More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0418 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0418  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
213 aa  413  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4166  lysine exporter protein LysE/YggA  47.55 
 
 
212 aa  168  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal  0.273019 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3295  lysine exporter protein LysE/YggA  45.59 
 
 
213 aa  159  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5077  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.44 
 
 
208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128072  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5879  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.89 
 
 
212 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2075  amino acid efflux pump, RhtB family protein  39.9 
 
 
212 aa  141  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400632  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4336  RhtB family transporter  42.93 
 
 
212 aa  141  7e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2794  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.24 
 
 
204 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.940238  normal  0.870805 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0857  lysine exporter protein LysE/YggA  44.32 
 
 
213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.154499  normal  0.0418461 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5239  lysine exporter protein LysE/YggA  39.42 
 
 
210 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446466  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6091  lysine exporter protein LysE/YggA  42.5 
 
 
209 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0972486  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1986  lysine exporter protein LysE/YggA  42.5 
 
 
209 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3407  lysine exporter protein LysE/YggA  38.94 
 
 
210 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2697  lysine exporter protein LysE/YggA  39.42 
 
 
210 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4060  lysine exporter protein LysE/YggA  39.71 
 
 
210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3461  lysine exporter protein LysE/YggA  40.59 
 
 
210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2845  hypothetical protein  35.89 
 
 
209 aa  122  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.85185  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3132  lysine exporter protein LysE/YggA  39.11 
 
 
212 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0858  lysine exporter protein LysE/YggA  34.92 
 
 
211 aa  102  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.74992  normal  0.0747821 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0405  putative transport protein  32.18 
 
 
210 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000145475 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0417  putative transport protein  32.18 
 
 
210 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0399  putative transport protein  32.18 
 
 
210 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0396  putative transport protein  32.18 
 
 
210 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979225  hitchhiker  0.00000000000454708 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0459  putative transport protein  32.18 
 
 
210 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000321828 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0912  lysine exporter protein LysE/YggA  35.86 
 
 
213 aa  98.6  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3278  homoserine/threonine efflux pump  30.24 
 
 
223 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0399  putative homoserine/threonine efflux protein  30.24 
 
 
223 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00283  neutral amino-acid efflux system  30.24 
 
 
223 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0352  putative homoserine/threonine efflux protein  30.24 
 
 
215 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0394  putative homoserine/threonine efflux protein  29.76 
 
 
222 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0359  putative homoserine/threonine efflux protein  29.76 
 
 
210 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.672304  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00287  hypothetical protein  30.24 
 
 
223 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3296  homoserine/threonine efflux pump  30.24 
 
 
223 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2239  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.12 
 
 
204 aa  95.1  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.678713  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  34.18 
 
 
214 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4978  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
207 aa  94  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  33.67 
 
 
214 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2347  lysine exporter protein LysE/YggA  32.86 
 
 
207 aa  89.4  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0519  lysine exporter protein LysE/YggA  44.1 
 
 
198 aa  87.8  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  31.84 
 
 
207 aa  87  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3097  lysine exporter protein LysE/YggA  29.58 
 
 
215 aa  85.1  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0100  lysine exporter protein LysE/YggA  31.1 
 
 
213 aa  85.1  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  33.17 
 
 
206 aa  84.7  8e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2617  lysine exporter protein LysE/YggA  32.81 
 
 
204 aa  84.7  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7385  putative threonine efflux protein  34.25 
 
 
216 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0325259  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6400  lysine exporter protein LysE/YggA  30.05 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5142  lysine exporter protein LysE/YggA  33.85 
 
 
204 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3450  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
204 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270784  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4346  threonine efflux system  31.19 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.459932  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4188  threonine efflux system  31.19 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4286  threonine efflux system  31.19 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.492935 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5115  lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.65 
 
 
203 aa  82.8  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127177  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4167  threonine efflux system  31.19 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  31 
 
 
208 aa  82.8  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0219  threonine efflux system  29.95 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0556  threonine efflux system  29.95 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5270  lysine exporter protein LysE/YggA  32.73 
 
 
204 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27713  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3997  threonine efflux system  29.95 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0009  lysine exporter protein LysE/YggA  27.54 
 
 
245 aa  81.3  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0108149 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4239  threonine efflux system  30.2 
 
 
206 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.890135 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003257  threonine efflux protein  29.27 
 
 
211 aa  79.7  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  30.2 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  30.2 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  30.2 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  30.2 
 
 
204 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.613043 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  30.2 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  30.2 
 
 
204 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  30.2 
 
 
206 aa  79  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  30.2 
 
 
206 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  30.2 
 
 
204 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  29.71 
 
 
209 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2963  lysine exporter protein LysE/YggA  29.11 
 
 
215 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2542  lysine exporter protein LysE/YggA  30.41 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.671872  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5054  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 
212 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199833  normal  0.295211 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  31.34 
 
 
206 aa  77.8  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3556  lysine exporter protein LysE/YggA  28.95 
 
 
212 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.384892 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2922  lysine exporter protein LysE/YggA  37.5 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5396  lysine exporter protein LysE/YggA  28.95 
 
 
212 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3293  threonine efflux protein, putative  29.44 
 
 
217 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3387  putative threonine efflux protein  29.44 
 
 
217 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0428  LysE type translocator  29.44 
 
 
217 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0377494  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0246  LysE family translocator protein  29.44 
 
 
217 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2129  putative threonine efflux protein  29.44 
 
 
217 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2959  putative threonine efflux protein  29.44 
 
 
217 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1476  lysine exporter protein LysE/YggA  29.29 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6764  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.08 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406386  normal  0.273065 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3963  threonine efflux system  32.5 
 
 
207 aa  74.3  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245678  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3869  lysine exporter protein LysE/YggA  29.47 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.61339 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4153  threonine efflux system  32 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000179823  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4718  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.28 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.721084 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4711  lysine exporter protein LysE/YggA  28.95 
 
 
212 aa  72  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1218  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3652  lysine exporter protein LysE/YggA  28.95 
 
 
212 aa  72  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1421  lysine exporter protein LysE/YggA  31.63 
 
 
207 aa  72  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2779  amino acid efflux pump, RhtB family protein  28.19 
 
 
211 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000004006  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1343  LysE family translocator protein  34.98 
 
 
210 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5524  lysine exporter protein LysE/YggA  31.47 
 
 
212 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0728137  normal  0.0390592 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  32.02 
 
 
208 aa  70.9  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0051  amino acid transporter LysE  30.16 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.67 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43570  hypothetical protein  35.82 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.443465  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>