lysine exporter protein LysE/YggA  85.71 
 
 
204 aa  296  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270784  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5142  lysine exporter protein LysE/YggA  79.14 
 
 
204 aa  289  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5115  lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  73 
 
 
203 aa  262  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127177  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2239  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  53.04 
 
 
204 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.678713  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3521  lysine exporter family protein (LysE/YggA)  84.54 
 
 
118 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.561475  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4978  lysine exporter protein LysE/YggA  44.15 
 
 
207 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2347  lysine exporter protein LysE/YggA  41.15 
 
 
207 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6400  lysine exporter protein LysE/YggA  35.05 
 
 
215 aa  129  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3097  lysine exporter protein LysE/YggA  34.58 
 
 
215 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  36.5 
 
 
214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  36.55 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2129  putative threonine efflux protein  34.58 
 
 
217 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0246  LysE family translocator protein  34.58 
 
 
217 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3293  threonine efflux protein, putative  34.58 
 
 
217 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0428  LysE type translocator  34.58 
 
 
217 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0377494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3387  putative threonine efflux protein  34.58 
 
 
217 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2959  putative threonine efflux protein  34.58 
 
 
217 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0100  lysine exporter protein LysE/YggA  34.88 
 
 
213 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2963  lysine exporter protein LysE/YggA  33.64 
 
 
215 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6764  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.59 
 
 
211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406386  normal  0.273065 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3556  lysine exporter protein LysE/YggA  36.63 
 
 
212 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.384892 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5396  lysine exporter protein LysE/YggA  36.63 
 
 
212 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.71 
 
 
212 aa  109  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3712  lysine exporter protein LysE/YggA  34.67 
 
 
211 aa  108  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  32.68 
 
 
206 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  32.68 
 
 
206 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  32.68 
 
 
206 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  32.68 
 
 
206 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  32.68 
 
 
206 aa  108  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  32.68 
 
 
206 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  32.67 
 
 
204 aa  107  9.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  32.67 
 
 
204 aa  107  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.613043 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  32.18 
 
 
204 aa  106  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1476  lysine exporter protein LysE/YggA  35.16 
 
 
212 aa  105  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4239  threonine efflux system  32.21 
 
 
206 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.890135 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5054  lysine exporter protein LysE/YggA  34.55 
 
 
212 aa  104  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199833  normal  0.295211 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4286  threonine efflux system  32.21 
 
 
206 aa  104  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.492935 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4346  threonine efflux system  32.21 
 
 
206 aa  104  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.459932  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4167  threonine efflux system  32.21 
 
 
206 aa  104  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4188  threonine efflux system  32.2 
 
 
206 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  30.92 
 
 
208 aa  104  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0721  amino acid efflux pump, RhtB family protein  34.3 
 
 
205 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.914234  normal  0.346615 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5915  LysE family transporter  35.35 
 
 
204 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.723016 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  32.68 
 
 
206 aa  102  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2460  lysine exporter protein LysE/YggA  36.63 
 
 
212 aa  102  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2779  amino acid efflux pump, RhtB family protein  36.17 
 
 
211 aa  101  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000004006  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7469  lysine exporter protein LysE/YggA  33.85 
 
 
205 aa  101  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  31.28 
 
 
206 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4711  lysine exporter protein LysE/YggA  36.05 
 
 
212 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1218  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3869  lysine exporter protein LysE/YggA  36.05 
 
 
212 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.61339 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3652  lysine exporter protein LysE/YggA  36.05 
 
 
212 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7118  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 
205 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0556  threonine efflux system  28.85 
 
 
206 aa  97.4  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0219  threonine efflux system  28.85 
 
 
206 aa  97.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1435  amino acid transporter LysE  28.43 
 
 
210 aa  97.1  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.410501  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0468  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.19 
 
 
215 aa  97.1  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.521562  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3997  threonine efflux system  28.85 
 
 
206 aa  97.1  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06605  putative threonine efflux protein  31.61 
 
 
203 aa  96.3  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3976  lysine exporter protein LysE/YggA  33.87 
 
 
205 aa  96.7  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5352  lysine exporter protein LysE/YggA  36.26 
 
 
204 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5674  lysine exporter protein LysE/YggA  34.43 
 
 
205 aa  95.5  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
205 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6038  lysine exporter protein LysE/YggA  34.43 
 
 
205 aa  95.5  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7385  putative threonine efflux protein  36.71 
 
 
216 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0325259  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  30.62 
 
 
207 aa  93.2  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4153  threonine efflux system  32.06 
 
 
207 aa  93.2  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000179823  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  32.98 
 
 
205 aa  93.2  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003257  threonine efflux protein  31.22 
 
 
211 aa  92.8  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6693  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.09 
 
 
190 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5524  lysine exporter protein LysE/YggA  33.51 
 
 
212 aa  92  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0728137  normal  0.0390592 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2542  lysine exporter protein LysE/YggA  32.8 
 
 
206 aa  92  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.671872  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3963  threonine efflux system  32.06 
 
 
207 aa  91.7  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245678  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0418  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
213 aa  91.7  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2431  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.51 
 
 
209 aa  91.3  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2230  hypothetical protein  34.18 
 
 
204 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0234  LysE type translocator  32.18 
 
 
173 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0377259  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  32.2 
 
 
209 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1814  lysine exporter protein LysE/YggA  31.63 
 
 
205 aa  89.4  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000397951  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26160  hypothetical protein  34.67 
 
 
204 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.519724  normal  0.19854 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2828  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 
202 aa  88.2  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192947  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00283  neutral amino-acid efflux system  29.82 
 
 
223 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3278  homoserine/threonine efflux pump  29.82 
 
 
223 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00287  hypothetical protein  29.82 
 
 
223 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3296  homoserine/threonine efflux pump  29.82 
 
 
223 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0352  putative homoserine/threonine efflux protein  29.82 
 
 
215 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0394  putative homoserine/threonine efflux protein  29.82 
 
 
222 aa  87  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3998  hypothetical protein  86.54 
 
 
64 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0739508 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0399  putative homoserine/threonine efflux protein  29.82 
 
 
223 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0359  putative homoserine/threonine efflux protein  29.82 
 
 
210 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.672304  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3644  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.57 
 
 
204 aa  85.9  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1147  transporter, LysE family  31.9 
 
 
210 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.29 
 
 
204 aa  84.7  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1227  lysine exporter protein LysE/YggA  34.04 
 
 
207 aa  84  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0233  RhtB family transporter  28.71 
 
 
209 aa  84  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0396  putative transport protein  31.18 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979225  hitchhiker  0.00000000000454708 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0459  putative transport protein  31.18 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000321828 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0417  putative transport protein  31.18 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0399  putative transport protein  31.18 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>