More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_7385 on replicon NC_007490
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007490  RSP_7385  putative threonine efflux protein  100 
 
 		 216 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0325259  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3097  lysine exporter protein LysE/YggA  33.01 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2239  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.65 
 
 		 204 aa  98.2  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.678713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6400  lysine exporter protein LysE/YggA  32.52 
 
 		 215 aa  96.3  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3450  lysine exporter protein LysE/YggA  39.13 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5142  lysine exporter protein LysE/YggA  38.04 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5270  lysine exporter protein LysE/YggA  39.13 
 
 		 204 aa  92.8  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27713  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3293  threonine efflux protein, putative  32.21 
 
 		 217 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0428  LysE type translocator  32.21 
 
 		 217 aa  90.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0377494  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0246  LysE family translocator protein  32.21 
 
 		 217 aa  90.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2959  putative threonine efflux protein  32.21 
 
 		 217 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2129  putative threonine efflux protein  32.21 
 
 		 217 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2963  lysine exporter protein LysE/YggA  32.04 
 
 		 215 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3387  putative threonine efflux protein  32.21 
 
 		 217 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3653  hypothetical protein  36.48 
 
 		 213 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2617  lysine exporter protein LysE/YggA  36.36 
 
 		 204 aa  89.4  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  31.75 
 
 		 222 aa  88.6  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43570  hypothetical protein  33.84 
 
 		 213 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.443465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0100  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 		 213 aa  88.2  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  31.11 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1800  threonine efflux protein, putative  30.84 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.16 
 
 		 204 aa  86.7  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0857  lysine exporter protein LysE/YggA  33.9 
 
 		 213 aa  85.9  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.154499  normal  0.0418461 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2482  lysine exporter protein LysE/YggA  27.4 
 
 		 224 aa  85.9  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3407  lysine exporter protein LysE/YggA  34.78 
 
 		 210 aa  85.5  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  29.84 
 
 		 208 aa  85.1  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.68 
 
 		 212 aa  84.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5115  lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.15 
 
 		 203 aa  84.7  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0418  lysine exporter protein LysE/YggA  34.25 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0721  amino acid efflux pump, RhtB family protein  32.96 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.914234  normal  0.346615 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4239  threonine efflux system  30.98 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.890135 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  36.54 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  30.17 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2796  lysine exporter protein LysE/YggA  29.76 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4167  threonine efflux system  30.98 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  29.61 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4346  threonine efflux system  30.98 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.459932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4188  threonine efflux system  30.98 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4286  threonine efflux system  30.98 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.492935 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5239  lysine exporter protein LysE/YggA  34.24 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1641  lysine exporter protein LysE/YggA  31.03 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.950543  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  36.54 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  36.54 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1476  lysine exporter protein LysE/YggA  36.11 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  36.31 
 
 		 227 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  29.83 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  29.83 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  29.03 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  29.03 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1060  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.25 
 
 		 209 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.741251  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  29.83 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.613043 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  29.83 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  29.83 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  30.43 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  29.03 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  29.83 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2465  lysine exporter protein LysE/YggA  40.3 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.19798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  38.52 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4978  lysine exporter protein LysE/YggA  30.98 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4336  RhtB family transporter  35.84 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2461  lysine exporter protein LysE/YggA  30.35 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2431  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.54 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0912  lysine exporter protein LysE/YggA  31.41 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1462  lysine exporter protein LysE/YggA  32 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0078  amino acid efflux protein  32.65 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  32.14 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3997  threonine efflux system  27.66 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  29.28 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0219  threonine efflux system  27.66 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0556  threonine efflux system  27.66 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5915  LysE family transporter  32.89 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.723016 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  32.87 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1050  lysine exporter protein LysE/YggA  35.11 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4153  threonine efflux system  31.11 
 
 		 207 aa  78.2  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000179823  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1998  amino acid efflux pump, RhtB family protein  37.34 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457454  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00347  threonine efflux system  30.37 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3963  threonine efflux system  30.56 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245678  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1435  amino acid transporter LysE  28.57 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.410501  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6693  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.51 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000550  putative threonine efflux protein  29.17 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0596  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.13 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2347  lysine exporter protein LysE/YggA  29.35 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  27.37 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  36.31 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  36.51 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0856  lysine exporter protein LysE/YggA  29.88 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.985682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4074  RhtB family transporter  36.88 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.472652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  37.7 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.51 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  37.7 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14510  putative threonine efflux protein  34.62 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.93793  normal  0.0749541 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1219  hypothetical protein  27.7 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1213  hypothetical protein  27.7 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  36.77 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  36.89 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2542  lysine exporter protein LysE/YggA  33.57 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.671872  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7118  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.73 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5054  lysine exporter protein LysE/YggA  32.39 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199833  normal  0.295211 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  34.62 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2456  lysine exporter protein LysE/YggA  32.86 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010294  normal  0.35895 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>